; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg07069 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg07069
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionVARLMGL domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr01:3575196..3576434
RNA-Seq ExpressionCarg07069
SyntenyCarg07069
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR032795 - DUF3741-associated sequence motif


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607312.1 hypothetical protein SDJN03_00654, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-22299.51Show/hide
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KAG7036990.1 hypothetical protein SDJN02_00610, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.4e-223100Show/hide
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XP_022997806.1 uncharacterized protein LOC111492651 [Cucurbita maxima]7.7e-19089.08Show/hide
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A0A1S3C6M1 uncharacterized protein LOC1034970726.5e-14267.91Show/hide
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A0A5A7SKY9 Transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X25.5e-14167.67Show/hide
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A0A5D3BBU9 Transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X26.5e-14267.91Show/hide
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A0A6J1G9P3 uncharacterized protein LOC1114522113.6e-20192.48Show/hide
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A0A6J1K8I1 uncharacterized protein LOC1114926513.7e-19089.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G58630.1 unknown protein1.0e-1428.28Show/hide
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        PSP+ S +    T +F               C+S IL+R LCSG+  T+PSD  TE   S KS D +     ++    G       G VARLMGLD++P 
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Query:  MKQNCNSIARTQSMNSVEHFYKHLEGRHKGVRSTQSFREIPTFLELENEDYFILSFEGDSKNEELKAKARRHGEEKCKNR-----GSNKTE---HSYVRK
        + +    ++R+ S+N ++     ++G+H+ V+ST        ++ELE++D+FILSFE D  ++EL       G   CK R       +KTE   H   ++
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Query:  TKKKIFNPEEANEFVLIDLKQKKKSRKRVSRNKPTSRISTKDRHG-----------------------RRSTRKVESEQSSDELSPVSVLDSSEFLRDSE
              N     E + I    +++  KR SR K   R  TK R                          RST++ E   S D+ SPVSVLD   +     
Subjt:  TKKKIFNPEEANEFVLIDLKQKKKSRKRVSRNKPTSRISTKDRHG-----------------------RRSTRKVESEQSSDELSPVSVLDSSEFLRDSE

Query:  EAAPLSGFISLSSTNPNSDSSICVQNSLNRTLSGDAASKSPVN-SRRKLSPELEISQRPSRNDDDLII----KEGNPAKTKAIEE---EICKITEMELGK
                                        +G   + SP N SRR+LS ELE S+     + D I      +    +    +E    ICK+T  +L  
Subjt:  EAAPLSGFISLSSTNPNSDSSICVQNSLNRTLSGDAASKSPVN-SRRKLSPELEISQRPSRNDDDLII----KEGNPAKTKAIEE---EICKITEMELGK

Query:  SNWNYRKFCEEHEELGVESIIEGFDSFILEGLIEE
        S+W   K  +  +  G+  I E   S IL+ L+EE
Subjt:  SNWNYRKFCEEHEELGVESIIEGFDSFILEGLIEE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCTTTCGGGAATTCTCCGCCGAATTCTCTGCTCCGGTAGCCTCCCGACGCACCCGTCCGATCAGACTACAGAAGAAACCAGCTCATTAAAGTCTGAGGACAATGTTAAGA
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CTTTCTCGAGCTTGAAAATGAAGATTACTTTATCCTAAGCTTCGAAGGAGACAGCAAAAATGAAGAACTCAAAGCGAAAGCAAGAAGGCATGGAGAAGAAAAATGCAAAA
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CTTCAATTTGTGTCCAAAATTCCTTAAATCGCACTCTTTCAGGAGACGCCGCTTCGAAATCCCCCGTAAACAGTCGAAGGAAATTATCACCGGAGCTCGAAATCTCTCAG
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GAATTGGAATTACAGGAAATTTTGTGAAGAACATGAAGAACTTGGAGTTGAGAGTATAATTGAAGGTTTTGATTCGTTCATTCTTGAAGGATTGATAGAGGAATTTGCAG
AACAAATGTACGATTCGATCTTCATCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KSRKRVSRNKPTSRISTKDRHGRRSTRKVESEQSSDELSPVSVLDSSEFLRDSEEAAPLSGFISLSSTNPNSDSSICVQNSLNRTLSGDAASKSPVNSRRKLSPELEISQ
RPSRNDDDLIIKEGNPAKTKAIEEEICKITEMELGKSNWNYRKFCEEHEELGVESIIEGFDSFILEGLIEEFAEQMYDSIFI