; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg06081 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg06081
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTrinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein
Genome locationCarg_Chr04:21818133..21818723
RNA-Seq ExpressionCarg06081
SyntenyCarg06081
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602714.1 hypothetical protein SDJN03_07947, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.6e-10099.49Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSF-SSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH
        MFQSSRRTRSF SSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH
Subjt:  MFQSSRRTRSF-SSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH

Query:  DWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
        DWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
Subjt:  DWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

KAG7033401.1 hypothetical protein SDJN02_07457, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-101100Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHD
        MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHD
Subjt:  MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHD

Query:  WRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
        WRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
Subjt:  WRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

XP_022953683.1 uncharacterized protein LOC111456137 [Cucurbita moschata]4.3e-9898.48Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSFSSSS-SSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH
        MFQSSRRTRSFSSSS SSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH
Subjt:  MFQSSRRTRSFSSSS-SSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH

Query:  DWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
        DWRKSNRQN QRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNP SSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
Subjt:  DWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

XP_022991024.1 uncharacterized protein LOC111487739 [Cucurbita maxima]5.6e-9897.45Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHD
        MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLT LLPLPPIST LPSSKRFGFHD
Subjt:  MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHD

Query:  WRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
        WRKSNRQN QRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTC VSESIVYRPRRGRSSFDLLNHR+GG
Subjt:  WRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

XP_023528120.1 uncharacterized protein LOC111791129 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-9897.49Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSF---SSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFG
        MFQSSRRTRSF   SSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFG
Subjt:  MFQSSRRTRSF---SSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFG

Query:  FHDWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
        FHDWRKSNRQN QRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDR GFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
Subjt:  FHDWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B2H5 uncharacterized protein LOC1034854237.2e-7580.5Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSFSSSSS---SSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSA-ATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRF
        MFQSSRRT SFSSSSS   SSSSSSSSSRGSYYFP +SP SA ATPIRSFSG+IPFSWE+LPGIPKKQSPARLR  SASPL+SLLPLPP STTL SSKRF
Subjt:  MFQSSRRTRSFSSSSS---SSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSA-ATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRF

Query:  GFHDWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
        GF DWRKSNRQNPQRDPFFDAF+ECSKEP+ A        AELW+  SNGKA++RSLSDRFGFLN YSSCKRTCGVSESIVY PR   SSFDLLN R+GG
Subjt:  GFHDWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

A0A5D3C8I6 Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein7.2e-7580.5Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSFSSSSS---SSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSA-ATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRF
        MFQSSRRT SFSSSSS   SSSSSSSSSRGSYYFP +SP SA ATPIRSFSG+IPFSWE+LPGIPKKQSPARLR  SASPL+SLLPLPP STTL SSKRF
Subjt:  MFQSSRRTRSFSSSSS---SSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSA-ATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRF

Query:  GFHDWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
        GF DWRKSNRQNPQRDPFFDAF+ECSKEP+ A        AELW+  SNGKA++RSLSDRFGFLN YSSCKRTCGVSESIVY PR   SSFDLLN R+GG
Subjt:  GFHDWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

A0A6J1DE38 uncharacterized protein LOC1110202112.7e-6979.38Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKK-QSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH
        MFQSSRRT SF  SSSSS SSSSSSRGSYYFPDDSPLS+ATPIRSFSG+IPFSWE+LPGIPKK QSPARLR DSASPLTSLLPLPP STT PSSKRFGF 
Subjt:  MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKK-QSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH

Query:  DWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSG---SNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLL
        +WRKSNR N QRDPFFDAFVECSK+ ++A        AELW+ G   + GKA+SRSLSDRFGFLN YSSCKRTCGVSESIV  PR  RSSFDLL
Subjt:  DWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSG---SNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLL

A0A6J1GNZ5 uncharacterized protein LOC1114561372.1e-9898.48Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSFSSSS-SSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH
        MFQSSRRTRSFSSSS SSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH
Subjt:  MFQSSRRTRSFSSSS-SSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFH

Query:  DWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
        DWRKSNRQN QRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNP SSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
Subjt:  DWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

