; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg06049 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg06049
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionzinc finger protein 511
Genome locationCarg_Chr04:21673799..21675982
RNA-Seq ExpressionCarg06049
SyntenyCarg06049
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR039258 - Zinc finger protein 511


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602683.1 Zinc finger protein 511, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-13799.6Show/hide
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KAG7033369.1 Zinc finger protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-138100Show/hide
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XP_022922829.1 zinc finger protein 511 [Cucurbita moschata]1.9e-13598.39Show/hide
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XP_022990047.1 zinc finger protein 511 [Cucurbita maxima]1.2e-13497.59Show/hide
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XP_023522582.1 zinc finger protein 511-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.0e-13799.2Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMY3 Uncharacterized protein2.5e-12591.57Show/hide
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A0A1S3B3Y4 zinc finger protein 5113.9e-12691.16Show/hide
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A0A5D3DLV5 Zinc finger protein 5111.2e-12284.7Show/hide
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A0A6J1E4J7 zinc finger protein 5119.3e-13698.39Show/hide
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A0A6J1JHI5 zinc finger protein 5116.0e-13597.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6P0X2 Zinc finger protein 5119.6e-2131.77Show/hide
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        A  E P+ + P   RF  D  FF  G+V+R +  + +   LT+  +    +MV +      C + GC     +++D++ HY+  H  +CS C R +P+  
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        LL +H+ E HDS FQ  +A+  DMY+CLVE C  KFK+ + R+ H+V  H + A F F K                   P +++  ME+ +E
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Q7ZZ00 Zinc finger protein 5112.6e-2633.61Show/hide
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        E +A S F + +P + RF  +  +F  G++ R +  + +     +D++    +       +  C I GC     +L+ +E HYN+ H   CS C R +P+
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        +RLL +H+ E HDS FQ  +A    MYECLVEGCGLKFK+ K R+ HL+  H + A F F K     +   +K  +K+         VLQ +E +  M+ 
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              VE E M    L   K   S   PSS+ FG+   RG
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Q8NB15 Zinc finger protein 5117.3e-2131.63Show/hide
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        RF  +  FF  G+V+R +  + V +             V DV  K       C + GC     +LDD+E HY++ H   CS C R +P+  LL  H+ E 
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        HDS FQ  ++   DMY+CLVEGC  KFK+ + R+ H+V  H + A F F K  P   +             R E   ME+ +E +        +      
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Query:  STPSSVSFGRRHTRG
          PS++ FG+   RG
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Q9V574 Protein lethal(2)k102014.0e-1129.01Show/hide
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        D+ +   + SC  C ++ PT+ LL LH++E HD +F A V RG   M+ C +E C +KF + + R+ H +  HK  A++ F            K   KQ 
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         Q + + + MEV+    +   L  V   S    T  S   G+    G T       +E ++D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14140.1 zinc ion binding;nucleic acid binding;zinc ion binding6.2e-9268.16Show/hide
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        FPYW P +RRF PDSPFFASGNVERE+LAKQV LD TEDE   LH  V    R+I CPIVGC   LKSLD FEDHYN+RHTASCSVC RVYPTSRLLS+H
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        +SEAHDSFFQAKV+RGYDMYECLVEGCGLKFK+YK+R +HL+DKHKF  +FEF KK   SKK+R+KL R+ V + + E  K       MEVE++ ++DGL
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        +  +S L+TSD+TPS+VSFGRRH RGLTFVPR+V REK ++SS+A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAAACAGGTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTCCAGCTTCATAATATGGTAGTTGATGTCGGCAGGAAAATCTTTTGCCCAATAGTCGGTTGTGGTGCGCACT
TGAAATCGCTGGATGACTTTGAAGATCACTACAATTCACGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCAAGAGTATATCCAACATCACGACTGCTTAGTCTGCATGTGTCT
GAGGCACACGACTCGTTCTTTCAAGCCAAAGTTGCTCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGGTTGAAGTTCAAGAGCTACAAAAGCAGACAGCA
GCATCTAGTGGACAAACATAAGTTTTCTGCTTCATTTGAATTCTGTAAGAAGGCTCCTCCTTCTAAGAAACAAAGGCAGAAATTATATCGAAAACAAGTACTTCAACCAA
GGGAAGAAACTTCCAAAATGGAAGTCGAGAATGAAACTATGGATGGCCTCATTTTGGGAGTATCTAAACTAAGTACTTCGGACTCAACTCCATCATCAGTCAGCTTTGGT
CGAAGGCACACTCGAGGGTTAACGTTTGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGTGAAAAAGTTTCAGACTCCTCAACAGCAGGATCAAACAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATTACCAATTTATGATAATAATAATAATAAATAAAAAAATAATTACAAAATTTGAATCGGATATATTGCTGGATGGGTCTAACCCGGAGTGCGGCGGGTCGGATCCCGA
TCAGGAGATTTCGACGATTGAAATTTGAAGGTTGATTAGCGTCACTTTGGCATTCAGCGGTTCAATTTCAAACCAAATTGAAAGAATCTTCCTTCTTGCAACGGTACCAT
GGAAGTTGAAGCACAATCGGAGTTTCCGTACTGGAAGCCTTTCCAACGGAGGTTCGACCCTGATTCTCCCTTCTTCGCCTCTGGAAATGTCGAGCGCGAAATCTTAGCCA
AACAGGTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTCCAGCTTCATAATATGGTAGTTGATGTCGGCAGGAAAATCTTTTGCCCAATAGTCGGTTGTGGTGCGCACTTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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