; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg06791 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg06791
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptioncycloeucalenol cycloisomerase
Genome locationCarg_Chr18:1268421..1269350
RNA-Seq ExpressionCarg06791
SyntenyCarg06791
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0047793 - cycloeucalenol cycloisomerase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR020532 - Cycloeucalenol cycloisomerase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573123.1 Cycloeucalenol cycloisomerase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.4e-4096.55Show/hide
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KAG7012310.1 Cycloeucalenol cycloisomerase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-82100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UM17 Cycloeucalenol cycloisomerase8.9e-2881.69Show/hide
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A0A6J1E6Z0 cycloeucalenol cycloisomerase-like9.5e-3057.35Show/hide
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A0A6J1GR71 cycloeucalenol cycloisomerase7.0e-4197.7Show/hide
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A0A6J1K570 cycloeucalenol cycloisomerase-like isoform X12.9e-3488.51Show/hide
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A0A6J1KJU7 cycloeucalenol cycloisomerase-like6.2e-2984.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9M643 Cycloeucalenol cycloisomerase2.0e-2471.01Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G50375.1 cyclopropyl isomerase1.4e-2571.01Show/hide
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AT5G50375.2 cyclopropyl isomerase1.4e-2571.01Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTGGTGTTTCTCTAAGATTCACATGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGCAGTCATCCTCAGTCATCGGCTTTGTGCTGTAATCTTGGAATTGCGAAGCCAGAAACTACACTCTTCTCTCTGTTTTCAGATTTCAGTCGGAGAATTTCAAGCCGAGA
TCGATCAACCTCGTTCAGATTCTTAATCGCTGTAATGGCCGATCGAGCGCGCGCTCCCGCTCCCGCTCCCTCTCTCGCTCGTTCTTTTAGCCTATGGCTCTCTACGAATC
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CTGGTGTTTCTCTAAGATTCACATGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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