; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg05427 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg05427
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionChloride channel protein
Genome locationCarg_Chr17:1376376..1377681
RNA-Seq ExpressionCarg05427
SyntenyCarg05427
Gene Ontology termsGO:0009826 - unidimensional cell growth (biological process)
GO:0045824 - negative regulation of innate immune response (biological process)
GO:1902476 - chloride transmembrane transport (biological process)
GO:0005802 - trans-Golgi network (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005247 - voltage-gated chloride channel activity (molecular function)
GO:0015108 - chloride transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000644 - CBS domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7013564.1 Chloride channel protein CLC-d, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.5e-69100Show/hide
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XP_022959117.1 chloride channel protein CLC-d isoform X1 [Cucurbita moschata]6.5e-69100Show/hide
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XP_022959118.1 chloride channel protein CLC-d isoform X2 [Cucurbita moschata]6.5e-69100Show/hide
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XP_023006122.1 chloride channel protein CLC-d isoform X1 [Cucurbita maxima]6.5e-69100Show/hide
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XP_023006123.1 chloride channel protein CLC-d isoform X2 [Cucurbita maxima]6.5e-69100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BMB3 Chloride channel protein5.7e-6392.54Show/hide
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A0A6J1H3N7 Chloride channel protein3.1e-69100Show/hide
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A0A6J1H514 Chloride channel protein3.1e-69100Show/hide
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A0A6J1KV19 Chloride channel protein3.1e-69100Show/hide
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A0A6J1L425 Chloride channel protein3.1e-69100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O70496 H(+)/Cl(-) exchange transporter 75.2e-1353.73Show/hide
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        I  I++S ++ E  +DL  F+NPSPY VP++ SL +V+ LFR LGLRH  VV     VVGL+TRKDL
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P51798 H(+)/Cl(-) exchange transporter 75.2e-1353.73Show/hide
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        I  I++S ++ E  +DL  F+NPSPY VP++ SL +V+ LFR LGLRH  VV     VVGL+TRKDL
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P60300 Putative chloride channel-like protein CLC-g3.0e-1649.41Show/hide
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        EF K  S +   I+D+ LS E+L MY+DL PF N SPY V E MSL K   LFR++G+RH  V+P+ +N   VVG++TR D + E
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P92943 Chloride channel protein CLC-d2.4e-4269.53Show/hide
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        RH+FSEF KP SSKG+ I+DI+L+S+DLEMYIDL PFLNPSPY+VPEDMSLTKVYNLFRQLGLRH FVVPRP+ V+GLITRKDLLIE++ +S A+EL QS
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        TSVR R  +        D   PLL+ LL
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Q96282 Chloride channel protein CLC-c1.5e-1549.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27170.1 chloride channel B4.1e-1346.58Show/hide
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        + DD+ ++S ++EMY+DL P  N +PY V E+MS+ K   LFRQ+GLRH  +VP+        VVG++TR+DL
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AT5G26240.1 chloride channel D1.7e-4369.53Show/hide
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AT5G33280.1 Voltage-gated chloride channel family protein2.1e-1749.41Show/hide
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        EF K  S +   I+D+ LS E+L MY+DL PF N SPY V E MSL K   LFR++G+RH  V+P+ +N   VVG++TR D + E
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AT5G40890.1 chloride channel A1.3e-1141.1Show/hide
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AT5G49890.1 chloride channel C1.0e-1649.41Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAACCAGGCATAATTTCAGTGAGTTTGTGAAACCTGCTTCCAGTAAAGGAATTTCTATTGATGATATCAATCTTAGTTCAGAGGACTTGGAAATGTACATTGATCT
ACTCCCCTTTTTGAATCCATCTCCATATATTGTCCCAGAGGATATGTCTTTGACAAAGGTATATAATCTTTTCCGGCAATTGGGTCTGAGACACGCGTTTGTTGTTCCCC
GTCCAGCAAATGTGGTCGGTTTGATCACTCGAAAGGATCTGTTGATAGAGGATAGCGAAGATTCGGATGCTATGGAGCTACAATCGACTAGTGTAAGAGCTCGGCGTCGA
GATAGAAGAATACATACAGCGAATGGGGATGTCGAGAGCCCACTTCTTAACGGACTTTTGGTCAATAACACAGACGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCAACCAGGCATAATTTCAGTGAGTTTGTGAAACCTGCTTCCAGTAAAGGAATTTCTATTGATGATATCAATCTTAGTTCAGAGGACTTGGAAATGTACATTGATCT
ACTCCCCTTTTTGAATCCATCTCCATATATTGTCCCAGAGGATATGTCTTTGACAAAGGTATATAATCTTTTCCGGCAATTGGGTCTGAGACACGCGTTTGTTGTTCCCC
GTCCAGCAAATGTGGTCGGTTTGATCACTCGAAAGGATCTGTTGATAGAGGATAGCGAAGATTCGGATGCTATGGAGCTACAATCGACTAGTGTAAGAGCTCGGCGTCGA
GATAGAAGAATACATACAGCGAATGGGGATGTCGAGAGCCCACTTCTTAACGGACTTTTGGTCAATAACACAGACGGCTGATGAACATCATGCAGCAGCTGCCAAGATTA
ATATGGTCAGATTACTACTAGTTTATGATGCTTTTCTTCATATTCCCATTAGGAAATATATTCTTTATTGTTTGCTGGCTGGGATTCCAATCCCAAACCAGGTAGATATC
TAAAGAACAGAGCAGAACAGAGCATTGTATTATATCATAGATTGTAATGATAAGAGTTGGCTTAGTTTATTTTGTTTATGAAAGCTTCAAACTTACGAAAACGTATGTAT
AGACGACGTAAAAAGAGACCTCGATGACGAACTATCACTACAAAATGGCTGAAATTTGTTGTACAAAAAAGACTGCAACTTATTGAAAGGGAAGGGCTTGGCTTGTGCCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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