A0A6J1JTM6 uncharacterized protein LOC1114877392.7e-9897.45Show/hide
Query:  MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHD
        MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLT LLPLPPIST LPSSKRFGFHD
Subjt:  MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHD

Query:  WRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG
        WRKSNRQN QRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTC VSESIVYRPRRGRSSFDLLNHR+GG
Subjt:  WRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22680.1 unknown protein7.0e-1440.31Show/hide
Query:  SRRTRSFSSSS----SSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHD
        +RR+ S   SS    S+  S SSSS  S  F  +SP   ATP+      IPFSWE LPG PK+ S  R        L++LLPLPP  +    + R     
Subjt:  SRRTRSFSSSS----SSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHD

Query:  WRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLN
         +K+      RDPF  A VECSK   A T  E          G + K + +S S   G LN YSSC+R C VSESIVY P +  +S+D L+
Subjt:  WRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLN

AT1G71970.1 unknown protein1.0e-2041.79Show/hide
Query:  QSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPL-SAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPP---ISTTLPSSKRFGF
        +SS  +R   SSSSS SS SS S  S  FP DSPL S ATP+R     +PFSWE LPG PK  S       +      LLPLPP   IS      K    
Subjt:  QSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPL-SAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPP---ISTTLPSSKRFGF

Query:  HDWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAE-------LWNSGSNGKAVSR-SLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPR-RGRSSFDL
        +  +K++     +DPF  A +ECSK+    +  + D             NSG + K +S+ S+ DRFG +N Y SC+RTC V+ESIVY PR R  +S+D 
Subjt:  HDWRKSNRQNPQRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAE-------LWNSGSNGKAVSR-SLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPR-RGRSSFDL

Query:  L
        L
Subjt:  L


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCGTTCTTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCGCGGTTCTTACTATTTTCCCGATGACTCTCCGCT
CTCCGCCGCCACTCCGATCCGATCATTCTCCGGCAGCATTCCCTTTTCCTGGGAATATTTACCCGGAATCCCCAAGAAACAGTCTCCAGCGAGGCTTCGGCTAGATTCCG
CCTCTCCTCTGACCTCTCTCCTCCCCTTGCCTCCCATTTCCACCACTCTGCCGTCCTCCAAGCGCTTCGGATTTCACGACTGGAGGAAATCAAACCGCCAAAATCCGCAG
CGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCGTCGAGTGCTCCAAAGAACCTTCCGCCGCCACCGCTGCTGAGCAAGACCCGACTGCCGAGCTCTGGAACAGCGGCAGCAATGGCAA
AGCGGTTTCGAGAAGCCTGAGCGACCGATTCGGATTCCTGAATCCGTACTCTTCTTGCAAACGAACCTGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTGTATCGTCCGAGAAGGGGGA
GGAGTTCGTTCGATCTGCTAAACCACCGCAACGGTGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCGTTCTTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCGCGGTTCTTACTATTTTCCCGATGACTCTCCGCT
CTCCGCCGCCACTCCGATCCGATCATTCTCCGGCAGCATTCCCTTTTCCTGGGAATATTTACCCGGAATCCCCAAGAAACAGTCTCCAGCGAGGCTTCGGCTAGATTCCG
CCTCTCCTCTGACCTCTCTCCTCCCCTTGCCTCCCATTTCCACCACTCTGCCGTCCTCCAAGCGCTTCGGATTTCACGACTGGAGGAAATCAAACCGCCAAAATCCGCAG
CGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCGTCGAGTGCTCCAAAGAACCTTCCGCCGCCACCGCTGCTGAGCAAGACCCGACTGCCGAGCTCTGGAACAGCGGCAGCAATGGCAA
AGCGGTTTCGAGAAGCCTGAGCGACCGATTCGGATTCCTGAATCCGTACTCTTCTTGCAAACGAACCTGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTGTATCGTCCGAGAAGGGGGA
GGAGTTCGTTCGATCTGCTAAACCACCGCAACGGTGGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFQSSRRTRSFSSSSSSSSSSSSSSRGSYYFPDDSPLSAATPIRSFSGSIPFSWEYLPGIPKKQSPARLRLDSASPLTSLLPLPPISTTLPSSKRFGFHDWRKSNRQNPQ
RDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPYSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG