; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg07023 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg07023
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionhistone-lysine N-methyltransferase SETD1B-like
Genome locationCarg_Chr01:3869417..3870010
RNA-Seq ExpressionCarg07023
SyntenyCarg07023
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007789 - Protein of unknown function DUF688


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607361.1 hypothetical protein SDJN03_00703, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-10497.99Show/hide
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KAG7037033.1 hypothetical protein SDJN02_00654, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-106100Show/hide
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XP_022949317.1 uncharacterized protein LOC111452704 [Cucurbita moschata]8.1e-10598.49Show/hide
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XP_022997732.1 uncharacterized protein LOC111492604 [Cucurbita maxima]1.5e-10397.49Show/hide
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XP_038894794.1 uncharacterized protein LOC120083212 [Benincasa hispida]3.1e-4861.11Show/hide
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        +  NS D GGK  KMRLK L+TRDD+  V +EDYHTGVSA+VPF WESEPGTPKANF ++G++LSPLTPPPSYFS+    +++P  H +++ P  S++NF
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        L SVF+KLSV K  L P SP GS SSSSS+ +SSE  R  SPRRLSFDSRVD    +D+ +++ N +SPVSTLFFG G   SDKG  CYPKLVKVF++
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LYC9 Uncharacterized protein1.7e-4458.5Show/hide
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        NSG+ G GK GKMRLK L+ R+D+ T+   +EDYHTG+SA+VPF WESEPGTPKAN  D    SLLSPLTPPPSYFS+    + +P  H  ++ P  ++ 
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        +FL +VF+KLSV  + L P SP SSSSSSST+   E  R  SPRRLSFDSRVD++  +D+E E+ N +SPVSTLFFGR    SDKG  CYPKLVKVF+++
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A0A1S3C5A7 uncharacterized protein At4g009505.1e-4459.5Show/hide
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        NSG+  GGK GKMRLK L+TRDD   I+  +EDYHTG+SA+VPF WESEPGTPKAN  D  +GSLLSPLTPPPSYFS+    + +P  H  ++ P  ++ 
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        + L +VF+ LSV K  L P SP SSSSSS T+   E  R  SPRRLSFDSRVD+++ ED+E E+ N +SPVSTLFFGRG   S+KG  CYP LVKVF++H
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A0A5D3BF70 NADPH oxidase activator5.1e-4459.5Show/hide
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A0A6J1GBP3 uncharacterized protein LOC1114527043.9e-10598.49Show/hide
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A0A6J1K5W9 uncharacterized protein LOC1114926047.4e-10497.49Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein1.6e-1036.26Show/hide
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        + V+ DY+ G SA VPF WES+PGTP+   +   S            + +PLTPPPSYF +SPS T  KH    +P  +   F + + K  SV      P
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Query:  LSPGSSSSSSSTLTSSEGERGRSPRRLSFDSRVDENEHEDEEEEEENFDSPVSTLFFGRGGGSSDKGCYCYPKLVKVFSKHC
         SP SSSSSSS+   S      SP R S  S                F+S  S  +    G +S K   CY  LVKV  + C
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AT2G40475.1 unknown protein3.1e-0936.55Show/hide
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        Y+ G  A+VPF+WE+ PGTPK         L PLTPPPSY+SS S   S +K +      +  F+ ++  +  V++      S  SSSSSS + +S   +
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Query:  RGRSPRRLSFDSRVDENEHEDEEEEEENFDSPVSTLFFGRGGGSS
            PR+    SR   +  ++++EEE    SP STL + RG  SS
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AT3G56260.2 unknown protein2.6e-0835.85Show/hide
Query:  DDILTVDED---YHTGVSATVPFIWESEPGTPKANFRDHGSLLSPLTPPPSYFSSPSHTPSKHKYNTNPHPSRANFLTSVFKKLSVNKAPLHPLSPGSSS
        +D   +DE+   Y+ G  A++PFIWES PGTPK +     SL  PLTPPPSY+S  S   S  +  +      + FL+  F   S  +   H     +SS
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Query:  SSSSTLTSSEGERGRSP-----RRLSFDSRVDENEHEDEEEEEENFDSPVSTLFFGRGG
        S S + TSS      SP     +R+S D +        EE+E  +  SP STL    GG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAACAAATTCAGGGGATTTTGGAGGCAAATTTGGGAAAATGAGGCTTAAAAGCCTCAAAACAAGGGATGATATATTGACAGTGGATGAAGATTACCACACAGGAGT
ATCAGCCACAGTGCCATTCATATGGGAGTCCGAGCCAGGCACTCCCAAGGCCAATTTCAGGGACCATGGCTCACTCCTTTCCCCTCTCACGCCCCCACCATCCTATTTCT
CCTCACCCTCACACACACCCTCCAAGCATAAATATAACACCAACCCACATCCCTCTCGAGCCAATTTCCTCACCTCGGTTTTCAAGAAGCTTTCTGTGAATAAGGCTCCT
CTCCATCCGCTCTCTCCCGGCTCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGACACTGACAAGCTCTGAGGGAGAGAGAGGAAGAAGCCCGAGGAGATTGTCGTTTGATTCGAGAGTGGA
CGAGAACGAGCACGAGGACGAAGAAGAGGAAGAGGAGAATTTCGACTCGCCTGTTTCGACTTTGTTCTTTGGACGTGGCGGAGGATCGAGTGATAAAGGATGCTATTGCT
ATCCAAAGTTGGTGAAGGTATTCTCCAAGCATTGTTCTAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAACAAATTCAGGGGATTTTGGAGGCAAATTTGGGAAAATGAGGCTTAAAAGCCTCAAAACAAGGGATGATATATTGACAGTGGATGAAGATTACCACACAGGAGT
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CTCCATCCGCTCTCTCCCGGCTCCTCGTCGTCGTCGTCGTCGACACTGACAAGCTCTGAGGGAGAGAGAGGAAGAAGCCCGAGGAGATTGTCGTTTGATTCGAGAGTGGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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