; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg05414 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg05414
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTranscription repressor
Genome locationCarg_Chr17:1272958..1275328
RNA-Seq ExpressionCarg05414
SyntenyCarg05414
Gene Ontology termsGO:0045892 - negative regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR006458 - Ovate protein family, C-terminal
IPR038933 - Ovate protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574979.1 Transcription repressor OFP12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.3e-96100Show/hide
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KAG7013551.1 Transcription repressor OFP12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.1e-104100Show/hide
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XP_022959494.1 transcription repressor OFP12-like [Cucurbita moschata]4.5e-9598.4Show/hide
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XP_023006330.1 transcription repressor OFP12-like [Cucurbita maxima]2.5e-9396.28Show/hide
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XP_023549131.1 transcription repressor OFP12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-9699.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3Z6 Transcription repressor2.2e-6374.36Show/hide
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        MSN +FL + +  FSKLKFSPP  V  +H+P SDCYFTSNPIS T +   DD FFSTSSDADDSISDDLA LLASRRFFFSSPGRSNSI + S+  RR  
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         HDV+VSEG  + KYSMDPYADFRRSMQEMVEARELE VRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIV+AF+DL+L LL SSS  P  A  ARRK V
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A0A1S3BH53 Transcription repressor8.1e-5873.56Show/hide
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        S P   +H+P SDCYFTSNPIS T +    D FFSTSSDADDSISDDLA +L+SRRFFFSSPGRSNSI + S+  R  + HDVVVSEG ++ KYSMDPYA
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        DFRRSMQEMVEARELE VRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIV+AF+DL+L LL SSS+ P  A   RRK V
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A0A2I4G8Z1 Transcription repressor7.4e-3548.31Show/hide
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        MSN F K FH  FSKLK  P      +P +    TS  IS TP S+                  FFS+S D+D + S  D  T+ AS RFFF SPGRSNS
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Query:  ICDSSTARRRSHDVVVSEGLEVPKYSMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLTSSSSAPPSAPKA
        I +S  A +   + +V   ++VPKYS+DPY DFRRSMQEM EAR L  V  + E+L ELL CYL LNPK+TH++I+RAFADL++C+L+SSSS   SA   
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Query:  RRKDVER
         R+   R
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A0A6J1H878 Transcription repressor2.2e-9598.4Show/hide
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A0A6J1KZU4 Transcription repressor1.2e-9396.28Show/hide
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        EGLEVPKYSMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLTSSSS PPSAPKARRK V
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4I8R6 Transcription repressor OFP127.7e-2146.06Show/hide
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        + S P      PSS    +++  + + SS A  DD      +  DDS   DL  +LASRRFFFSSPG SNSI DS   R R ++D    +++ G  V  Y
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Query:  --SMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLT
          S DPY DFRRSMQEM++A          EFL ELL  YL LN  +THKFI+RAFAD+L+ LL+
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O23341 Transcription repressor OFP111.7e-1551.92Show/hide
Query:  FSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVSEGLEVPKY--SMDPYADFRRSMQEMVEAREL-ESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLT
        FS+  R     D +T    S   ++S G  + K+  S DPY DF RSM+EMVEAR+L   V +D E+L ELL CYL LNPK+TH+FIV AFAD LL LL+
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Query:  SSSS
         S S
Subjt:  SSSS

Q9SJ45 Transcription repressor OFP151.7e-1239.17Show/hide
Query:  DSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVSEGLEV-PKYSMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHK
        DS+ + +  L +S R  F S G +NSI + +T++R   D    EG  +    S DPY+DF+RSM+EMVEA  L     D + L +LL  +L++N K +H+
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Query:  FIVRAFADLLLCLLTSSSSA
        +I  AF DLL+ L   +  A
Subjt:  FIVRAFADLLLCLLTSSSSA

Q9SKY9 Transcription repressor OFP164.6e-1837.7Show/hide
Query:  HSPSSDCYFTSNPISLTPSSLADDGFFSTSSDADDSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHD---------------------------
        H P       S+  + TP++ +     S++S  +  IS D++   ASRRFFFSSPGRSN+I DS   R R                              
Subjt:  HSPSSDCYFTSNPISLTPSSLADDGFFSTSSDADDSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHD---------------------------

