CuGenDBv2

Gene ID	Carg05826
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	Unknown protein
Genome location	Carg_Chr16:4668953..4672300
RNA-Seq Expression	Carg05826
Synteny	Carg05826
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7015392.1 hypothetical protein SDJN02_23028, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.6e-140

100

Show/hide

Query:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA
        MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA
Subjt:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA

Query:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL
        FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL
Subjt:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL

Query:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSVKLGNLDIDIFDSES
        DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSVKLGNLDIDIFDSES
Subjt:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSVKLGNLDIDIFDSES

XP_022929551.1 uncharacterized protein LOC111436086 [Cucurbita moschata]

2.7e-111

87.45

Show/hide

Query:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA
        MAVNQCQ                      TAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLA DSSSFLSTEGFD SPECDPHLA
Subjt:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA

Query:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL
        FLSFLEVTHPT+TRMSLETSDTRLT QNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKS EGSFESLRTESTLVRIEK+LQRQSSLKMGAKLMQYLL
Subjt:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL

Query:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL
        DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV   LG L
Subjt:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL

XP_022985084.1 uncharacterized protein LOC111483162 [Cucurbita maxima]

4.5e-111

86.67

Show/hide

Query:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA
        MAVNQCQ                      TAAVSNGVLVQEKLAKVT LDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFD SPECDPHLA
Subjt:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA

Query:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL
        FLSFLEVTHPT+TRMSLETSDTRLT QNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEG+FESLRTESTLVRIEK+LQRQSSLKMGAKL+QYLL
Subjt:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL

Query:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL
        DHGLMLLKFSSKEKSGIE+AQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV   LG L
Subjt:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL

XP_023551822.1 uncharacterized protein LOC111809675 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

5.9e-111

87.06

Show/hide

Query:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA
        MAVNQCQ                      TAAVSN VLVQEKLAKVT LDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFD SPECDPHLA
Subjt:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA

Query:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL
        FLSFLEVTHPT+TRMSLETSDTRLT QNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEG+FESLRTESTLVRIEK+LQRQSSLKMGAKLMQYLL
Subjt:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL

Query:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL
        DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV   LG L
Subjt:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL

XP_038903131.1 uncharacterized protein LOC120089804 isoform X1 [Benincasa hispida]

1.6e-92

75.69

Show/hide

Query:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA
        MAVNQCQ                      TAAVSNGVLVQEKLAKV+ L+E ERHCSLEILP LFEK SFPFQNS ARDSS FLSTE FD SPECDPHLA
Subjt:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA

Query:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL
        FLSFLEVTH T++RMSLETSD RLT QNVIDIHVN GDA SSCIVNIDIDK   DKL+ SKSCEGS ES++TE+TL+RIEK+LQRQSSLKMGAKL QYLL
Subjt:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL

Query:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL
        DHGLMLLKFSSKEK G ERA D  NNRWRKYKR+ASFDSRKIV+LFSV   LG L
Subjt:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1C5A8 uncharacterized protein LOC111008504

2.0e-88

72.55

Show/hide

Query:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA
        MAVNQCQ+                      AAVSNGV VQEKLAKV  LDE ERHCSLEILPILFEK SFPFQ+S  RDSS   S E FD SP+CDPHLA
Subjt:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA

Query:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL
        FLS LEVTHPT++RMSLETSDTRLT QNVIDIHVN GDA SSCIVNIDIDK   DKLKTSK C+G FESL+T++TLVRIEK+LQRQSSLK+G KL+QYLL
Subjt:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL

Query:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL
        DHGLMLLKFS+KEK G ER  D  NNRWRKYKR+ASFDSRKIV+LFSV   LG L
Subjt:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL

A0A6J1ENF8 uncharacterized protein LOC111436086

1.3e-111

87.45

Show/hide

Query:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA
        MAVNQCQ                      TAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLA DSSSFLSTEGFD SPECDPHLA
Subjt:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA

Query:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL
        FLSFLEVTHPT+TRMSLETSDTRLT QNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKS EGSFESLRTESTLVRIEK+LQRQSSLKMGAKLMQYLL
Subjt:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL

Query:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL
        DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV   LG L
Subjt:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL

A0A6J1FLJ9 uncharacterized protein LOC111446909

3.8e-87

78.22

Show/hide

Query:  AAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLAFLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVI
        A +SNGV VQEKLAKVT  DE ERH SLEILP LFEK SFP Q+SLARDSS F STE FD SP+CDPHLAFLSFLEVTHPT ++MSL TSD  LT QNVI
Subjt:  AAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLAFLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVI

Query:  DIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLLDHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRK
        DIHVN GDA SSCIVNIDIDK   DKLKT KSCEG+FESL+TE+TL+RIEK+LQRQSSLKMG KL+ YLLDHGLMLL+FSSKEKSG ER  D  NNRWRK
Subjt:  DIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLLDHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRK

Query:  YKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL
        YKR+ASFDSRKIV+LFSV   LG L
Subjt:  YKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL

A0A6J1JCA6 uncharacterized protein LOC111483162

2.2e-111

86.67

Show/hide

Query:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA
        MAVNQCQ                      TAAVSNGVLVQEKLAKVT LDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFD SPECDPHLA
Subjt:  MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLA

