; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg06559 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg06559
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein LAX PANICLE 2-like
Genome locationCarg_Chr14:10720421..10721227
RNA-Seq ExpressionCarg06559
SyntenyCarg06559
Gene Ontology termsGO:0007275 - multicellular organism development (biological process)
InterPro domainsIPR044171 - Protein LAX PANICLE 2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581987.1 hypothetical protein SDJN03_21989, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-12199.1Show/hide
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KAG7018408.1 hypothetical protein SDJN02_20276, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-133100Show/hide
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XP_022955779.1 uncharacterized protein LOC111457668 isoform X1 [Cucurbita moschata]8.9e-13097.49Show/hide
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XP_022955780.1 uncharacterized protein LOC111457668 isoform X2 [Cucurbita moschata]4.3e-11691.21Show/hide
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XP_023527520.1 uncharacterized protein LOC111790726 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-12494.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYQ8 Uncharacterized protein2.3e-4650.53Show/hide
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        MTMVAALNH SKH      GG DHLMN G P+C+QY     +GS        +PPMA+ D ++ +  H Q+PSN D D WLQLSIG  G GG       D
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        Q E      +S LVELDLLPG    RDI  +   WV D SSPE   TSKTET  ETGI +PL       S+F   +IN A              + PSTS
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         + SS S   S               S+ VD ATA AG SSD+RIINPPRRP SGIWFTLKALENQ K+PFLPQISK+YLRIK
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A0A6J1GW07 uncharacterized protein LOC111457668 isoform X22.1e-11691.21Show/hide
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A0A6J1GX93 uncharacterized protein LOC111457668 isoform X14.3e-13097.49Show/hide
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A0A6J1I8S9 protein LAX PANICLE 2-like1.2e-3949.21Show/hide
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        MTM+ A   LS+H P GG      GGDHLMNA PP+  +     YS    I  +PPMA DDDS+ NS + + PSN D D WLQLSIGR          P 
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         TS LVELDLLPGG    D PT  T   D  +PEA  T+++ET  +     P  S+F   +IN A  +   S    SSSF                   S
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Query:  IRVDATAAGTSSDIRIINPPRRPGSGIWFTLKALENQRKQPFLPQISKSYLRIK
          V A  AG SSD+RIINPPRRP SGIWFTLKALENQ K PFLPQISK+YLRIK
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A0A6J1INX5 uncharacterized protein LOC1114792024.6e-10887.08Show/hide
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        MPPSIPPDMTMVAALNHLSKH  CGG GGG HLMN GPPICDQYSSSSCIGS+PPMADDD+SSPNSLHHQSPSNT DHDAWLQLSIGRVGVGGDQYEIPR
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        TTSPLVELDLLPGG                  PEAVITSKTET TETGI MP CSSFNLTDINVAQTYPSTSTMLSSSSFHSSIPSI VDATAAGTSSDI
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        RIINPPRRP SGIWFTLKALENQRKQPFLPQISKSYLRIK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
G3XKQ9 Protein LAX PANICLE 24.6e-0439.06Show/hide
Query:  SFHSSIPSIRVDATAAGTSSDIRIINPPR--RPGSGIWFTLKALENQRKQPFLPQISKSYLRIK
        +F+++ P+    A++   +  IR++ PP      +G+WF L+A   Q ++PFLPQI +SYLRIK
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28080.1 RING finger protein4.7e-1230.63Show/hide
Query:  PGGGDHLMNAGPPICDQYSS-SSCIGSNPPMADDDDSSPNSLHHQSPSNTDHDAWLQLSIGRVGVGGD---QYEIPRTTSPLV--ELDLLPGGHHPRDIP
        PG  D+   +  P+ D  ++  + +  +  + D+ D S   L      NTD    LQ    + G G +   +  +  ++S  V   +D LP    P  +P
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Query:  TDPTWVLDISSPEAVIT---SKTETETETGIRMPLCSSFNLTDINVAQTYPSTSTMLSSSSFHSSIPSIRVDATAAGTSSDIRIINPPRRPGSGIWFTLK
             +L +  P  V      K +T    G   P  SS       +A   PS+ +    ++ +S   S  VD   AG SS+ R+++PPRRP SG+WF L+
Subjt:  TDPTWVLDISSPEAVIT---SKTETETETGIRMPLCSSFNLTDINVAQTYPSTSTMLSSSSFHSSIPSIRVDATAAGTSSDIRIINPPRRPGSGIWFTLK