Query:  -VVVSEGLEVPKY--SMDPYADFRRSMQEMVEAR----ELESVRSDS-EFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLT
          ++S G  V ++  S DP  DFRRSMQEM++A     EL    +D  +FL ELL  YL LNP +THKF++RAF+D+L+ LL+
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Q9SVD5 Transcription repressor OFP183.0e-0932.24Show/hide
Query:  HFSKLK-FSPPAAVAHSPSSDCYFTSNP---ISLTPSSLADDGFFSTSSDAD-----DSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVS
        H   LK  S  A+   +   D Y    P    S +PSS +   F STS   +     +SI + +  L +S+R  F   G SNSI + +T +R  H+    
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Query:  EGLEVPKYSMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLTSSSSAPPSAPKA
          + +   S DPY DF+ SM++MVE   L     D   L +LL  +L++N K +H++I  AF DL+L L    S      P +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05420.1 ovate family protein 125.4e-2246.06Show/hide
Query:  KFSPPAAVAHSPSSDCYFTSNPISLTPSSLA--DDGFFSTSSDADDSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTAR-RRSHDV---VVSEGLEVPKY
        + S P      PSS    +++  + + SS A  DD      +  DDS   DL  +LASRRFFFSSPG SNSI DS   R R ++D    +++ G  V  Y
Subjt:  KFSPPAAVAHSPSSDCYFTSNPISLTPSSLA--DDGFFSTSSDADDSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTAR-RRSHDV---VVSEGLEVPKY

Query:  --SMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLT
          S DPY DFRRSMQEM++A          EFL ELL  YL LN  +THKFI+RAFAD+L+ LL+
Subjt:  --SMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLT

AT2G32100.1 ovate family protein 163.3e-1937.7Show/hide
Query:  HSPSSDCYFTSNPISLTPSSLADDGFFSTSSDADDSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHD---------------------------
        H P       S+  + TP++ +     S++S  +  IS D++   ASRRFFFSSPGRSN+I DS   R R                              
Subjt:  HSPSSDCYFTSNPISLTPSSLADDGFFSTSSDADDSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHD---------------------------

Query:  -VVVSEGLEVPKY--SMDPYADFRRSMQEMVEAR----ELESVRSDS-EFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLT
          ++S G  V ++  S DP  DFRRSMQEM++A     EL    +D  +FL ELL  YL LNP +THKF++RAF+D+L+ LL+
Subjt:  -VVVSEGLEVPKY--SMDPYADFRRSMQEMVEAR----ELESVRSDS-EFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLT

AT2G36050.1 ovate family protein 151.2e-1339.17Show/hide
Query:  DSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVSEGLEV-PKYSMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHK
        DS+ + +  L +S R  F S G +NSI + +T++R   D    EG  +    S DPY+DF+RSM+EMVEA  L     D + L +LL  +L++N K +H+
Subjt:  DSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVSEGLEV-PKYSMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHK

Query:  FIVRAFADLLLCLLTSSSSA
        +I  AF DLL+ L   +  A
Subjt:  FIVRAFADLLLCLLTSSSSA

AT3G52540.1 ovate family protein 182.1e-1032.24Show/hide
Query:  HFSKLK-FSPPAAVAHSPSSDCYFTSNP---ISLTPSSLADDGFFSTSSDAD-----DSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVS
        H   LK  S  A+   +   D Y    P    S +PSS +   F STS   +     +SI + +  L +S+R  F   G SNSI + +T +R  H+    
Subjt:  HFSKLK-FSPPAAVAHSPSSDCYFTSNP---ISLTPSSLADDGFFSTSSDAD-----DSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVS

Query:  EGLEVPKYSMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLTSSSSAPPSAPKA
          + +   S DPY DF+ SM++MVE   L     D   L +LL  +L++N K +H++I  AF DL+L L    S      P +
Subjt:  EGLEVPKYSMDPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLTSSSSAPPSAPKA

