; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg06699 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg06699
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor MYB1R1-like
Genome locationCarg_Chr18:717104..718018
RNA-Seq ExpressionCarg06699
SyntenyCarg06699
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR006447 - Myb domain, plants
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017884 - SANT domain
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573031.1 hypothetical protein SDJN03_26918, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.9e-8398.77Show/hide
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KAG7012220.1 hypothetical protein SDJN02_24972 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-89100Show/hide
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XP_022954795.1 transcription factor MYB1R1-like [Cucurbita moschata]9.1e-8499.39Show/hide
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XP_022994648.1 transcription factor MYB1R1-like [Cucurbita maxima]6.5e-8297.55Show/hide
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XP_023541660.1 transcription factor MYB1R1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.0e-8298.16Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7ULN5 Transcription factor MYB1R12.2e-6784.43Show/hide
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A0A5D3BJ54 Transcription factor MYB1R12.2e-6784.43Show/hide
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A0A6J1C6U7 transcription factor MYB1R1-like1.6e-7082.49Show/hide
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A0A6J1GTF0 transcription factor MYB1R1-like4.4e-8499.39Show/hide
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A0A6J1K5R0 transcription factor MYB1R1-like3.2e-8297.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8A9B2 Transcription factor MYBS13.1e-2653.45Show/hide
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        A   D  G  +  +     R++    G    D     S   +ER++G+PWTEEEH+LFLLGL K GKGDWR ISRNFV +RTPTQVASHAQKYF+R +++
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        NR RRRSS+ DIT+ T
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Q2V9B0 Transcription factor MYB1R11.1e-5573.12Show/hide
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        +   GG   EIMLFGVRV VDPMRKSVS+N+LSQY+HP A +N++NGG++  +   A+ +     GYASADDAV + S   RERKRGVPWTEEEHKLFLL
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        GL KVGKGDWRGISRNFVKTRTPTQVASHAQKYFLRRSNLNRRRRRSSLFDITTD+V+++
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Q7XC57 Transcription factor MYBS36.2e-3555.56Show/hide
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        + +FGVR+    +RKS SM NLS      + +   +GG S  +    +    +A GYAS D    +S   R+RK+GVPWTEEEH+ FLLGL K+GKGDWR
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        GISRNFV +RTPTQVASHAQKYF+R+SN+ RR+RRSSLFD+  D
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Q9FKF9 Probable transcription factor At5g616201.8e-2646.88Show/hide
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        GV K  + LFGV +  DP        +RKS+S+ NL        ++ND++ G S   I+A +       GY S D  + +  G    E+K+G PWTEEEH
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        + FL+GL+K+GKGDWRGI+++FV TRTPTQVASHAQKYF+R +  ++R+RR+SLFDI+ +
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Q9LVS0 Transcription factor KUA15.6e-3657.82Show/hide
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        + LFGVR+    +RKS SM NLS Y    +      G N+ G  S  +  ++ A  GYAS +D V  S  +RERK+G PWTEEEH++FLLGL K+GKGDW
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        RGISRN+V TRTPTQVASHAQKYF+R+SN++RR+RRSSLFD+  D V
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19000.1 Homeodomain-like superfamily protein6.6e-4866.67Show/hide
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        G   EIMLFGVRVVVDPMRK VS+NNLS Y+        P  V+     G  K    A       A GYASA+DAV  S  +  RKRGVPWTE EHK FL
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        +GL KVGKGDW+GISRNFVK+RTPTQVASHAQKYFLRR+NLNRRRRRSSLFDITT+TVT
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AT1G19000.2 Homeodomain-like superfamily protein6.6e-4866.67Show/hide
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        G   EIMLFGVRVVVDPMRK VS+NNLS Y+        P  V+     G  K    A       A GYASA+DAV  S  +  RKRGVPWTE EHK FL
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        +GL KVGKGDW+GISRNFVK+RTPTQVASHAQKYFLRR+NLNRRRRRSSLFDITT+TVT
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AT1G70000.1 myb-like transcription factor family protein1.6e-4664.42Show/hide
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        T   D+   GG  K IMLFGVRV        RKSVSMNNLSQ+   P  +  D+G                  GYAS DD V  SG NRERKRG PWTEE
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        EH+LFL GLHKVGKGDWRGISRNFVKTRTPTQVASHAQKYFLRR+N NRRRRRSSLFDIT D+
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AT1G74840.1 Homeodomain-like superfamily protein1.4e-5066.46Show/hide
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        +    G  +EIMLFGVRVV+DPMRK VS+NNLS Y+        D     + +++       + AGYASAD+A+P  +S G  ERKRGVPWTEEEHKLFL
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        LGL +VGKGDW+GISRNFVKTRT TQVASHAQKYFLRRSNLNRRRRRSSLFD+TTDTV
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AT1G74840.2 Homeodomain-like superfamily protein1.4e-5066.46Show/hide
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        +    G  +EIMLFGVRVV+DPMRK VS+NNLS Y+        D     + +++       + AGYASAD+A+P  +S G  ERKRGVPWTEEEHKLFL
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Query:  LGLHKVGKGDWRGISRNFVKTRTPTQVASHAQKYFLRRSNLNRRRRRSSLFDITTDTV
        LGL +VGKGDW+GISRNFVKTRT TQVASHAQKYFLRRSNLNRRRRRSSLFD+TTDTV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGACCGACGTTCCTGATTCCGCCGTCTCCGGCGGCGTTACCAAGGAAATCATGTTGTTCGGAGTTAGAGTCGTGGTGGACCCGATGAGGAAGAGCGTCAGTATGAA
CAATCTCTCTCAGTATCAGCATCCTCCTGCGGTTTCCAATGATGATAACGGCGGTAATAGTAAGGGTAATATCTCCGCCGCTGAGAGGAAGGAAAATTCGGCTGCTGGTT
ATGCTTCTGCGGACGATGCCGTTCCCAATTCCGGTGGGAATCGTGAACGCAAGCGAGGAGTACCATGGACGGAGGAAGAGCACAAACTTTTCTTGCTGGGATTGCATAAA
GTGGGGAAAGGGGATTGGAGAGGAATTTCAAGGAATTTCGTTAAAACTCGAACCCCAACTCAGGTGGCTAGCCACGCTCAAAAATACTTTCTACGCCGAAGCAACTTAAA
TCGCCGCCGCCGTAGATCCAGCCTCTTTGATATCACCACGGATACGGTAACTCTCATCTTTACAAAATTTATAACTTCTGTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTGATATTGTTGTTTAATTTCGGTGGGTTTCTTTTTCCTTTTCTGAAATTTGTACTGCGTCGTCGAAGTTGCCGATGACGACCGACGTTCCTGATTCCGCCGTCTCCGG
CGGCGTTACCAAGGAAATCATGTTGTTCGGAGTTAGAGTCGTGGTGGACCCGATGAGGAAGAGCGTCAGTATGAACAATCTCTCTCAGTATCAGCATCCTCCTGCGGTTT
CCAATGATGATAACGGCGGTAATAGTAAGGGTAATATCTCCGCCGCTGAGAGGAAGGAAAATTCGGCTGCTGGTTATGCTTCTGCGGACGATGCCGTTCCCAATTCCGGT
GGGAATCGTGAACGCAAGCGAGGAGTACCATGGACGGAGGAAGAGCACAAACTTTTCTTGCTGGGATTGCATAAAGTGGGGAAAGGGGATTGGAGAGGAATTTCAAGGAA
TTTCGTTAAAACTCGAACCCCAACTCAGGTGGCTAGCCACGCTCAAAAATACTTTCTACGCCGAAGCAACTTAAATCGCCGCCGCCGTAGATCCAGCCTCTTTGATATCA
CCACGGATACGGTAACTCTCATCTTTACAAAATTTATAACTTCTGTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTTDVPDSAVSGGVTKEIMLFGVRVVVDPMRKSVSMNNLSQYQHPPAVSNDDNGGNSKGNISAAERKENSAAGYASADDAVPNSGGNRERKRGVPWTEEEHKLFLLGLHK
VGKGDWRGISRNFVKTRTPTQVASHAQKYFLRRSNLNRRRRRSSLFDITTDTVTLIFTKFITSV