; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg07055 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg07055
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL63-like
Genome locationCarg_Chr01:3657317..3658060
RNA-Seq ExpressionCarg07055
SyntenyCarg07055
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7037003.1 E3 ubiquitin-protein ligase ATL41, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.3e-131100Show/hide
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        E QNGQFHS S             SSSSSSTD P MSLGASLKRMLSRNRS+GRIFPSS+GDEL+V
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XP_023521602.1 RING-H2 finger protein ATL63-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.0e-12898.38Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C6K6 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X13.2e-8875Show/hide
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        F+S SSSSSS   PP M S+GASL R+LSRNRS+GRIFPSSNG+EL+V
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A0A6J1GBH1 RING-H2 finger protein ATL63-like7.6e-13099.19Show/hide
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A0A6J1HPE0 RING-H2 finger protein ATL63-like2.2e-10578.97Show/hide
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        E QNGQFHSSS                  SSSSSSTD P MSLGASLKRMLSRNRS+GRIFPSS+GDEL+V
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A0A6J1HZJ3 RING-H2 finger protein ATL63-like4.9e-10580.53Show/hide
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        E QNGQF+S S         SSSSSSTD P MSLGASLKRMLSRNRS+GRIFPSS+GDEL+V
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A0A6J1KH83 RING-H2 finger protein ATL63-like1.2e-12797.17Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22255 RING-H2 finger protein ATL648.6e-2236.09Show/hide
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        EEK+     EC +CLSEFEE + GR LP C H FH++CID W  S + CP+CRAPV    + +E+G  S
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Q8L9T5 RING-H2 finger protein ATL23.5e-2334.31Show/hide
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        ++ +  ++L+A++ L  VV+ ++ LH YA  +  R R RH +R S N     V +   P   +             S+GLD +VI ++P+F +  E  K 
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           +EC +CLSEFEE E GR LP C H FH++CIDMW +SH+ CP+CR+ V + A +ES   + ERE+   + ++     E   +     + H S SS  
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Query:  SSTD
           D
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Q9LUZ9 RING-H2 finger protein ATL631.8e-3548.07Show/hide
Query:  TSLSDFTQSIFSYNSNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFP------------RPRHRHAQRSSVNVSYVLGPPRLSRFE---SIPFDLGFAQSKGL
        +SLS F + + SYNSNV+LAAL+ LLLVVLFVLLLH YA  F+             R R R  +R +V  + ++    L  F+   S P        KGL
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Query:  DSSVISAIPLFVYESEEKKCATVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVAEAVESGRL
        DSSVIS+IPLFVYE  E++     ECVICL  +E  + GR+L  C HGFH+ECIDMWL+SH+ CP+CR+PV+A   +   L
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Q9SLC3 E3 ubiquitin-protein ligase ATL411.5e-1833.04Show/hide
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        S +  NS ++LAA+ SL  V+L V  LH YA   F   R R A R         G P + R    PF++     +GL+ +VI+++P F   + +   A+ 
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Query:  MECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVAE-AVESGRLSGEREIGEEIVTEERTNCEIQRNEEQNGQFHSSSSSSSSST
         EC +CLS  +E++  R LP C H FH++C+D WL + + CPVCR  V     +E     G      +++ E R N  ++          +SSSSS + T
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Query:  DPPSMSLGASLKRMLSRNRSNGRI
             S   S +++L+R RS+ RI
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Q9XF63 RING-H2 finger protein ATL34.0e-1934.57Show/hide
Query:  SNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPR-------PRHRHAQRSSVNVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQ----SKGLDSSVISAIPLFVYESEEK
        S +IL A+I L + VLFVL+LH YA  ++ R        + +  ++        + PP ++R +   F     Q    + GL S  +S++P+  +  +  
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Query:  KCATVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVAEAVESGR
         C   +EC ICLSE  + +  R LP CNH FH+ECIDMW  SH+ CP+CR  V+     S +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72310.1 RING/U-box superfamily protein2.8e-2034.57Show/hide
Query:  SNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPR-------PRHRHAQRSSVNVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQ----SKGLDSSVISAIPLFVYESEEK
        S +IL A+I L + VLFVL+LH YA  ++ R        + +  ++        + PP ++R +   F     Q    + GL S  +S++P+  +  +  
Subjt:  SNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPR-------PRHRHAQRSSVNVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQ----SKGLDSSVISAIPLFVYESEEK

Query:  KCATVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVAEAVESGR
         C   +EC ICLSE  + +  R LP CNH FH+ECIDMW  SH+ CP+CR  V+     S +
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AT2G42360.1 RING/U-box superfamily protein1.1e-1933.04Show/hide
Query:  SIFSYNSNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPRPRHRHAQRSSVNVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQSKGLDSSVISAIPLFVYESEEKKCATV
        S +  NS ++LAA+ SL  V+L V  LH YA   F   R R A R         G P + R    PF++     +GL+ +VI+++P F   + +   A+ 
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Query:  MECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVAE-AVESGRLSGEREIGEEIVTEERTNCEIQRNEEQNGQFHSSSSSSSSST
         EC +CLS  +E++  R LP C H FH++C+D WL + + CPVCR  V     +E     G      +++ E R N  ++          +SSSSS + T
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Query:  DPPSMSLGASLKRMLSRNRSNGRI
             S   S +++L+R RS+ RI
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AT2G47560.1 RING/U-box superfamily protein6.1e-2336.09Show/hide
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        T S ++ N  ++L+++I L + V+ +L  H+YA   F R   R  +R   ++  +   PR                + LD +V+  IP+FVY S      
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        EEK+     EC +CLSEFEE + GR LP C H FH++CID W  S + CP+CRAPV    + +E+G  S
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AT3G16720.1 TOXICOS EN LEVADURA 22.5e-2434.31Show/hide
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        ++ +  ++L+A++ L  VV+ ++ LH YA  +  R R RH +R S N     V +   P   +             S+GLD +VI ++P+F +  E  K 
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           +EC +CLSEFEE E GR LP C H FH++CIDMW +SH+ CP+CR+ V + A +ES   + ERE+   + ++     E   +     + H S SS  
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Query:  SSTD
           D
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AT5G58580.1 TOXICOS EN LEVADURA 631.3e-3648.07Show/hide
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        +SLS F + + SYNSNV+LAAL+ LLLVVLFVLLLH YA  F+             R R R  +R +V  + ++    L  F+   S P        KGL
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Query:  DSSVISAIPLFVYESEEKKCATVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVAEAVESGRL
        DSSVIS+IPLFVYE  E++     ECVICL  +E  + GR+L  C HGFH+ECIDMWL+SH+ CP+CR+PV+A   +   L
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Sequences Show/hide sequences
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