; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg07163 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg07163
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionproline-rich protein 3-like
Genome locationCarg_Chr17:8079501..8082773
RNA-Seq ExpressionCarg07163
SyntenyCarg07163
Gene Ontology termsGO:0071944 - cell periphery (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575812.1 Proline-rich protein 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.4e-6578.98Show/hide
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KAG7014354.1 Proline-rich protein 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-120100Show/hide
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XP_022991245.1 proline-rich protein 3-like [Cucurbita maxima]6.1e-6478.41Show/hide
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XP_023548997.1 proline-rich protein 3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-5975.88Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5H5 Uncharacterized protein2.1e-4665.9Show/hide
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A0A6J1GP42 proline-rich protein 3-like9.2e-5859.19Show/hide
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          S+++L H  MKL+SVGPFL++
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A0A6J1GQG7 proline-rich protein 3-like1.2e-6078.11Show/hide
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A0A6J1JSC5 proline-rich protein 3-like2.9e-6478.41Show/hide
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A0A6J1JUA4 proline-rich protein 3-like1.0e-5657.78Show/hide
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          S+++L H  MKL+SVGPFL++ Q
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81417 Protein SEED AND ROOT HAIR PROTECTIVE PROTEIN2.3e-1341.46Show/hide
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        + LS  +DA GYF+AT+ PS++   R + +CK +L  SPL +C  P+D+N GV G  L +Y++L     KL+  GPF +T +
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Q9FZ35 Proline-rich protein 14.6e-0636.25Show/hide
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        SD +D  GYF   L+       + L  C+  L  SP+E C+ P+++N G++G     Y       +KLF+VGPF FT  S
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Q9LZJ7 Proline-rich protein 33.8e-0826.34Show/hide
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        P Y  P P Y          +     +L AV+G++ C+N  + +P+  G K  I+ S  A +           G  N                     T 
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        +  Y   S+ +D+ GYF  +L+       ++L  C+  L LSP+E C+ P+++N G++G    L+ Y+      ++LFSVGPF +T
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54970.1 proline-rich protein 13.3e-0736.25Show/hide
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        SD +D  GYF   L+       + L  C+  L  SP+E C+ P+++N G++G     Y       +KLF+VGPF FT  S
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AT2G47530.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.6e-0925.58Show/hide
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        L LLA   V + ADYY  P             P   KP  +Y   V  P L      IA+EG + C++  + +P++ G   ++             +V S
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        H+ + L+++ PF F+
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AT2G47540.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein6.8e-2155.81Show/hide
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        T LS ++DA GYFLATLS SEV+D +   ++KEC+AFLELSP + C  P+++N G+SGA+L +Y+LL +  KMKLF+VGPF+F+ +
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AT3G62680.1 proline-rich protein 32.7e-0926.34Show/hide
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        P Y  P P Y          +     +L AV+G++ C+N  + +P+  G K  I+ S  A +           G  N                     T 
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Query:  IASYTFLSDSSDANGYFLATLSPSEVEDKRELKECKAFLELSPLENCQAPSDLNNGVSGA--LLHSYKLLVHNKMKLFSVGPFLFT
        +  Y   S+ +D+ GYF  +L+       ++L  C+  L LSP+E C+ P+++N G++G    L+ Y+      ++LFSVGPF +T
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AT4G02270.1 root hair specific 131.6e-1441.46Show/hide
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        + LS  +DA GYF+AT+ PS++   R + +CK +L  SPL +C  P+D+N GV G  L +Y++L     KL+  GPF +T +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCTCGCAAGGCGGCTGATCGCTGCGACTCCGGTGGTGCTGCTCTGGCTTTTGGCCGCCGCTTCCGTTTCTTCTGCCGCAGATTATTATGAGTTTCCCGACGACCA
AAATTACGGCGGAGCGGGGGATAACGGAATCCCTATTTATGAGAAACCGCTCCCGTCGTACGGCCGTGAAGTGGCGGCGCCGCTCCTTATCGCCGTTGAAGGAGTTGTTT
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TTCACTTGCCAAAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FTCQS