; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg06351 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg06351
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionHydroxyisourate hydrolase
Genome locationCarg_Chr06:7651791..7655735
RNA-Seq ExpressionCarg06351
SyntenyCarg06351
Gene Ontology termsGO:0006144 - purine nucleobase metabolic process (biological process)
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GO:0019428 - allantoin biosynthetic process (biological process)
GO:0001560 - regulation of cell growth by extracellular stimulus (biological process)
GO:0005777 - peroxisome (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0031234 - extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane (cellular component)
GO:0051997 - 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase activity (molecular function)
GO:0042802 - identical protein binding (molecular function)
GO:0033971 - hydroxyisourate hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR036817 - Transthyretin/hydroxyisourate hydrolase domain superfamily
IPR036778 - Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase superfamily
IPR023419 - Transthyretin, conserved site
IPR023418 - Transthyretin, thyroxine binding site
IPR023416 - Transthyretin/hydroxyisourate hydrolase domain
IPR018020 - Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase
IPR014306 - Hydroxyisourate hydrolase
IPR000895 - Transthyretin/hydroxyisourate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004133944.1 uric acid degradation bifunctional protein TTL isoform X1 [Cucumis sativus]4.4e-16789.58Show/hide
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A0A0A0L3W8 Hydroxyisourate hydrolase2.1e-16789.58Show/hide
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A0A6J1G375 Hydroxyisourate hydrolase3.5e-186100Show/hide
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Q06S87 5-hydroxyisourate hydrolase4.3e-1636.13Show/hide
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Q4VYA5 5-hydroxyisourate hydrolase1.8e-1439.52Show/hide
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Q8ZQ52 5-hydroxyisourate hydrolase1.8e-1439.52Show/hide
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Q9CRB3 5-hydroxyisourate hydrolase5.1e-1744.44Show/hide
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        +E+QK   FHVPLLLSP+S++TYRGS
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Q9LVM5 Uric acid degradation bifunctional protein TTL7.9e-10360.3Show/hide
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        + GE+E++ CCGSS+FA++M +  P  S ++A+  AR IWFNQV+V  WLEAFSAHPQIG   S S N   A+ S  EQSTA AT + S+LQELAEWN+ 
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        Y+KKFGFIF+ICASGR+  E+L  LK+RY NRPIVE EIAA EQMKITELR+AKLFS K    S  +S     + K  +DR+ IIGGHL+ A+ A   K 
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             R+RPPITTHVLDV+RG+PAAG++V LE W GT   P F     G W+  G+SATD+DGRSG L+ +++A+NPG YRISF+T KY P  FFPYVSI
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G58220.1 transthyretin-like protein5.6e-10460.3Show/hide