AT4G14860.1 ovate family protein 111.2e-1651.92Show/hide
Query:  FSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVSEGLEVPKY--SMDPYADFRRSMQEMVEAREL-ESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLT
        FS+  R     D +T    S   ++S G  + K+  S DPY DF RSM+EMVEAR+L   V +D E+L ELL CYL LNPK+TH+FIV AFAD LL LL+
Subjt:  FSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVSEGLEVPKY--SMDPYADFRRSMQEMVEAREL-ESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLT

Query:  SSSS
         S S
Subjt:  SSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCAACCGTTTCCTAAAACATTTCCATTTCTCCAAACTCAAATTCTCACCGCCGGCCGCCGTCGCCCACTCCCCATCCTCCGACTGCTACTTCACTTCCAACCCCAT
TTCCCTCACCCCTTCCTCCCTTGCCGACGACGGCTTCTTCTCCACCTCCTCCGATGCCGACGACTCAATCTCCGACGACCTTGCCACCCTCCTCGCCTCCCGCCGCTTCT
TCTTCTCCTCCCCCGGCCGCTCCAACTCCATTTGTGACTCCTCCACCGCCCGTCGCCGATCTCACGACGTCGTGGTTTCTGAAGGTCTAGAAGTCCCCAAATATTCAATG
GACCCTTACGCCGACTTCCGGCGGTCAATGCAGGAGATGGTGGAAGCTCGAGAATTGGAGAGTGTGAGGAGCGACTCTGAGTTTTTGCGAGAGCTTTTGTCGTGCTATCT
CCGGTTGAATCCGAAAAACACCCATAAGTTCATTGTTAGAGCTTTTGCTGATCTTTTGCTTTGCTTGTTAACATCCTCCTCGTCCGCTCCCCCGTCGGCTCCTAAAGCAC
GACGGAAAGATGTGGAGAGGTGGAGAATTGGAGAAACAGTGCAAAGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCAACCGTTTCCTAAAACATTTCCATTTCTCCAAACTCAAATTCTCACCGCCGGCCGCCGTCGCCCACTCCCCATCCTCCGACTGCTACTTCACTTCCAACCCCAT
TTCCCTCACCCCTTCCTCCCTTGCCGACGACGGCTTCTTCTCCACCTCCTCCGATGCCGACGACTCAATCTCCGACGACCTTGCCACCCTCCTCGCCTCCCGCCGCTTCT
TCTTCTCCTCCCCCGGCCGCTCCAACTCCATTTGTGACTCCTCCACCGCCCGTCGCCGATCTCACGACGTCGTGGTTTCTGAAGGTCTAGAAGTCCCCAAATATTCAATG
GACCCTTACGCCGACTTCCGGCGGTCAATGCAGGAGATGGTGGAAGCTCGAGAATTGGAGAGTGTGAGGAGCGACTCTGAGTTTTTGCGAGAGCTTTTGTCGTGCTATCT
CCGGTTGAATCCGAAAAACACCCATAAGTTCATTGTTAGAGCTTTTGCTGATCTTTTGCTTTGCTTGTTAACATCCTCCTCGTCCGCTCCCCCGTCGGCTCCTAAAGCAC
GACGGAAAGATGTGGAGAGGTGGAGAATTGGAGAAACAGTGCAAAGGTGATATTTTTCTGTACTTTCTCCGTCCTTGCCCGCTTGGTAAGCATTTCTATCCATGATTATC
TGTAAATATGTGAAAACATCGATGAAAATGGCTACATATGGACAGAAATTAAACACAGTGTCGTCCTATGTTGTAATGTTCTTACAAATCATTCTCCTGATAAATCTCCC
ATATGAAGAGTTCGAATTCATTGGTGGGCTCTTCAAATTATTGGTAAGTTTTAAGTATATGCTAATTAATGTTTATTAGTCAAGTTGTCCCCCATAAACTGATAGTTTTA
TTTTCTTGAAATGGACTATTTGGCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSNRFLKHFHFSKLKFSPPAAVAHSPSSDCYFTSNPISLTPSSLADDGFFSTSSDADDSISDDLATLLASRRFFFSSPGRSNSICDSSTARRRSHDVVVSEGLEVPKYSM
DPYADFRRSMQEMVEARELESVRSDSEFLRELLSCYLRLNPKNTHKFIVRAFADLLLCLLTSSSSAPPSAPKARRKDVERWRIGETVQR