; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg07350 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg07350
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptioneukaryotic initiation factor 4A-III
Genome locationCarg_Chr01:1255220..1260126
RNA-Seq ExpressionCarg07350
SyntenyCarg07350
Gene Ontology termsGO:0006413 - translational initiation (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0071013 - catalytic step 2 spliceosome (cellular component)
GO:0003724 - RNA helicase activity (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001650 - Helicase, C-terminal
IPR014001 - Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF3786368.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 2 [Nymphaea thermarum]2.6e-6583.65Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISAT+P+EILEMT+KFMTDPVR+LVKRDELTLEV+WLTEKMRSNNFTVS MHGDMPQKERDAIM EFRSG
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG

Query:  TTRVLITTD---------------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
        TTRVLITTD               VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  TTRVLITTD---------------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

KAF3794697.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 34 [Nymphaea thermarum]3.4e-6584.71Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISAT+P+EILE+T+KFMTDPVRILVKRDELTLEV+WLTEKMRSNNFTVS MHGDMPQKERDAIM EFRSG
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG

Query:  TTRVLITTD-------------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
        TTRVLITTD             VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  TTRVLITTD-------------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

KAG5006102.1 hypothetical protein JHK85_024644 [Glycine max]4.8e-6788.74Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQV LISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEV+WLTEKMR+NNFTVS MHGDMPQKERDAIMGEFR+G
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG

Query:  TTRVLITT-------DVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
        TTRVLITT       DVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  TTRVLITT-------DVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

KAG7036611.1 Eukaryotic initiation factor 4A-III-like B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.4e-96100Show/hide
Query:  MAAAATTSVVPPNRRRAITAPEDKLEFETTEGDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLT
        MAAAATTSVVPPNRRRAITAPEDKLEFETTEGDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLT
Subjt:  MAAAATTSVVPPNRRRAITAPEDKLEFETTEGDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLT

Query:  EKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNFSVVIVMS
        EKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNFSVVIVMS
Subjt:  EKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNFSVVIVMS

RYR62846.1 hypothetical protein Ahy_A04g020595 isoform A [Arachis hypogaea]2.4e-6686.36Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDP+RILVKRDELTLEV+WLTEKMR+NNFTVS MHGDMPQ+ERDAIM EFRSG
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG

Query:  TTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
        TTRVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  TTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A445DI92 Uncharacterized protein1.2e-6686.36Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDP+RILVKRDELTLEV+WLTEKMR+NNFTVS MHGDMPQ+ERDAIM EFRSG
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG

Query:  TTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
        TTRVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  TTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

A0A4Y7IKQ3 Uncharacterized protein2.4e-6485.06Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQV LISATLPHEILE+TNKFMTDPVRILVKRDELTLEV+WLTEKMRS NFTVS MHGDMPQ+ERDAIM EFR G
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSG

Query:  TTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
         TRVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  TTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

A0A5A7UAL9 Eukaryotic initiation factor 4A-31.8e-6473.3Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITT-------DVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITT       DVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITT-------DVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

A0A6J1J605 eukaryotic initiation factor 4A-31.3e-0665.52Show/hide
Query:  MAAAATTSVVPPNRRRAITAPEDKLEFETTEGDES----DEMLSRGFKDQIY-DVYRY
        MAAAATTSVVPPNRRRA++APEDKLEFETTEG E     D+M   G KD +   +Y Y
Subjt:  MAAAATTSVVPPNRRRAITAPEDKLEFETTEGDES----DEMLSRGFKDQIY-DVYRY

A0A6J1K814 eukaryotic initiation factor 4A-3-like4.1e-6472.16Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

A0A6J1K814 eukaryotic initiation factor 4A-3-like3.5e-0768.97Show/hide
Query:  MAAAATTSVVPPNRRRAITAPEDKLEFETTEGDES----DEMLSRGFKDQIY-DVYRY
        MAAAATTSVVPPNRRRAITAPEDKLEFETTEG E     D+M   G KD +   +Y Y
Subjt:  MAAAATTSVVPPNRRRAITAPEDKLEFETTEGDES----DEMLSRGFKDQIY-DVYRY

A0A6J1K814 eukaryotic initiation factor 4A-3-like4.1e-6472.16Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P41380 Eukaryotic initiation factor 4A-33.1e-6167.53Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP+EILE+T+KFMTDPVRILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V+WLT KMR NNFTVS MHGDMPQKERDAIM EFR GTTRVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

Q10I26 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog B2.8e-6268.04Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DE+DEML RGFKDQIYDVYRYLPPELQV LISATLPHEILEMT+KFMTDPVRILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V+WLTE+MRSNNFTVS MHGDMPQKERDAIMGEFRSG TRVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