Query:  ALENQRKQPFLPQISKSYLRIK
        A + Q ++PFLPQ++KSYLRIK
Subjt:  ALENQRKQPFLPQISKSYLRIK

AT5G13250.1 RING finger protein3.6e-1232.28Show/hide
Query:  MADDDDSSPNSLH---HQSPSNTDHDAWLQLSIGRVGVGGDQYEIPRTTSPLVELDLLPGGH--HPRDIPTDPTWVLDISSPEAVITSKTETETETGIRM
        +  ++D  P+  H   HQ+      D++L+L++   G   ++ E+    S L       GG   +P    T P    D+  P A    +T    +   + 
Subjt:  MADDDDSSPNSLH---HQSPSNTDHDAWLQLSIGRVGVGGDQYEIPRTTSPLVELDLLPGGH--HPRDIPTDPTWVLDISSPEAVITSKTETETETGIRM

Query:  PLCSSFNLTDINVAQTYPSTSTMLSSSSFHSSIPSIRVDATAAGTSSDIRIINPPRRPGSGIWFTLKALENQRKQPFLPQISKSYLRIK
           SS +L         P        SSF   +         AG SS +R+I+PPRRP SGIWF L+A +NQ  +PFLPQI KSYLRIK
Subjt:  PLCSSFNLTDINVAQTYPSTSTMLSSSSFHSSIPSIRVDATAAGTSSDIRIINPPRRPGSGIWFTLKALENQRKQPFLPQISKSYLRIK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTCCCTCTATTCCACCGGATATGACAATGGTCGCTGCCCTAAACCACCTCTCCAAACACCCTCCTTGCGGCGGCCCAGGCGGCGGCGACCACCTCATGAATGCTGG
CCCTCCAATTTGTGATCAATATTCTTCCTCTTCTTGCATAGGATCTAATCCTCCCATGGCGGATGATGATGACTCCTCTCCTAATTCTCTTCATCATCAATCCCCTTCCA
ATACTGATCATGATGCTTGGCTTCAATTAAGCATCGGCCGTGTCGGCGTCGGTGGAGACCAATATGAGATACCTCGAACCACCTCCCCTTTGGTCGAGCTAGATCTATTA
CCTGGCGGCCACCACCCTCGAGATATTCCAACCGATCCTACGTGGGTTTTGGATATCTCGAGCCCTGAGGCTGTAATAACATCCAAAACGGAGACGGAGACGGAGACAGG
GATAAGGATGCCTTTGTGTTCTTCTTTCAATTTGACTGATATCAACGTAGCTCAAACGTACCCATCGACATCAACCATGTTATCTTCTTCTTCTTTTCACTCGAGCATAC
CATCTATCAGGGTCGACGCTACGGCGGCCGGGACAAGCTCCGATATCAGAATCATAAACCCTCCCCGGCGACCCGGTTCGGGTATTTGGTTTACATTGAAAGCCTTGGAA
AATCAAAGAAAGCAACCATTTTTGCCTCAGATATCAAAAAGCTATTTAAGAATCAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTCCCTCTATTCCACCGGATATGACAATGGTCGCTGCCCTAAACCACCTCTCCAAACACCCTCCTTGCGGCGGCCCAGGCGGCGGCGACCACCTCATGAATGCTGG
CCCTCCAATTTGTGATCAATATTCTTCCTCTTCTTGCATAGGATCTAATCCTCCCATGGCGGATGATGATGACTCCTCTCCTAATTCTCTTCATCATCAATCCCCTTCCA
ATACTGATCATGATGCTTGGCTTCAATTAAGCATCGGCCGTGTCGGCGTCGGTGGAGACCAATATGAGATACCTCGAACCACCTCCCCTTTGGTCGAGCTAGATCTATTA
CCTGGCGGCCACCACCCTCGAGATATTCCAACCGATCCTACGTGGGTTTTGGATATCTCGAGCCCTGAGGCTGTAATAACATCCAAAACGGAGACGGAGACGGAGACAGG
GATAAGGATGCCTTTGTGTTCTTCTTTCAATTTGACTGATATCAACGTAGCTCAAACGTACCCATCGACATCAACCATGTTATCTTCTTCTTCTTTTCACTCGAGCATAC
CATCTATCAGGGTCGACGCTACGGCGGCCGGGACAAGCTCCGATATCAGAATCATAAACCCTCCCCGGCGACCCGGTTCGGGTATTTGGTTTACATTGAAAGCCTTGGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PGGHHPRDIPTDPTWVLDISSPEAVITSKTETETETGIRMPLCSSFNLTDINVAQTYPSTSTMLSSSSFHSSIPSIRVDATAAGTSSDIRIINPPRRPGSGIWFTLKALE
NQRKQPFLPQISKSYLRIK