CuGenDBv2

Gene ID	Carg05183
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	Carg_Chr07:3363742..3364200
RNA-Seq Expression	Carg05183
Synteny	Carg05183
Gene Ontology terms	GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6604946.1 hypothetical protein SDJN03_02263, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_022947464.1 uncharacterized protein LOC111451320 [Cucurbita moschata]

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XP_022971121.1 uncharacterized protein LOC111469888 [Cucurbita maxima]

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A0A6J1CXM4 uncharacterized protein LOC111015379

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A0A6J1FU56 uncharacterized protein LOC111448454

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A0A6J1G6W3 uncharacterized protein LOC111451320

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A0A6J1I2F7 uncharacterized protein LOC111469888

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A0A6J1JD52 uncharacterized protein LOC111483951

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

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AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

8.9e-33

54.86

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        R +E+++KYGKVA+GVHFSVS  SI+G Y+AIKNNVDVESLL+K  +  FSSK+ P  +PS      + G V  +                 N+T +LA 
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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ATGGCTTTCTTCACCGGTGGTGGCCGATTCCGCGAGCTTCTCAGGAAGTACGGGAAGGTCGCAATCGGAGTTCATTTCTCAGTGTCGGCGGCTTCGATCACTGGCCTCTA
TGTCGCCATCAAGAACAATGTCGATGTAGAATCGCTACTCGATAAGCTACACATGGACGGATTCTCTTCCAAAGATACGCCACAGACAAGTCCCTCCGAAATCACATCGT
CCGTAGACGATGGATTTGTGATCGAAGAAAGACCTACATCAGGAATTCAATCAACCGTAATGGAAGAGCCGCGGAAAAGGAATCGTACAGCCGAGCTCGCAGCGTCGACT
GGCGGCGCGTTGGCTTTGGCCGTGCTTTGCAACAAGGCATTGTTGCCGATTCGGGTTCCGATCACGATTGCGCTCACACCGCCGATCGCGAGGCTGCTGGCGAGGCGAGG
AATTATGAGAAGTGGTTAA

mRNA sequence

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Protein sequence

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GGALALAVLCNKALLPIRVPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

Carg05183 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome