; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08742 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08742
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionCalmodulin
Genome locationCarg_Chr09:750569..751123
RNA-Seq ExpressionCarg08742
SyntenyCarg08742
Gene Ontology termsGO:0050790 - regulation of catalytic activity (biological process)
GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
GO:0030234 - enzyme regulator activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591338.1 putative calcium-binding protein CML41, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-9898.91Show/hide
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KAG7024217.1 putative calcium-binding protein CML41, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.6e-100100Show/hide
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XP_022936314.1 probable calcium-binding protein CML41 [Cucurbita moschata]8.4e-9697.28Show/hide
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XP_022974919.1 probable calcium-binding protein CML41 [Cucurbita maxima]1.4e-9596.2Show/hide
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XP_023535419.1 calmodulin-like protein 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.9e-9696.2Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CT00 probable calcium-binding protein CML413.8e-7075Show/hide
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        MA+S I+ PFKWF+ TN KLN P L  KHKP  S PP P        PPLAE AFRHLD DGDGKISGDEL+SYFAS+GEYMT D A+S+I +FD DGD 
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        LLELGDFERLVKG EEE++EDLKRAFEMFE EKGCGFIG  GLQKMFGRLGYVKS E+CM MI VFDVDGDGVIDY EFLRMMT
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A0A5A7UHX6 Putative calcium-binding protein CML413.8e-7075Show/hide
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A0A6J1CDM6 probable calcium-binding protein CML411.2e-6674.16Show/hide
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        +S  FKWFS +N KLN PRL F  KPT SNPPPPP   L  APPLAE AF HLDADGDGKIS DEL+SYFAS+GE +TRD+ R +IR+FDG+GD LLEL 
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        DF RL++  EEEE EDL+RAFEMFE EKGCGFIGP GLQKMF RLGYVKS +ECMAMI VFD++GDGVIDYREFLRMM
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A0A6J1F7Y7 probable calcium-binding protein CML414.1e-9697.28Show/hide
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A0A6J1IIY2 probable calcium-binding protein CML417.0e-9696.2Show/hide
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        LLELGDFERLVKGGEEEEKEDLK AFEMFE EKGCGFIGP GLQKMFGRLGYVKSIEECMAMIGVFDVDGDGVIDYREFLRMMT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L3R2 Probable calcium-binding protein CML411.1e-2942.64Show/hide
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         D D D  L   DF  L+        GE +   +LK AFEMFE EKG G I P GLQKM  +LG  ++  EC AMI  +D+DG+G++D+ EF +MMT
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Q8RYJ8 Putative calcium-binding protein CML198.7e-1944.78Show/hide
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        F   D D DGKIS  EL+    A++GE M+ + A +L+   D D D LL+  +F +L      G EEE    L  AF M+E E G G I PA L++M  +
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        LG  + IEEC  MI  FD+DGDGVI + EF  MM
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Q8RYK0 Probable calcium-binding protein CML311.5e-1841.26Show/hide
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          L++M  RLG  + I++C AMI  FD++GDGV+ + EF  MM
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Q9SRE6 Calcium-binding protein CML384.6e-2039.85Show/hide
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        G  ++ ++C  MI  FD++ DGV+ + EF  MM
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Q9SRE7 Calcium-binding protein CML393.0e-1937.5Show/hide
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         +LG  ++ ++C  MI  FD++ DGV+ + EF  MM
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G76640.1 Calcium-binding EF-hand family protein2.1e-2037.5Show/hide
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         +LG  ++ ++C  MI  FD++ DGV+ + EF  MM
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AT1G76650.1 calmodulin-like 383.3e-2139.85Show/hide
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        G  ++ ++C  MI  FD++ DGV+ + EF  MM
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AT1G76650.2 calmodulin-like 383.4e-1838.35Show/hide
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        G  ++ ++C  MI  FD++ DGV+ + EF  MM
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AT1G76650.3 calmodulin-like 383.3e-2139.85Show/hide
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        G  ++ ++C  MI  FD++ DGV+ + EF  MM
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AT3G50770.1 calmodulin-like 417.7e-3142.64Show/hide
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         D D D  L   DF  L+        GE +   +LK AFEMFE EKG G I P GLQKM  +LG  ++  EC AMI  +D+DG+G++D+ EF +MMT
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCTTTCACCCATTTCCACTCCCTTCAAATGGTTTTCCAACACCAATCTCAAGCTCAACCTCCCTCGCCTTCGCTTCAAACATAAGCCCACCCGGTCTAACCCTCC
TCCTCCACCACTACTCCTCCTCACGCCTGCGCCCCCGCTCGCCGAAGCTGCCTTCCGCCACCTCGATGCCGATGGAGACGGCAAAATCTCAGGGGACGAGCTCCAATCCT
ACTTTGCATCGGTCGGTGAGTACATGACACGGGACAATGCTCGAAGTCTGATAAGAGAGTTCGACGGGGATGGTGACTTGTTGCTGGAGCTCGGAGACTTCGAACGGCTG
GTGAAGGGCGGGGAGGAGGAAGAGAAGGAGGATCTGAAAAGGGCTTTTGAGATGTTTGAAGAAGAAAAGGGATGCGGATTCATCGGACCGGCAGGGCTGCAAAAGATGTT
TGGACGGCTTGGATACGTGAAATCCATAGAAGAGTGCATGGCTATGATCGGAGTGTTTGATGTTGACGGCGACGGTGTCATTGATTATCGTGAATTTCTCAGAATGATGA
CTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCCTTTCACCCATTTCCACTCCCTTCAAATGGTTTTCCAACACCAATCTCAAGCTCAACCTCCCTCGCCTTCGCTTCAAACATAAGCCCACCCGGTCTAACCCTCC
TCCTCCACCACTACTCCTCCTCACGCCTGCGCCCCCGCTCGCCGAAGCTGCCTTCCGCCACCTCGATGCCGATGGAGACGGCAAAATCTCAGGGGACGAGCTCCAATCCT
ACTTTGCATCGGTCGGTGAGTACATGACACGGGACAATGCTCGAAGTCTGATAAGAGAGTTCGACGGGGATGGTGACTTGTTGCTGGAGCTCGGAGACTTCGAACGGCTG
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CTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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