; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg07082 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg07082
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionPhotosystem II stability/assembly factor
Genome locationCarg_Chr17:7695228..7697328
RNA-Seq ExpressionCarg07082
SyntenyCarg07082
Gene Ontology termsGO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR015943 - WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily
IPR028203 - Photosynthesis system II assembly factor Ycf48/Hcf136-like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575719.1 Photosystem II stability/assembly factor, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-14699.63Show/hide
Query:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
        MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAAT+SLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
Subjt:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD

Query:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
        RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
Subjt:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI

Query:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

KAG7014274.1 Photosystem II stability/assembly factor, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-147100Show/hide
Query:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
        MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
Subjt:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD

Query:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
        RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
Subjt:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI

Query:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQV
        YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQV
Subjt:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQV

XP_022953181.1 photosystem II stability/assembly factor HCF136, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]4.9e-14598.88Show/hide
Query:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
        MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNS INRRQFVAETAAT+SLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
Subjt:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD

Query:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
        RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAG SWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
Subjt:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI

Query:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

XP_022991485.1 photosystem II stability/assembly factor HCF136, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]8.4e-14598.51Show/hide
Query:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
        MATLQQLLKPSWSSSLFAS+SPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAAT+SLSLSPFI PVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
Subjt:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD

Query:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
        RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAG SWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
Subjt:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI

Query:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

XP_023548135.1 photosystem II stability/assembly factor HCF136, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.4e-14598.13Show/hide
Query:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
        MATLQQLLKPSWSSSLFAS+SPRHSLSSTTPKASLQNSS+NRRQFVAETAAT+SLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
Subjt:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD

Query:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
        RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAG SWERIPLSAQLPGDMVYIKATG+KSAEMVTDEGAI
Subjt:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI

Query:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5Y1 Photosystem II stability/assembly factor1.0e-13591.43Show/hide
Query:  MATL-QQLLKPSWSSSLFA-STSPRHS----------LSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVV
        MATL QQLLKPSW+SSLFA STSPRHS          LSSTTPKASL NSSINRR FVA+TAA +SLSLSPFIAPV PAKSEESLSEWERLYLPIDPGVV
Subjt:  MATL-QQLLKPSWSSSLFA-STSPRHS----------LSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVV

Query:  LLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGE
        LLDIAFVPDD++ GFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFN+ISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAG SWERIPLSAQLPGDMVYIKATGE
Subjt:  LLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGE

Query:  KSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        KSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  KSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

A0A1S3CFV0 Photosystem II stability/assembly factor2.6e-13691.4Show/hide
Query:  MATL-QQLLKPSWSSSLFASTSPRHSL----------SSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVL
        MATL QQLLKPSW+SSLFAS+SPRHSL          SST+PKASL NSSINRRQFVA+TAA +SLSLSPFIAPV PAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVL
Subjt:  MATL-QQLLKPSWSSSLFASTSPRHSL----------SSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVL

Query:  LDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEK
        LDIAFVPDDL+ GFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFN+ISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAG SWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEK
Subjt:  LDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEK

Query:  SAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        SAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDG YVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  SAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

A0A5D3CGP8 Photosystem II stability/assembly factor2.6e-13691.4Show/hide
Query:  MATL-QQLLKPSWSSSLFASTSPRHSL----------SSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVL
        MATL QQLLKPSW+SSLFAS+SPRHSL          SST+PKASL NSSINRRQFVA+TAA +SLSLSPFIAPV PAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVL
Subjt:  MATL-QQLLKPSWSSSLFASTSPRHSL----------SSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVL

Query:  LDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEK
        LDIAFVPDDL+ GFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFN+ISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAG SWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEK
Subjt:  LDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEK

Query:  SAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        SAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDG YVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  SAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

A0A6J1GMA2 Photosystem II stability/assembly factor2.4e-14598.88Show/hide
Query:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
        MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNS INRRQFVAETAAT+SLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
Subjt:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD

Query:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
        RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAG SWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
Subjt:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI

Query:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

A0A6J1JT27 Photosystem II stability/assembly factor4.1e-14598.51Show/hide
Query:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
        MATLQQLLKPSWSSSLFAS+SPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAAT+SLSLSPFI PVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD
Subjt:  MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLD

Query:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
        RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAG SWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI
Subjt:  RGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAI