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AT5G58220.2 transthyretin-like protein5.8e-8552.73Show/hide
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        VF++ ESQK EHFHVPLLL+PFSFSTYRGS
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AT5G58220.3 transthyretin-like protein3.9e-9756.97Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCGAGTTATGATTTTGGAGAGGAAGAGTTTCAGGCATGCTGTGGAAGCTCCAAATTCGCCAGAGAAATGGTTTCCGTTTCCCCTTTTTTCTCCTTGGAACAAGC
TGTAGATGCAGCTAGACGCATCTGGTTTAATCAGGTCGATGTGAATGGTTGGCTGGAAGCATTCTCTGCTCATCCACAGATTGGTCAAGCGTCTAAATCATCCAATCAGA
CGAGTGCTCAATGGAGTAAGGGAGAGCAGTCAACTGCACTGGCAACTGCTACTGGTTCTAGCTTACAGGAGCTAGCTGAATGGAATATTCAGTACCAGAAAAAGTTCGGA
TTTATATTTCTTATTTGTGCATCTGGAAGGAGCACCGACGAAATACTTGCAGAATTAAAGAAACGGTATTCAAATAGACCCATAGTTGAGTTTGAGATTGCTGCTCAAGA
GCAAATGAAAATAACAGAACTGCGTCTTGCAAAGCTTTTCTCGACGAAACAAAACGCCTCTTCAACGAAGGAGAGCTATCCTCCTGCTTTTGCACGAAAAGTAGAAGAAG
ATCGTGTGAGCATTATCGGAGGGCATCTAAGTACTGCGTCTGGAGCTTCAACTGGAAAAACGTTACAAACTTTAACTCGAACTCGACCACCAATTACAACCCACGTGTTG
GATGTTGCACGAGGATCTCCAGCTGCAGGTATTGACGTTCGTTTGGAAAGGTGGATAGGTACTCAACCACGCCCCTTATTCGGTGAGGTCGATGTTGGTGGCTGGGCGCT
CGAAGGGTCTTCAGCAACAGATAAAGATGGTAGAAGTGGCCAATTGTTGAGCATGATTGAAGCTATAAACCCAGGAATATACAGAATAAGCTTCAACACAGGCAAGTATT
TCCCTGCTGGGTTCTTCCCGTACGTTTCTATCGTGTTCGAAATCAGGGAATCCCAGAAGCTGGAACACTTCCATGTCCCTCTCCTGCTTTCACCATTCTCATTTTCCACC
TATCGTGGAAGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTTTTTATCCAAAATGGACAAAATCAACCAACTGAACCCATAGAAACACCCGATCGCCAGCGGAGCAGCAGAGCGAGGCGTAGTGACCCGACTGCAGAGAGGGAAGAG
CGAGAAAGAGAAGAAAGTGACTGGGGATCACCGATCGGTGGCAGTAACGATGGCGGCGAGTTATGATTTTGGAGAGGAAGAGTTTCAGGCATGCTGTGGAAGCTCCAAAT
TCGCCAGAGAAATGGTTTCCGTTTCCCCTTTTTTCTCCTTGGAACAAGCTGTAGATGCAGCTAGACGCATCTGGTTTAATCAGGTCGATGTGAATGGTTGGCTGGAAGCA
TTCTCTGCTCATCCACAGATTGGTCAAGCGTCTAAATCATCCAATCAGACGAGTGCTCAATGGAGTAAGGGAGAGCAGTCAACTGCACTGGCAACTGCTACTGGTTCTAG
CTTACAGGAGCTAGCTGAATGGAATATTCAGTACCAGAAAAAGTTCGGATTTATATTTCTTATTTGTGCATCTGGAAGGAGCACCGACGAAATACTTGCAGAATTAAAGA
AACGGTATTCAAATAGACCCATAGTTGAGTTTGAGATTGCTGCTCAAGAGCAAATGAAAATAACAGAACTGCGTCTTGCAAAGCTTTTCTCGACGAAACAAAACGCCTCT
TCAACGAAGGAGAGCTATCCTCCTGCTTTTGCACGAAAAGTAGAAGAAGATCGTGTGAGCATTATCGGAGGGCATCTAAGTACTGCGTCTGGAGCTTCAACTGGAAAAAC
GTTACAAACTTTAACTCGAACTCGACCACCAATTACAACCCACGTGTTGGATGTTGCACGAGGATCTCCAGCTGCAGGTATTGACGTTCGTTTGGAAAGGTGGATAGGTA
CTCAACCACGCCCCTTATTCGGTGAGGTCGATGTTGGTGGCTGGGCGCTCGAAGGGTCTTCAGCAACAGATAAAGATGGTAGAAGTGGCCAATTGTTGAGCATGATTGAA
GCTATAAACCCAGGAATATACAGAATAAGCTTCAACACAGGCAAGTATTTCCCTGCTGGGTTCTTCCCGTACGTTTCTATCGTGTTCGAAATCAGGGAATCCCAGAAGCT
GGAACACTTCCATGTCCCTCTCCTGCTTTCACCATTCTCATTTTCCACCTATCGTGGAAGCTAGTAGTTCACTGTTCATATGACTGCATTTCTGTCATGCATCTTGATGC
CCTTCGGATTCTGGCAAGGGTTGAATAAAGCGACGTCGACTGATACTAAACGATGTTGAATGTATCGAATGCTGTATTACATGGAAAAACTCTGCAAATTACCTCATAGA
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GTTAATTCTGTCTGTAAATTTCATAAAACCAAACTGATTGCCTAATAATTTGGAGCTTTGCTAGAAGGGTTTGCCAATCTAGAGTTCTCCTATTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FIFLICASGRSTDEILAELKKRYSNRPIVEFEIAAQEQMKITELRLAKLFSTKQNASSTKESYPPAFARKVEEDRVSIIGGHLSTASGASTGKTLQTLTRTRPPITTHVL
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YRGS