; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08833 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08833
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscriptional regulator SUPERMAN-like
Genome locationCarg_Chr02:9044173..9044904
RNA-Seq ExpressionCarg08833
SyntenyCarg08833
Gene Ontology termsGO:0007155 - cell adhesion (biological process)
GO:0019062 - virion attachment to host cell (biological process)
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606245.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-12597.94Show/hide
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KAG7036187.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.8e-129100Show/hide
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XP_022931230.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita moschata]4.3e-12497.12Show/hide
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XP_022995519.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita maxima]4.2e-11995.49Show/hide
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XP_023533595.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-12095.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LF36 C2H2-type domain-containing protein3.6e-6864.04Show/hide
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          NHR   +S   S S E    S ++ +DLELRLG  P  STQ LMEK   KIS+ EAACL++RSSD
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A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like3.3e-6963.3Show/hide
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A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like3.3e-6963.3Show/hide
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        L HQAPS++  P   SS+SSS+    SNSFIIP  DFNGGG LC+LY FPNP S               I SPSSLFSM HHSFN +  STS ++AFP+ 
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A0A6J1EYW0 zinc finger protein 10-like2.1e-12497.12Show/hide
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A0A6J1K623 transcriptional regulator SUPERMAN-like2.0e-11995.49Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 104.3e-1843.29Show/hide
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        P   +++ SWE  AFAED  D  G+ WPPRSYTC+FCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL QA    + P SSSS    S   + N      H+ +   
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        L V    PN Y     S +  +S  S   ++  +  +S  P + H    SS P S   E +  S
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN2.5e-1338.89Show/hide
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        +D   ++G +WPPRSYTC+FC+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q+PS++  P     + + S S+ +NS   P H         L P  +P Y  
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            SL   S H+  N   +               TS  +   +RN    +      L +E     S Q++DLELRLG A
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Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS2.5e-1352.81Show/hide
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        L PM T    D    W   E RAF  AE+     G  WPPRSY+C+FC REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q    ++ P S+  ++
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Q9SLB8 Zinc finger protein 117.7e-1559.46Show/hide
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        WPP++YTC+FCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q PS   +P         + + SSSSSSST+ + + P+
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC11.2e-0773.53Show/hide
Query:  RSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ
        RSY C+FC R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L Q
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 103.1e-1943.29Show/hide
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        P   +++ SWE  AFAED  D  G+ WPPRSYTC+FCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL QA    + P SSSS    S   + N      H+ +   
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Query:  LCVLYPFPNPYSIRSPSSLFSMSHHSFNNFMPSTSPASAFPIRNHRAGASSFPQSLSDEQAMES
        L V    PN Y     S +  +S  S   ++  +  +S  P + H    SS P S   E +  S
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AT2G42410.1 zinc finger protein 115.4e-1659.46Show/hide
Query:  WPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPF-------SSSSSSSSSSSSTSNSFIIPA
        WPP++YTC+FCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q PS   +P         + + SSSSSSST+ + + P+
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AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.8e-1438.89Show/hide
Query:  EDTADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAPSNAIKPFSSSSSSSSSSSSTSNSFIIPAHDFNGGGLCVLYPFPNP-YSI
        +D   ++G +WPPRSYTC+FC+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q+PS++  P     + + S S+ +NS   P H         L P  +P Y  
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            SL   S H+  N   +               TS  +   +RN    +      L +E     S Q++DLELRLG A
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AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein9.3e-2439.3Show/hide
Query:  SPMQTPDVVDEDDSWEVRAFAEDT-ADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAPSNAIKPFSSSSS---SSSSSSSTSNSF
        +P +  ++ D+D+SWEV+AF +DT  ++ GTTWPPRSYTC FCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA  R HQ  + A    S       +S +    + + 
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Query:  IIPAHDFNGGGLCVLYPFPNPYSIRSPSSLFSMSHHSFNNFMPSTSPASAFPIRNHRAGASSFPQSL-----------SDEQAMESSNQEVDLELRLGQA
        II +   N  GL       + Y +++PS +F  S    N +  ++ P S  P     +     P+ +           S ++A  +S  E+DLELRLG  
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Query:  P
        P
Subjt:  P

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.8e-1452.81Show/hide
Query:  LSPMQTPDVVDEDDSW---EVRAF--AEDTADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPFSSSSSS
        L PM T    D    W   E RAF  AE+     G  WPPRSY+C+FC REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q    ++ P S+  ++
Subjt:  LSPMQTPDVVDEDDSW---EVRAF--AEDTADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPFSSSSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCTCACCTTGACCTTCTCTTTCAATACTCTTCTTCTTCTTCTTTTCTTCCTCTTTCTCAAATTACTCGAGACGGGTCGGCTCCGAACAGTTTGAGCCCTATGCA
AACGCCGGACGTTGTCGACGAAGATGACTCGTGGGAAGTCAGGGCTTTCGCGGAGGACACGGCTGATGTCATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCATACACTTGCACTT
TTTGTAGAAGAGAGTTCAGGTCTGCTCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGATCGTGCTCGGCTCCATCAAGCCCCGTCGAACGCAATCAAACCCTTT
TCCTCCTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACTTCGAATTCTTTCATTATCCCAGCTCATGATTTTAATGGTGGAGGGTTGTGTGTTCTCTACCCATTCCCAAA
CCCTTACAGCATTCGCTCACCCTCTTCTCTTTTCTCTATGTCCCATCATTCCTTCAACAACTTCATGCCCTCGACCTCGCCCGCCTCAGCCTTTCCGATTCGTAATCACC
GTGCCGGAGCGAGTAGTTTCCCTCAATCCTTGAGTGATGAACAAGCCATGGAAAGTAGCAACCAAGAGGTTGATCTAGAGCTCAGGCTTGGACAAGCTCCTTCAACTCAA
ACTCTCATGGAAAAGAGACACAAAATCTCTAATTTTGAAGCTGCCTGTCTGAGGAAGAGATCATCAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCTCACCTTGACCTTCTCTTTCAATACTCTTCTTCTTCTTCTTTTCTTCCTCTTTCTCAAATTACTCGAGACGGGTCGGCTCCGAACAGTTTGAGCCCTATGCA
AACGCCGGACGTTGTCGACGAAGATGACTCGTGGGAAGTCAGGGCTTTCGCGGAGGACACGGCTGATGTCATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCATACACTTGCACTT
TTTGTAGAAGAGAGTTCAGGTCTGCTCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGATCGTGCTCGGCTCCATCAAGCCCCGTCGAACGCAATCAAACCCTTT
TCCTCCTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACTTCGAATTCTTTCATTATCCCAGCTCATGATTTTAATGGTGGAGGGTTGTGTGTTCTCTACCCATTCCCAAA
CCCTTACAGCATTCGCTCACCCTCTTCTCTTTTCTCTATGTCCCATCATTCCTTCAACAACTTCATGCCCTCGACCTCGCCCGCCTCAGCCTTTCCGATTCGTAATCACC
GTGCCGGAGCGAGTAGTTTCCCTCAATCCTTGAGTGATGAACAAGCCATGGAAAGTAGCAACCAAGAGGTTGATCTAGAGCTCAGGCTTGGACAAGCTCCTTCAACTCAA
ACTCTCATGGAAAAGAGACACAAAATCTCTAATTTTGAAGCTGCCTGTCTGAGGAAGAGATCATCAGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SSSSSSSSSSSSTSNSFIIPAHDFNGGGLCVLYPFPNPYSIRSPSSLFSMSHHSFNNFMPSTSPASAFPIRNHRAGASSFPQSLSDEQAMESSNQEVDLELRLGQAPSTQ
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