; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg07303 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg07303
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTranscription termination factor like
Genome locationCarg_Chr01:1007884..1008171
RNA-Seq ExpressionCarg07303
SyntenyCarg07303
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581607.1 hypothetical protein SDJN03_21609, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.9e-2471.43Show/hide
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        M+ ILE D    F+KIAMF+ VQ+LVY ILS+SS+LFS D+KL+SLSFKPARSVSIRR LAALSD+P GGELSPSS V TPS + RE SDD
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KAG6606858.1 hypothetical protein SDJN03_00200, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-41100Show/hide
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KAG7018107.1 hypothetical protein SDJN02_19975, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.1e-2671.58Show/hide
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        M+ ILE D    F+KIAMF+ VQ+LVY ILS+SS+LFS D+KL+SLSFKPARSVSIRR LAALSD+P GGELSPSS V TPS + RE SDD GRF
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XP_011651805.2 uncharacterized protein LOC105434941 [Cucumis sativus]8.6e-2873.4Show/hide
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        M PI + DAGE FV+IAMF+ +QLLVY ILS+SS+LFS DQK++SLSFKPARSVSIRRFLAALSD+P GGELSPS++V TPS   R+ SDDGGR
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XP_038905322.1 uncharacterized protein LOC120091388 [Benincasa hispida]3.5e-2976.84Show/hide
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        M PILE D  E FVKIAMF  VQLLVY ILS+SS+LFS DQKL+SLSFKPARSVSIRRFLAALSD+P GGE+SP+ RV+TPS   R+HSDDGGRF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A175YFL8 Uncharacterized protein1.2e-1460.71Show/hide
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        + E D G+  VKIA+FLLVQ LVY ILS SS+LFS        +F+PARSVSIRRFLAALSDMP+GGELSP++       SP+H
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A0A1S3CFW1 uncharacterized protein LOC1035002811.8e-2372.83Show/hide
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        M PI E DAGE FV+IAMF+ VQLLVY ILS+SS+LFS DQKL+SLSFKPARSVSIRRFLAALSD+P GGELSPSS       + R  SDDG
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A0A218WLF6 uncharacterized protein LOC1161988353.7e-1662.96Show/hide
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        G+  +K+ MF+LVQ LVY ILS+SSD+FSKD+  KSLSF+P RSVSIRRF+AALSDMP+GGE SPS   R+P  +   H D
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A0A5A7UC63 Uncharacterized protein1.8e-2372.83Show/hide
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        M PI E DAGE FV+IAMF+ VQLLVY ILS+SS+LFS DQKL+SLSFKPARSVSIRRFLAALSD+P GGELSPSS       + R  SDDG
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A0A6P4BPM5 uncharacterized protein LOC1074341566.9e-1558.14Show/hide
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        +LE    +  +K+ +F LVQ LVY ILS+SS +FSK  K +S SFKPARSVS+RRFLAALSDMP+GGELSPS +    SP     S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05575.1 unknown protein7.1e-1256.25Show/hide
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        +K+++F L+Q LVY ILS+SS +FS  + +K + SF+ ARS+SIRR LA L DMP+GGE+SPS+
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AT2G31945.1 unknown protein5.4e-1255.88Show/hide
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        G   +K+A+F LVQ LVY IL +SS +F++   LK + SF+P RSVSIRR LAAL D+P+G ++SPSS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGCCTATTTTGGAAATTGACGCCGGCGAGTTCTTCGTCAAAATCGCTATGTTCCTCTTAGTTCAACTTCTTGTTTATTTTATCCTCTCCGAATCCTCTGATCTCTT
CTCTAAGGACCAGAAATTGAAATCTCTCAGCTTCAAACCGGCGAGATCCGTCAGTATTCGCCGGTTTTTAGCAGCTCTTTCCGACATGCCTTCCGGTGGCGAGCTGTCAC
CGTCGTCGAGAGTTCGGACTCCGTCGCCTATTCACCGGGAGCATTCCGATGACGGCGGCAGGTTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGCCTATTTTGGAAATTGACGCCGGCGAGTTCTTCGTCAAAATCGCTATGTTCCTCTTAGTTCAACTTCTTGTTTATTTTATCCTCTCCGAATCCTCTGATCTCTT
CTCTAAGGACCAGAAATTGAAATCTCTCAGCTTCAAACCGGCGAGATCCGTCAGTATTCGCCGGTTTTTAGCAGCTCTTTCCGACATGCCTTCCGGTGGCGAGCTGTCAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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