; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08268 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08268
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionoxidative stress 3
Genome locationCarg_Chr05:3051287..3051984
RNA-Seq ExpressionCarg08268
SyntenyCarg08268
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598765.1 hypothetical protein SDJN03_08543, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-7699.39Show/hide
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KAG7029705.1 hypothetical protein SDJN02_08047 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-76100Show/hide
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XP_022961691.1 uncharacterized protein LOC111462384 [Cucurbita moschata]3.2e-7094.48Show/hide
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XP_022996858.1 uncharacterized protein LOC111491976 [Cucurbita maxima]5.0e-6893.25Show/hide
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XP_023546661.1 uncharacterized protein LOC111805706 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.2e-7093.87Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BBN3 uncharacterized protein LOC1034881651.0e-3766.27Show/hide
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          + IKKGLSKFYEGKSRTFSSLSDVK +EDLAK E D+RKK +RI+PKATISKKHGR+  ATLVSK D
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A0A2R6QUY1 E3 UFM1-protein like1.2e-0947.83Show/hide
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        LAK    +++K               ++PKATISKK+G
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A0A5A7VFF0 Uncharacterized protein2.9e-3765.68Show/hide
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A0A6J1HB27 uncharacterized protein LOC1114623841.5e-7094.48Show/hide
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A0A6J1KC75 uncharacterized protein LOC1114919762.4e-6893.25Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G03170.1 unknown protein2.5e-0451.35Show/hide
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AT4G26288.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown1.5e-0641.07Show/hide
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        GS + +SSSSS S+C  D     SSSSSSSSS  +       ++  +  ++ +KK GLSK+Y+GKS++F+SL++V  ++DL K  +  +    R     P
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Query:  KATISKKHGRAS
        KATIS K  R S
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AT5G56550.1 oxidative stress 32.6e-0640.74Show/hide
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        S  ED++SS     SLSSS  S   +DD     SSSSS+        ++ +    L IK+GLSKFYEGKS++F+SL +VK +EDL K      +Y  ++K
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Query:  YSRIT-------------PKATISKKHGRASLATL
         SR T             PKATISKK  R   + L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTTCAGGAAGTTGACCGTTGATGCAGATTTTGCTACAAGTCTTTTTAATAGAAAGGAAGAGAAATGTTTTATCCCTCATCTTCTTCACTTTAGCGTCGTATCGTG
TTCGGAAGATTCAACTAGTTCAATTGGATCGTTGTCGTCGTTATCGTCGTCGTCGTCGTCAAGCCTCTGTGACGACGATGCGTTATCGTCATTTTCATCTTCTTCTTCTT
CTTCGTCGTCTTTGTTATCTCGAAGAGAAGTTTGTGAGGAACAACAGCTGCTTTGTATCAAAAAAGGGTTGTCAAAATTTTATGAAGGGAAATCACGAACCTTCTCATCC
TTATCCGACGTGAAATGCGTAGAAGACTTAGCGAAGGGAGAGAATGATTATAGAAAGAAATACTCTCGAATTACTCCCAAGGCTACCATATCAAAGAAGCATGGAAGAGC
CTCTCTTGCAACCTTAGTGTCTAAGATGGACATTTCACTTCGCCCCGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGATCAAGAACTCATCCATTTCAATTCTTCTCTTTGTGGAAAGTCATGGAGTTCAGGAAGTTGACCGTTGATGCAGATTTTGCTACAAGTCTTTTTAATAGAAAGGAAG
AGAAATGTTTTATCCCTCATCTTCTTCACTTTAGCGTCGTATCGTGTTCGGAAGATTCAACTAGTTCAATTGGATCGTTGTCGTCGTTATCGTCGTCGTCGTCGTCAAGC
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AGGGTTGTCAAAATTTTATGAAGGGAAATCACGAACCTTCTCATCCTTATCCGACGTGAAATGCGTAGAAGACTTAGCGAAGGGAGAGAATGATTATAGAAAGAAATACT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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