; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08377 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08377
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description40S ribosomal protein S8
Genome locationCarg_Chr05:3801723..3804036
RNA-Seq ExpressionCarg08377
SyntenyCarg08377
Gene Ontology termsGO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001047 - Ribosomal protein S8e
IPR018283 - Ribosomal protein S8e, conserved site
IPR022309 - Ribosomal protein S8e/ribosomal biogenesis NSA2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055563.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-11692.44Show/hide
Query:  NSKFGFTPRALISATWTSFIGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILD
        N +  FTPRAL+ + W   + ISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILD
Subjt:  NSKFGFTPRALISATWTSFIGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILD

Query:  VVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACI
        VVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACI
Subjt:  VVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACI

Query:  SSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        SSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  SSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

KAG6598870.1 40S ribosomal protein S8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.3e-11699.09Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT+ASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

KAG7029811.1 40S ribosomal protein S8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-129100Show/hide
Query:  MLNSKFGFTPRALISATWTSFIGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRI
        MLNSKFGFTPRALISATWTSFIGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRI
Subjt:  MLNSKFGFTPRALISATWTSFIGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRI

Query:  LDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMA
        LDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMA
Subjt:  LDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMA

Query:  CISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        CISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  CISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_022929761.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucurbita moschata]3.3e-11699.54Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_038891236.1 40S ribosomal protein S8 [Benincasa hispida]1.5e-11396.8Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT+ASAKK+EEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQF SGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UI08 40S ribosomal protein S87.1e-11792.44Show/hide
Query:  NSKFGFTPRALISATWTSFIGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILD
        N +  FTPRAL+ + W   + ISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILD
Subjt:  NSKFGFTPRALISATWTSFIGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILD

Query:  VVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACI
        VVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACI
Subjt:  VVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACI

Query:  SSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        SSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  SSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5D3BT12 40S ribosomal protein S81.3e-11397.26Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1EP23 40S ribosomal protein S81.6e-11699.54Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1FH17 40S ribosomal protein S89.6e-11497.26Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT AS+KKEEE DA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGA+
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1K537 40S ribosomal protein S81.6e-11699.54Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81361 40S ribosomal protein S82.8e-10286.43Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE--EEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEG
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGV+IGRKKKT A+AKK+  EEG+A TEE KKSNHV  K+EKRQQ R LD HIEEQF  G+L+ACISSRPGQCG+ADG ILEG
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE--EEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEG

Query:  KELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        KELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  KELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

P49199 40S ribosomal protein S82.1e-10286.88Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEG---DAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKK  A AKK+ EG   +A TEE KKSNHV RK+EKRQQ R LD HIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEG---DAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGKGA A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q08069 40S ribosomal protein S81.4e-10185.07Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEG---DAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKKT A+ K   EG   +A  EE KKSNHV RK+EKR++ R LDPHIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEG---DAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGK A A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q93VG5 40S ribosomal protein S8-13.5e-9780.54Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRK+R+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE-EEGD----APTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+ +S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE-EEGD----APTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

Q9FIF3 40S ribosomal protein S8-22.7e-9783.11Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRK+RILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G20290.1 Ribosomal protein S8e family protein2.5e-9880.54Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRK+R+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE-EEGD----APTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+ +S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE-EEGD----APTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

AT5G59240.1 Ribosomal protein S8e family protein1.9e-9883.11Show/hide
Query:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRK+RILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  IGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAACTCTAAATTTGGCTTCACGCCAAGAGCTCTCATCTCAGCAACATGGACTTCATTTATAGGAATTTCTCGTGATTCTATGCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGG
CAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGAGAAAGTATGAGCTCGGAAGGCAACCTGCCAACACCAAGATATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGCGGGGGCA
ATGTGAAGTGGCGTGCTTTTAGGCTTGATACTGGAAACTACTCATGGGGTAGTGAGGCCGTGACTAGGAAGTCACGTATTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCCAACAAT
GAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTGGTGAAGAGTGCCATAGTTCAAGTTGATGCAGCACCATTTAAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATATTGGACGGAAGAA
GAAGACCGTAGCATCTGCTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCTCCAACTGAAGAGGTAAAGAAGAGTAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCAGCAGGACCGTA
AGCTCGATCCGCATATCGAAGAACAATTCAGCAGTGGTCGATTGATGGCTTGTATCTCATCAAGACCAGGTCAATGTGGCCGAGCAGACGGATATATCTTGGAGGGCAAA
GAGCTTGAATTCTATATGAAGAAGCTCCAAAGAAAGAAGGGAAAGGGAGCTGGTGCTGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTGAACTCTAAATTTGGCTTCACGCCAAGAGCTCTCATCTCAGCAACATGGACTTCATTTATAGGAATTTCTCGTGATTCTATGCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGG
CAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGAGAAAGTATGAGCTCGGAAGGCAACCTGCCAACACCAAGATATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGCGGGGGCA
ATGTGAAGTGGCGTGCTTTTAGGCTTGATACTGGAAACTACTCATGGGGTAGTGAGGCCGTGACTAGGAAGTCACGTATTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCCAACAAT
GAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTGGTGAAGAGTGCCATAGTTCAAGTTGATGCAGCACCATTTAAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATATTGGACGGAAGAA
GAAGACCGTAGCATCTGCTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCTCCAACTGAAGAGGTAAAGAAGAGTAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCAGCAGGACCGTA
AGCTCGATCCGCATATCGAAGAACAATTCAGCAGTGGTCGATTGATGGCTTGTATCTCATCAAGACCAGGTCAATGTGGCCGAGCAGACGGATATATCTTGGAGGGCAAA
GAGCTTGAATTCTATATGAAGAAGCTCCAAAGAAAGAAGGGAAAGGGAGCTGGTGCTGCATAAATTATTTTGTAATCGAGTTTTTCTTCAGCCCATGTTTCCTGTTCTTT
CTTTCTTTTCAAGCTATTTTGGAACTTCGATTTTGTTGGTAATAGTTGCTACTTTTTGACCTTTTCGTGATCACAACAGTTTGTTTATTAGCATGAGTTTTCAAGTTTCA
AAACCTTTTGTCCTACTCTTTTTATGTAAGCGAGTTGGTTTGGTGTTTGATCTACAACTTTTACAGAAAAGTTCTAATGGATTGGGGCGAATGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLNSKFGFTPRALISATWTSFIGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNN
ELVRTQTLVKSAIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK
ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA