; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg06304 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg06304
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr06:7919280..7922391
RNA-Seq ExpressionCarg06304
SyntenyCarg06304
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG1760612.1 hypothetical protein EDD22DRAFT_900217 [Suillus occidentalis]5.9e-0829.85Show/hide
Query:  LKNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRARSIVFEVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSF
        L+ RA+   V      EV V++L+RAR+++ +V   R+ +++++   R RA+   V      EV V++L+RA+ ++ +V   R+  ++++  +R RA   
Subjt:  LKNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRARSIVFEVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSF

Query:  SVEPRSLDEVDVNVLVRAQSIVSEVIEHRALVLN
         V  R   EV V++L+RA++++ +VI  R+   N
Subjt:  SVEPRSLDEVDVNVLVRAQSIVSEVIEHRALVLN

KAG1775471.1 hypothetical protein EV702DRAFT_1116532, partial [Suillus placidus]4.1e-0932.81Show/hide
Query:  LKNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRARSIVFEVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSF
        L+ RA+   V  HS  EV V +L+RAR+++ +V  H +  +++    R RA+   V  HS   V V +L+RA+ ++ +V  H + V++    +R RA   
Subjt:  LKNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRARSIVFEVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSF

Query:  SVEPRSLDEVDVNVLVRAQSIVSEVIEH
         V   S  EV V +L+RA++++ +V+ H
Subjt:  SVEPRSLDEVDVNVLVRAQSIVSEVIEH

KAG2110178.1 hypothetical protein BD769DRAFT_1779032 [Suillus cothurnatus]2.5e-0624.22Show/hide
Query:  LKNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRARSIVFEVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSF
        L+ RA+   V  H    V V++++RAR+++ +V  H +  ++++   R RA+   +  H    V V++++RA+ ++ +V  H +  ++++  +R R    
Subjt:  LKNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRARSIVFEVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSF

Query:  SVEPRSLDEVDVNVLVRAQSIVSEVIEH
         V      +V V++++RA++++ +V+ H
Subjt:  SVEPRSLDEVDVNVLVRAQSIVSEVIEH

KAG6597275.1 hypothetical protein SDJN03_10455, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-5467.68Show/hide
Query:  VNRGDCRWRFFGLIFSCLHKGKLSFADTGCMCCAVLQAF------IFCFPYLK-------NRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRARSIVFEVTGHRALVLN
        VNRGDCRWRFFGLIFSCLHKG+ +     C+  ++   F       F + +L        NRA  FSVEPHSLDEVDV+VLVRARSIV E T HRALVLN
Subjt:  VNRGDCRWRFFGLIFSCLHKGKLSFADTGCMCCAVLQAF------IFCFPYLK-------NRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRARSIVFEVTGHRALVLN

Query:  LTAWTR----NRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSFSVEPRSLDEVDVNVLVRAQSIVSEVIEHRALVLNLT
        LTAW R    NRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRA+ IV EVTEHRALVLNLTAW             SLDEVDVNVLV AQSIVSEV EHRALVLNLT
Subjt:  LTAWTR----NRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSFSVEPRSLDEVDVNVLVRAQSIVSEVIEHRALVLNLT

KAG7028746.1 hypothetical protein SDJN02_09927, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.4e-118100Show/hide
Query:  MQFLAIDVEEAELKLVCFKRLKSCCPFVYKTRHPVNRGDCRWRFFGLIFSCLHKGKLSFADTGCMCCAVLQAFIFCFPYLKNRALSFSVEPHSLDEVDVN
        MQFLAIDVEEAELKLVCFKRLKSCCPFVYKTRHPVNRGDCRWRFFGLIFSCLHKGKLSFADTGCMCCAVLQAFIFCFPYLKNRALSFSVEPHSLDEVDVN
Subjt:  MQFLAIDVEEAELKLVCFKRLKSCCPFVYKTRHPVNRGDCRWRFFGLIFSCLHKGKLSFADTGCMCCAVLQAFIFCFPYLKNRALSFSVEPHSLDEVDVN

Query:  VLVRARSIVFEVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSFSVEPRSLDEVDVNVLVRAQSI
        VLVRARSIVFEVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSFSVEPRSLDEVDVNVLVRAQSI
Subjt:  VLVRARSIVFEVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSFSVEPRSLDEVDVNVLVRAQSI