Query:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  YVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82660 Photosystem II stability/assembly factor HCF136, chloroplastic3.6e-10676.89Show/hide
Query:  ASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDG
        AS+SP     S +P +S  + S +RR+ + ++AA +SLSLS  +    PA+++E LSEWER++LPIDPGVVLLDIAFVPD+  RGFLLGTRQT+LETKDG
Subjt:  ASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDG

Query:  GRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQET
        G TW PRSIPSAEEEDFNYRFN+ISFKGKEGWI+GKPAILLYT+DAG +W+RIPLS+QLPGDMV+IKAT +KSAEMVTDEGAIYVTSN+GYNWKAA+QET
Subjt:  GRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQET

Query:  VSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        VSATLNRTVSSGISGASYYTGTF+ VNRSPDGRYVAVSSRGNF+LTWEPGQ
Subjt:  VSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

P48325 Photosystem II stability/assembly factor HCF1361.3e-4751.3Show/hide
Query:  EWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSA
        +WE+  +P++   +LLDI FVPD   RG+LLGTR T+ ET D G+TW  RS+     ED  YR N+ISF GKEGW+ GKPAILL+T+D G SW RIPLS 
Subjt:  EWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSA

Query:  QLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPG
        QLPGD   I A G   AE+ TD GAIY T N G  WKA +QE +                   G   TV RS +G YVAVS++GNFY TW+ G
Subjt:  QLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPG

Q5Z5A8 Photosystem II stability/assembly factor HCF136, chloroplastic2.7e-10677.08Show/hide
Query:  TSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETA-ATISLSLSPFIAPVPP---AKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETK
        +S R       P+A   + S  RR+F+A+TA A+ + ++ P + P  P   A    SLSEWER+ LPIDPGVVLLDIAFVPDD   GFLLGTRQTILETK
Subjt:  TSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETA-ATISLSLSPFIAPVPP---AKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETK

Query:  DGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQ
        +GG TW PRSIPSAE+EDFNYRFN++SF GKEGWI+GKPAILL+TSDAG SWERIPLSAQLPG+MVYIKATGE+SAEMVTDEGAIYVTSN+GYNWKAAVQ
Subjt:  DGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQ

Query:  ETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        ETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  ETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

Q8DI95 Ycf48-like protein7.9e-4547.15Show/hide
Query:  WERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQ
        WE + LP      +LD++F+  D   G+L+G   T++ET+DGG+TW PR++     +  +YRFN++SF+G EGWIVG+P I+L+T+D G SW +IPL  +
Subjt:  WERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQ

Query:  LPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        LPG    IKA G  SAEM+T+ GAIY T + G NW+A VQE +                   G    +NRSP G YVAVSSRG+FY TWEPGQ
Subjt:  LPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

Q9AW48 Photosystem II stability/assembly factor HCF136, chloroplastic1.9e-6250.43Show/hide
Query:  INRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAE-EEDFNYRF
        INR +F       I+  L P +  + P  +  + + W ++ LP+D   VL DI F   +   G+L+G++ T LET DGG TW PR+  + + +E+  YRF
Subjt:  INRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDGGRTWAPRSIPSAE-EEDFNYRF

Query:  NAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTG
          ISF+G+EGW++GKPAI+LYT D G +W R+P+S +LPG+   IKA G +SAE+ T  GAIYVT+N G NWKA V+ET+ +TLNRT+SSG+SGASY+TG
Subjt:  NAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSATLNRTVSSGISGASYYTG

Query:  TFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
            V R+ +G+Y+A+SSRGNFYLTWEPGQ
Subjt:  TFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G23120.1 photosystem II stability/assembly factor, chloroplast (HCF136)2.5e-10776.89Show/hide
Query:  ASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDG
        AS+SP     S +P +S  + S +RR+ + ++AA +SLSLS  +    PA+++E LSEWER++LPIDPGVVLLDIAFVPD+  RGFLLGTRQT+LETKDG
Subjt:  ASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQTILETKDG

Query:  GRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQET
        G TW PRSIPSAEEEDFNYRFN+ISFKGKEGWI+GKPAILLYT+DAG +W+RIPLS+QLPGDMV+IKAT +KSAEMVTDEGAIYVTSN+GYNWKAA+QET
Subjt:  GRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQET

Query:  VSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ
        VSATLNRTVSSGISGASYYTGTF+ VNRSPDGRYVAVSSRGNF+LTWEPGQ
Subjt:  VSATLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGACTCTGCAACAACTCCTCAAACCTTCATGGTCCTCCTCTCTCTTTGCTTCCACTTCTCCACGCCATTCCCTCTCTTCAACCACTCCCAAAGCCTCTCTTCAGAA
TTCTTCCATCAATCGCCGCCAGTTTGTTGCTGAGACGGCGGCCACGATCTCTCTGTCGCTTTCTCCGTTTATTGCCCCCGTACCACCGGCGAAGTCTGAAGAATCTCTAT
CGGAGTGGGAGAGACTTTACCTTCCTATAGATCCTGGCGTTGTCCTTCTCGACATTGCTTTTGTGCCCGATGATTTGGACCGTGGCTTCCTTTTGGGGACTAGGCAAACC
ATTTTAGAGACGAAAGATGGTGGAAGAACATGGGCTCCGCGTTCAATACCCTCAGCCGAAGAAGAAGACTTTAACTACCGGTTTAATGCTATTAGCTTCAAAGGAAAGGA
AGGATGGATTGTTGGCAAGCCTGCAATTCTGTTGTACACTTCGGATGCTGGAGTAAGTTGGGAAAGGATACCTCTTAGCGCTCAGCTTCCTGGAGATATGGTCTACATTA
AAGCAACGGGAGAAAAAAGTGCGGAGATGGTTACTGATGAAGGTGCAATTTATGTTACATCAAACAAGGGTTATAACTGGAAGGCTGCGGTTCAGGAGACTGTTTCTGCC
ACTCTTAATAGAACCGTTTCTAGTGGTATAAGTGGTGCAAGCTATTACACTGGAACCTTTAACACTGTCAATCGCTCTCCTGATGGGCGTTATGTAGCTGTTTCAAGTCG
TGGTAACTTCTATCTCACCTGGGAGCCTGGGCAGGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGAGAGATAAGAGGTCGGCCAACTCTTCTCTGCTCCTTTCCTTTTCTCTACAATGGCGACTCTGCAACAACTCCTCAAACCTTCATGGTCCTCCTCTCTCTTTGCTTCC
ACTTCTCCACGCCATTCCCTCTCTTCAACCACTCCCAAAGCCTCTCTTCAGAATTCTTCCATCAATCGCCGCCAGTTTGTTGCTGAGACGGCGGCCACGATCTCTCTGTC
GCTTTCTCCGTTTATTGCCCCCGTACCACCGGCGAAGTCTGAAGAATCTCTATCGGAGTGGGAGAGACTTTACCTTCCTATAGATCCTGGCGTTGTCCTTCTCGACATTG
CTTTTGTGCCCGATGATTTGGACCGTGGCTTCCTTTTGGGGACTAGGCAAACCATTTTAGAGACGAAAGATGGTGGAAGAACATGGGCTCCGCGTTCAATACCCTCAGCC
GAAGAAGAAGACTTTAACTACCGGTTTAATGCTATTAGCTTCAAAGGAAAGGAAGGATGGATTGTTGGCAAGCCTGCAATTCTGTTGTACACTTCGGATGCTGGAGTAAG
TTGGGAAAGGATACCTCTTAGCGCTCAGCTTCCTGGAGATATGGTCTACATTAAAGCAACGGGAGAAAAAAGTGCGGAGATGGTTACTGATGAAGGTGCAATTTATGTTA
CATCAAACAAGGGTTATAACTGGAAGGCTGCGGTTCAGGAGACTGTTTCTGCCACTCTTAATAGAACCGTTTCTAGTGGTATAAGTGGTGCAAGCTATTACACTGGAACC
TTTAACACTGTCAATCGCTCTCCTGATGGGCGTTATGTAGCTGTTTCAAGTCGTGGTAACTTCTATCTCACCTGGGAGCCTGGGCAGGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATLQQLLKPSWSSSLFASTSPRHSLSSTTPKASLQNSSINRRQFVAETAATISLSLSPFIAPVPPAKSEESLSEWERLYLPIDPGVVLLDIAFVPDDLDRGFLLGTRQT
ILETKDGGRTWAPRSIPSAEEEDFNYRFNAISFKGKEGWIVGKPAILLYTSDAGVSWERIPLSAQLPGDMVYIKATGEKSAEMVTDEGAIYVTSNKGYNWKAAVQETVSA
TLNRTVSSGISGASYYTGTFNTVNRSPDGRYVAVSSRGNFYLTWEPGQV