Q5VNM3 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog A2.8e-6268.04Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DE+DEML RGFKDQIYDVYRYLPPELQV LISATLPHEILEMT+KFMTDPVRILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V+WLTE+MRSNNFTVS MHGDMPQKERDAIMGEFRSG TRVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

Q94A52 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog6.5e-5964.95Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQV L+SATLPHEILEMT+KFMT+PV+ILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V++L+EKMRS+NFTVS MHGDMPQKERDAIM EFRSG +RVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

Q9VHS8 Eukaryotic initiation factor 4A-III2.1e-5763.4Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DE+DEML++GFK+QIYDVYRYLPP  QVVLISATLPHEILEMT+KFMTDP+RILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V+WLTEKMR  NFTVS MHGDMPQKERD IM EFR+G +RVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51380.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein4.8e-4957.22Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DESDEMLS+G KDQIYDVYR LP ++QV LISATLP EILEMT KFMTDPVRILVK DELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V+WLTEKMRS+NF VS MHGD  QKERD IM +FRS  +RVLI +D          VS VINYD+PNN ELYIHRIGR+GRFGR+    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

AT1G54270.1 eif4a-28.5e-4653.09Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LE+T KFM+ PVRILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD          VSLVIN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

AT1G54270.2 eif4a-28.5e-4653.09Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LE+T KFM+ PVRILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD          VSLVIN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

AT3G13920.1 eukaryotic translation initiation factor 4A18.5e-4653.09Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LE+T KFM+ PVRILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD          VSLVIN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF

AT3G19760.1 eukaryotic initiation factor 4A-III4.6e-6064.95Show/hide
Query:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------
        DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQV L+SATLPHEILEMT+KFMT+PV+ILVKRDELTLE                                     
Subjt:  DESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLE-------------------------------------

Query:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF
           V++L+EKMRS+NFTVS MHGDMPQKERDAIM EFRSG +RVLITTD          VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRK    NF
Subjt:  ---VEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTD----------VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCTGCAGCTACAACAAGCGTTGTGCCGCCGAATCGGCGGCGTGCGATTACCGCGCCGGAAGATAAGTTGGAATTCGAGACGACGGAGGGGGATGAATCCGATGA
GATGCTGAGCAGAGGGTTTAAAGACCAAATTTATGATGTATATCGATATCTCCCACCAGAGCTTCAGGTTGTCTTGATTTCTGCTACTCTTCCTCATGAAATCCTGGAGA
TGACGAATAAGTTTATGACAGATCCCGTGAGGATCCTTGTGAAGCGTGATGAGTTAACTTTGGAGGTTGAATGGCTGACTGAGAAGATGCGCAGCAATAACTTCACAGTT
TCACATATGCATGGAGACATGCCTCAAAAGGAAAGAGATGCAATTATGGGGGAGTTTCGATCGGGAACTACCCGTGTCCTAATCACTACTGATGTATCACTAGTGATAAA
CTATGACCTTCCAAACAATCGAGAACTTTACATTCACAGGATAGGAAGGTCTGGTCGGTTTGGGCGCAAGCAAAGCCTGTTCAACTTTTCGGTTGTCATTGTCATGAGCT
AA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCTGCAGCTACAACAAGCGTTGTGCCGCCGAATCGGCGGCGTGCGATTACCGCGCCGGAAGATAAGTTGGAATTCGAGACGACGGAGGGGGATGAATCCGATGA
GATGCTGAGCAGAGGGTTTAAAGACCAAATTTATGATGTATATCGATATCTCCCACCAGAGCTTCAGGTTGTCTTGATTTCTGCTACTCTTCCTCATGAAATCCTGGAGA
TGACGAATAAGTTTATGACAGATCCCGTGAGGATCCTTGTGAAGCGTGATGAGTTAACTTTGGAGGTTGAATGGCTGACTGAGAAGATGCGCAGCAATAACTTCACAGTT
TCACATATGCATGGAGACATGCCTCAAAAGGAAAGAGATGCAATTATGGGGGAGTTTCGATCGGGAACTACCCGTGTCCTAATCACTACTGATGTATCACTAGTGATAAA
CTATGACCTTCCAAACAATCGAGAACTTTACATTCACAGGATAGGAAGGTCTGGTCGGTTTGGGCGCAAGCAAAGCCTGTTCAACTTTTCGGTTGTCATTGTCATGAGCT
AA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAAATTSVVPPNRRRAITAPEDKLEFETTEGDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEVEWLTEKMRSNNFTV
SHMHGDMPQKERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKQSLFNFSVVIVMS