; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08338 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08338
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein TIFY 8-like isoform X1
Genome locationCarg_Chr05:3468882..3470836
RNA-Seq ExpressionCarg08338
SyntenyCarg08338
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
GO:0031347 - regulation of defense response (biological process)
GO:2000022 - regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598829.1 Protein TIFY 8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-16599Show/hide
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KAG7029774.1 Protein TIFY 8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.7e-168100Show/hide
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XP_022929750.1 protein TIFY 8-like isoform X1 [Cucurbita moschata]8.7e-16799.67Show/hide
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XP_022997416.1 protein TIFY 8-like isoform X2 [Cucurbita maxima]3.9e-15995.99Show/hide
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XP_023547014.1 protein TIFY 8 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.9e-16498.66Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LM64 Tify domain-containing protein4.1e-12277.22Show/hide
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A0A6J1EV71 protein TIFY 8-like isoform X14.2e-16799.67Show/hide
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A0A6J1GJZ0 LOW QUALITY PROTEIN: protein TIFY 84.9e-12377.14Show/hide
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        SHLEG+PFYG RGDISTTEIH+RIIG+KRS+SDSGF+ SYRDGVPHM SES     HLMKTLRNGAGR+ NRR+NDDEV +GMQ  MRP+AAS+I Q H+
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        K GTNI + ES +PS
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A0A6J1K7E9 protein TIFY 8-like isoform X21.9e-15995.99Show/hide
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A0A6J1K9J5 protein TIFY 8-like isoform X11.9e-15995.99Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q84MB2 Protein TIFY 82.3e-2132.64Show/hide
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        +FHDFLG KNP            PPD + ++     S +  SS+ G  GL STS  +      G+HL+G+  +GPR D+S + + +R  G+KRS SDS  
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                 H  ++ H  +LH  K LRNG G                                                S  MN+ P         G   
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Query:  PFSPQLPTNRYREANVIPPNISQSAADEGSRTGIKGPGILSS
            QL T+R+++ NV P  I+Q+AADEGSRTG+KGPGILSS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G32570.1 TIFY domain protein 81.7e-2232.64Show/hide
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Query:  MSSYRDGVPHMPSESHHNSLHLMKTLRNGAGRDRNRRSNDDEVMVGMQHPMRPNAASLILQSHVGSGSRLDADVTKWERSTLMNIGPAPTVQCSPRGTFV
                 H  ++ H  +LH  K LRNG G                                                S  MN+ P         G   
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            QL T+R+++ NV P  I+Q+AADEGSRTG+KGPGILSS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCACCACACTATGCTGACCAATGTTTCTAAAAATTCCACTCACCCACATCCACAATTGCCTCCCAATCCCATCTTCCATGATTTTTTAGGCATGAAAAACCCTGA
TTCTCATCTGGGTTTCTCTCCTCGGAAGGCGGCGCCGCCGGATTTGCGGCCGTCTGAACACTGTCCTGCTGCCTCTGCTTCCCGTGGCTCCTCTTCAAGCGGCGGCCGTG
GCCTCATCTCTACTTCCTCAGATCTTGCTTCTGATCGGCAGGTAGGTAGTCATCTTGAAGGCGTTCCGTTTTACGGTCCGAGGGGCGATATCTCGACTACAGAGATCCAT
AGTAGGATTATAGGGAGTAAGAGAAGCATATCAGATTCTGGTTTTATGTCGTCGTATCGAGATGGTGTTCCACATATGCCTTCCGAGTCGCATCATAATAGCTTGCATCT
AATGAAGACGTTACGAAATGGAGCAGGCAGGGATCGAAATCGAAGATCAAATGACGATGAAGTGATGGTTGGGATGCAGCATCCAATGAGGCCGAACGCTGCATCGCTTA
TCTTGCAATCTCATGTTGGAAGTGGCAGTAGACTCGATGCTGATGTTACCAAGTGGGAGAGATCCACGCTTATGAACATCGGTCCTGCTCCGACCGTGCAGTGCTCTCCT
CGTGGGACGTTTGTGCCTTTTTCCCCTCAGTTACCTACAAATCGATATAGAGAAGCCAACGTTATTCCTCCGAATATATCTCAATCAGCTGCCGATGAGGGATCTCGTAC
TGGAATCAAAGGTCCTGGAATCTTGAGTTCGAGTAATCCTGGTGGTGGAACCTCTGAACGAAACTCGTCGATCCTGCTCAAAAAGTCCGGGACTAATATCGTAGATCCCG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SRIIGSKRSISDSGFMSSYRDGVPHMPSESHHNSLHLMKTLRNGAGRDRNRRSNDDEVMVGMQHPMRPNAASLILQSHVGSGSRLDADVTKWERSTLMNIGPAPTVQCSP
RGTFVPFSPQLPTNRYREANVIPPNISQSAADEGSRTGIKGPGILSSSNPGGGTSERNSSILLKKSGTNIVDPESCIPSR