; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08570 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08570
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor TCP14-like
Genome locationCarg_Chr02:4910139..4910663
RNA-Seq ExpressionCarg08570
SyntenyCarg08570
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005333 - Transcription factor, TCP
IPR017887 - Transcription factor TCP subgroup


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605560.1 Transcription factor TCP15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.8e-87100Show/hide
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KAG7035479.1 Transcription factor TCP15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-89100Show/hide
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XP_022958512.1 transcription factor TCP14-like [Cucurbita moschata]8.0e-8899.43Show/hide
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XP_022996075.1 transcription factor TCP14-like [Cucurbita maxima]1.5e-8696.55Show/hide
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        GCKP+DPSSSTTTTTTAKT DGNNYAFPTVDEQVPLPNYEFDLVSDF+MELFA HINTLQEV ENSEREAEDDD
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XP_023533029.1 transcription factor TCP7-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-8999.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KDC7 TCP domain-containing protein2.1e-6576.76Show/hide
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        MGSK+MRVK+ TSNSPR+ P      ASESK IPSKA KDRHAKV GRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA
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          +L GC KP DPSSS T +TT      +TL GNNYAFP V+E +PLPNYEFDLVSDF+MELFA HI TLQEV ENSE+E EDDD
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A0A1S3CNQ2 transcription factor TCP72.1e-6577.3Show/hide
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        MGSKNMRVKK TSNSPR+ P      ASESK IPSKA KDRHAKV GRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA
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          +L GC KP DPSSS   +TT      +TL GNNYAFPTV+E +PLPNYEFDLVSDF+MELFA HI TLQEV ENSE+E ED D
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A0A5A7T0X8 Transcription factor TCP72.1e-6577.3Show/hide
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        MGSKNMRVKK TSNSPR+ P      ASESK IPSKA KDRHAKV GRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA
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          +L GC KP DPSSS   +TT      +TL GNNYAFPTV+E +PLPNYEFDLVSDF+MELFA HI TLQEV ENSE+E ED D
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A0A6J1H216 transcription factor TCP14-like3.9e-8899.43Show/hide
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        GCKPSDPSSS TTTTTAKTLDGNNYAFPTVDEQVPLPNYEFDLVSDFEMELFARHINTLQEVPENSEREAEDDD
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A0A6J1K5P6 transcription factor TCP14-like7.3e-8796.55Show/hide
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        GCKP+DPSSSTTTTTTAKT DGNNYAFPTVDEQVPLPNYEFDLVSDF+MELFA HINTLQEV ENSEREAEDDD
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53PH2 Transcription factor PCF32.2e-1976.79Show/hide
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        KDRH KV+GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+KTDG+T+EWLL++AEP+I+A TG
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Q93Z00 Transcription factor TCP141.4e-1844.96Show/hide
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        K+       S   A++  P+   + KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEPS+IA TG   I +    L+    S  
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        SS +  +   + A T   NN   P + +Q
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Q9C7G4 Transcription factor TCP221.4e-1856.47Show/hide
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        N+     +S S  S    +  K    K  KDRH KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP+IIA TG
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Q9C9L2 Transcription factor TCP158.7e-2163.16Show/hide
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        S  S PN+   KP P + + KDRH KV+GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP++IA TG
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Q9FTA2 Transcription factor TCP214.8e-1957.47Show/hide
Query:  KDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAAPELHGCKPSDPSSSTTTTTTAKTL
        KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG           G  P+  S+++ +T++  TL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G69690.1 TCP family transcription factor6.2e-2263.16Show/hide
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        S  S PN+   KP P + + KDRH KV+GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP++IA TG
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AT1G72010.1 TCP family transcription factor9.9e-2056.47Show/hide
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        N+     +S S  S    +  K    K  KDRH KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP+IIA TG
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AT3G47620.1 TEOSINTE BRANCHED, cycloidea and PCF (TCP) 149.9e-2044.96Show/hide
Query:  KKATSNSPRSVPNASESKPIPSKALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGK-DIASAAPELHGCKPSDP
        K+       S   A++  P+   + KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEPS+IA TG   I +    L+    S  
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Query:  SSSTTTT---TTAKTLDGNNYAFPTVDEQ
        SS +  +   + A T   NN   P + +Q
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AT5G08330.1 TCP family transcription factor3.4e-2057.47Show/hide
Query:  KDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAAPELHGCKPSDPSSSTTTTTTAKTL
        KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG           G  P+  S+++ +T++  TL
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AT5G23280.1 TCP family transcription factor9.9e-2053.19Show/hide
Query:  KDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAAPELHGCKPSDPSSSTTTTTTAKTLDGNNYAF
        KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG     A+           ++ST+      +L G    F
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTCAAAAAACATGAGAGTCAAGAAGGCTACATCTAACTCCCCAAGAAGTGTACCAAATGCCTCAGAGTCTAAGCCCATCCCTTCCAAAGCTCTGAAAGATCGCCA
TGCCAAGGTTCAGGGGCGCGATCGACGTATCCGCCTTCCACCATTGTGTGCAGCTCGGGTATTTCAGCTAACTCGCGAGCTTGGAAATAAAACAGATGGGCAGACTGTAG
AGTGGCTGTTGAAGAAGGCTGAGCCATCAATTATAGCTATAACTGGTAAAGATATTGCCTCTGCTGCTCCAGAGTTACATGGCTGCAAGCCTTCTGATCCATCTTCATCT
ACTACTACTACTACTACAGCAAAAACTTTGGATGGAAACAACTATGCATTCCCAACTGTTGATGAGCAGGTACCTTTGCCAAATTATGAATTTGACTTGGTCTCGGATTT
TGAGATGGAACTTTTTGCTCGTCATATCAACACTCTTCAAGAAGTACCAGAAAACTCCGAGAGAGAAGCCGAGGACGACGACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTTCAAAAAACATGAGAGTCAAGAAGGCTACATCTAACTCCCCAAGAAGTGTACCAAATGCCTCAGAGTCTAAGCCCATCCCTTCCAAAGCTCTGAAAGATCGCCA
TGCCAAGGTTCAGGGGCGCGATCGACGTATCCGCCTTCCACCATTGTGTGCAGCTCGGGTATTTCAGCTAACTCGCGAGCTTGGAAATAAAACAGATGGGCAGACTGTAG
AGTGGCTGTTGAAGAAGGCTGAGCCATCAATTATAGCTATAACTGGTAAAGATATTGCCTCTGCTGCTCCAGAGTTACATGGCTGCAAGCCTTCTGATCCATCTTCATCT
ACTACTACTACTACTACAGCAAAAACTTTGGATGGAAACAACTATGCATTCCCAACTGTTGATGAGCAGGTACCTTTGCCAAATTATGAATTTGACTTGGTCTCGGATTT
TGAGATGGAACTTTTTGCTCGTCATATCAACACTCTTCAAGAAGTACCAGAAAACTCCGAGAGAGAAGCCGAGGACGACGACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSKNMRVKKATSNSPRSVPNASESKPIPSKALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAAPELHGCKPSDPSSS
TTTTTTAKTLDGNNYAFPTVDEQVPLPNYEFDLVSDFEMELFARHINTLQEVPENSEREAEDDD