Query:  VSEVIEHRALVLNLTT
        VSEVIEHRALVLNLTT
Subjt:  VSEVIEHRALVLNLTT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9C6 Uncharacterized protein6.6e-0552.83Show/hide
Query:  LVCFKRLKSCCPFVYKTRHPVNRGDCRWRFF-----------GLIFSCLHKGK
        LVCFKRLK CCPFVY+TRHP +     +              GLIFSCLH+GK
Subjt:  LVCFKRLKSCCPFVYKTRHPVNRGDCRWRFF-----------GLIFSCLHKGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAATTTCTGGCGATTGACGTTGAGGAGGCAGAGTTGAAGTTGGTCTGCTTTAAGCGTTTGAAGTCTTGCTGTCCTTTTGTCTACAAGACAAGACACCCAGTTAATCG
GGGTGATTGTCGTTGGAGGTTTTTCGGGTTGATTTTCTCTTGTTTACACAAAGGAAAGCTTTCTTTTGCTGATACTGGATGTATGTGCTGTGCTGTGCTACAAGCTTTTA
TCTTCTGTTTCCCTTACCTCAAGAACCGAGCACTGAGCTTTAGTGTTGAACCTCACAGCTTGGATGAGGTGGATGTCAATGTCTTAGTTCGTGCTCGGTCTATTGTTTTT
GAAGTAACCGGACACCGTGCTTTAGTGTTGAACCTCACAGCTTGGACGAGGAACCGTGCACTGAGCTTTAGTGTTGAACCTCACAGCTTGGATGAGGTGGATGTCAATGT
CTTAGTTCGTGCTCAGTATATTGTTTCTGAAGTAACCGAGCACCGAGCCTTAGTGTTGAACCTCACAGCTTGGATGAGGAACCGAGCACCGAGCTTTAGTGTTGAACCTC
GCAGCTTAGATGAGGTGGATGTCAATGTCTTAGTTCGTGCTCAGTCTATTGTTTCTGAAGTAATCGAGCACCGAGCTTTAGTGTTGAACCTCACAACTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAATTTCTGGCGATTGACGTTGAGGAGGCAGAGTTGAAGTTGGTCTGCTTTAAGCGTTTGAAGTCTTGCTGTCCTTTTGTCTACAAGACAAGACACCCAGTTAATCG
GGGTGATTGTCGTTGGAGGTTTTTCGGGTTGATTTTCTCTTGTTTACACAAAGGAAAGCTTTCTTTTGCTGATACTGGATGTATGTGCTGTGCTGTGCTACAAGCTTTTA
TCTTCTGTTTCCCTTACCTCAAGAACCGAGCACTGAGCTTTAGTGTTGAACCTCACAGCTTGGATGAGGTGGATGTCAATGTCTTAGTTCGTGCTCGGTCTATTGTTTTT
GAAGTAACCGGACACCGTGCTTTAGTGTTGAACCTCACAGCTTGGACGAGGAACCGTGCACTGAGCTTTAGTGTTGAACCTCACAGCTTGGATGAGGTGGATGTCAATGT
CTTAGTTCGTGCTCAGTATATTGTTTCTGAAGTAACCGAGCACCGAGCCTTAGTGTTGAACCTCACAGCTTGGATGAGGAACCGAGCACCGAGCTTTAGTGTTGAACCTC
GCAGCTTAGATGAGGTGGATGTCAATGTCTTAGTTCGTGCTCAGTCTATTGTTTCTGAAGTAATCGAGCACCGAGCTTTAGTGTTGAACCTCACAACTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQFLAIDVEEAELKLVCFKRLKSCCPFVYKTRHPVNRGDCRWRFFGLIFSCLHKGKLSFADTGCMCCAVLQAFIFCFPYLKNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRARSIVF
EVTGHRALVLNLTAWTRNRALSFSVEPHSLDEVDVNVLVRAQYIVSEVTEHRALVLNLTAWMRNRAPSFSVEPRSLDEVDVNVLVRAQSIVSEVIEHRALVLNLTT