Query:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL
        FLSFLEVTHPT+TRMSLETSDTRLT QNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEG+FESLRTESTLVRIEK+LQRQSSLKMGAKL+QYLL
Subjt:  FLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLL

Query:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL
        DHGLMLLKFSSKEKSGIE+AQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV   LG L
Subjt:  DHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL

A0A6J1JTU6 uncharacterized protein LOC111488280

1.3e-87

78.67

Show/hide

Query:  AAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLAFLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVI
        AA+SNGV VQEKLAKVT  DE ERH SLEILP LF+K SFP Q+SLARDSS FLSTE  D SP+CDPHLAFLSFLEVTHPT ++MSL TSD  LT QNVI
Subjt:  AAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLAFLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVI

Query:  DIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLLDHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRK
        DIHVN GDA SSCIVNIDIDK   DKLKT KSCEG+FESL+TE+TL+RIEK+LQRQSSLKMG KL+ YLLDHGLMLLKFSSKEKSG ER  D  NNRWRK
Subjt:  DIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLLDHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRK

Query:  YKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL
        YKR+ASFDSRKIV+LFSV   LG L
Subjt:  YKRSASFDSRKIVVLFSV--KLGNL

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G39900.1 unknown protein

9.4e-22

33.02

Show/hide

Query:  KLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSS--------SFLSTEGFDISPECDPHLAFLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIH
        KL K T   +  +H ++++ P+L ++ +FP +     D+S        S L  EG  I P+C  H   LSF++   P++ +M ++        QN I++ 
Subjt:  KLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSS--------SFLSTEGFDISPECDPHLAFLSFLEVTHPTRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIH

Query:  VNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLLDHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKR
        +   D+  SC+V+I+++K    +  TS   +    S+++ES  V ++K+LQRQ+SL                     S +K+  ER  DA  NRWR+YKR
Subjt:  VNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLLDHGLMLLKFSSKEKSGIERAQDASNNRWRKYKR

Query:  SASFDSRKIVVLFSV
        +ASFDSRKIV+LFS+
Subjt:  SASFDSRKIVVLFSV

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATGGCTGTTAATCAGTGTCAGATTTCTGTTGTGCTGGAGTTTTTTTGTTGGCTTAGAAATGAGAATCTGAAGATTCGTTTGAGCTTTACTGCAGCTGTGTCGAATGGAGT
TCTCGTTCAAGAAAAACTAGCGAAAGTTACTGGACTTGACGAGAGGGAGCGTCATTGTTCTTTAGAAATTTTGCCAATTCTCTTTGAGAAGACTTCGTTCCCCTTCCAAA
ATTCTTTGGCCCGTGATTCCTCTAGCTTTTTAAGTACCGAGGGATTCGACATCAGTCCAGAGTGTGATCCACATTTGGCTTTCCTCAGCTTCCTTGAAGTTACCCATCCA
ACAAGAACTAGGATGTCATTGGAAACTTCAGATACTCGCTTGACTTACCAGAACGTAATTGACATACACGTGAATGCTGGTGATGCTTGTTCCTCGTGCATAGTAAATAT
TGATATTGACAAGGACAAGCTGGACAAGCTCAAAACATCTAAATCCTGTGAAGGAAGTTTTGAAAGCTTGAGAACTGAGAGTACATTAGTGCGCATTGAGAAGATACTGC
AGAGACAGTCCAGTCTTAAAATGGGGGCGAAACTTATGCAATATTTGTTGGATCATGGACTTATGTTGCTGAAGTTCTCGTCTAAAGAAAAATCAGGGATCGAAAGGGCT
CAGGACGCGTCAAACAACAGGTGGAGAAAATATAAACGTTCTGCTTCATTTGATTCAAGAAAGATTGTTGTTCTTTTCTCGGTCAAGCTTGGGAACCTTGATATTGATAT
ATTTGACTCTGAGAGTTAGGCAGCAGGGTGGGGATGGATCTGTTGCTATGTAGTATTGTATGGTTCTTCTCCTTTGCCTTTCTACAAATCTCTTAAAATAGTTTGCTTTT
AAATTCTATGTTCTTATAGATCATCTTATTTGTACATAAATGTTCTTCCACTTTATGGCTCCCGTAGGAACTGAACACAGTAGTGTGTGATTAGTGAATGTGTTTTGACA
ATGGGATGATCCCCTCCTTGGCTAAGAACTTCAAAATCCTTCATGGAAATGTTGGGAGATCTCCATTTTATAGGAATGTAGGTAAAAATATTTTATGTTCATGGAAAATT
ATGTTCAGATTGTGTGTATATATATATATATATGTATATACATATTTTT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAVNQCQISVVLEFFCWLRNENLKIRLSFTAAVSNGVLVQEKLAKVTGLDERERHCSLEILPILFEKTSFPFQNSLARDSSSFLSTEGFDISPECDPHLAFLSFLEVTHP
TRTRMSLETSDTRLTYQNVIDIHVNAGDACSSCIVNIDIDKDKLDKLKTSKSCEGSFESLRTESTLVRIEKILQRQSSLKMGAKLMQYLLDHGLMLLKFSSKEKSGIERA
QDASNNRWRKYKRSASFDSRKIVVLFSVKLGNLDIDIFDSES

Carg05826 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome