; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08376 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08376
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionBEST Arabidopsis thaliana protein match is: s in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink).
Genome locationCarg_Chr05:3800167..3800721
RNA-Seq ExpressionCarg08376
SyntenyCarg08376
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598869.1 hypothetical protein SDJN03_08647, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-8894.54Show/hide
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KAG7029810.1 hypothetical protein SDJN02_08153, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-97100Show/hide
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XP_022929606.1 uncharacterized protein LOC111436141 [Cucurbita moschata]1.0e-9398.37Show/hide
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XP_022997465.1 uncharacterized protein LOC111492375 [Cucurbita maxima]4.0e-9094.65Show/hide
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XP_023546389.1 uncharacterized protein LOC111805512 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.7e-9397.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UK88 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B2.0e-6372.4Show/hide
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A0A5D3BQA0 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B5.4e-6472.92Show/hide
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A0A6J1DGF8 uncharacterized protein LOC1110208301.8e-5970.05Show/hide
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        + G            DKLET SF+SSD EFMASPRD   S+SSSSSSS PSSL+ESL VRNMGRVS GRP       +I+R LACYH
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A0A6J1ENL5 uncharacterized protein LOC1114361415.0e-9498.37Show/hide
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A0A6J1K9Q8 uncharacterized protein LOC1114923752.0e-9094.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40475.1 unknown protein1.2e-0435.14Show/hide
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        + SK+I + SS +  SSR  YY GA+  VPF WET+PGTPK     +   LPPL+PPP+  S                               S  G + 
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        ++A TI  +       S   S   F  S   S SSSS SSSSP S +E
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AT3G56260.2 unknown protein3.6e-0427.92Show/hide
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        RS+YY GA+  +PF WE++PGTPK+    D  L  PL+PPP+  S G+      + K R +    +    +  +++S  G +   +++  +S+       
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          SS   F +SP  S+    S    S L+ +    +  R S      CS  G++
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AT4G25845.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B (TAIR:AT4G25850.2)3.6e-1247.37Show/hide
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        MK       SSI  +S   YY     EGVPF+WE QPGTP +  P++++PPLSPPPA++SLGLP P   IE+PK    P   +KLR W+ +   R
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AT4G25850.2 OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B3.6e-1247.37Show/hide
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AT5G01790.1 unknown protein5.1e-0654.9Show/hide
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        S  C S R  YY GAA  VPF+WE+ PGTPK P  +   LPPL+PPP+  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATAGATTATAGCAATGATAAGTTGGAAACATTTTCATTTCTCAGCTCGGACTGCGAGTTCATGGCTTCTCCTCGGGATTCTATGTCGTCGTCATCGTCTTCTTCATCTCC
GTCGTCTCTCATCGAGTCGTTAACCGTACGAAATATGGGGAGGGTGTCACTTGGAAGGCCTTCTAGTTGCAGTACTGCTGGAAAAATTCATAGAATTCTGGCTTGTTACC
ATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IDYSNDKLETFSFLSSDCEFMASPRDSMSSSSSSSSPSSLIESLTVRNMGRVSLGRPSSCSTAGKIHRILACYH