; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08846 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08846
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL29-like
Genome locationCarg_Chr02:9093976..9094881
RNA-Seq ExpressionCarg08846
SyntenyCarg08846
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606259.1 RING-H2 finger protein ATL29, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-16799.67Show/hide
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KAG7036200.1 RING-H2 finger protein ATL29, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.1e-168100Show/hide
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XP_022996104.1 RING-H2 finger protein ATL29-like, partial [Cucurbita maxima]6.3e-15793.02Show/hide
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XP_023533947.1 RING-H2 finger protein ATL29-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-16498Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI09 RING-H2 finger protein ATL298.4e-11570Show/hide
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A0A6J1ESF8 RING-H2 finger protein ATL29-like1.2e-16698.67Show/hide
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A0A6J1HG37 RING-H2 finger protein ATL292.0e-11671.8Show/hide
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A0A6J1HV34 LOW QUALITY PROTEIN: RING-H2 finger protein ATL29-like8.4e-11571.38Show/hide
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A0A6J1K7T3 RING-H2 finger protein ATL29-like3.0e-15793.02Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O49691 RING-H2 finger protein ATL292.8e-5946.84Show/hide
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        P Q + +PPLT++LT+IL+ F F+GFF++Y C+C +D+ + +  +     + S N L      P  P GL+  +INSFPTFPYS +K+ R +  GLECAI
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        CLLEF+ +  LRLLT CYHVFHQECIDLW ESH+TCPVCRR+LD             PP  + + ++++ I   I E +D + D        +  +    
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          +T  ++KE++  +KFSRSHSTG SIV+ K E E ++ L LPEHVKIK+ RGH+ T SCVTF EL RN
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Q6NKR1 RING-H2 finger protein ATL288.3e-3536.45Show/hide
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        +T +  IP    FPS    S P+T+VLT +L+  +F GFFS++  + +++    + N++R+  G+L+H +  +P   TGLDP +I SFP F YS   +  
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          N G ECAICL EF+DE  +RL+TVC H FH  CIDLW E HKTCPVCR  LD  +             +   ES  + ++I I        D + D+ 
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            +   K+ IE        S  +FSRSHSTG  +VK                  +K  R H  TGSCV+F+EL R    G G+  L   GD +++ +
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Q8RXX9 E3 ubiquitin-protein ligase ATL65.0e-2434.92Show/hide
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        SP + +++ +++ A  F+GFFSIY   C  V D+ +      RS +           AA  GLD  ++ +FPTF YS +K  +     LECAICL EF D
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        +  LRLL  C HVFH  CID WLE+H TCPVCR NL                + +  ES+E         + D +      + E   +    +++ T EV
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Query:  EKEE--------SRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILR
        +            R KFSRSH+TG S+V+   E   R  L LPE V+ +I++
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Q9FIR0 RING-H2 finger protein ATL306.3e-5143.21Show/hide
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        T +P+P Q ++ PPL I+LT+IL+   F+GFF+IY C+C   +   + N         N +    +   P    GL+P +I S+P FP+S +K+ R D  
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Query:  GLECAICLLEFNDES-FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGS
        GLECAICLLEF +E   LRLLT CYHVFHQECID WLES+KTCPVCRRNLD +   N             +E I + I  +  E+ D +  S +++   S
Subjt:  GLECAICLLEFNDES-FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGS

Query:  CSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGH--NWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSEL
          + G    + E +       KFSRS +TG SIV+ K E E R+ L LP+HVKIK+ R H  N T SC++F EL RN    G F E+
Subjt:  CSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGH--NWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSEL

Q9LQM2 RING-H2 finger protein ATL817.5e-2836.08Show/hide
Query:  PSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSF--IHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAIC
        P     S P+TIVLT  L+  +F GFFS + C C+      I + +  R+   NL+ PSN  P    GLD  +I SFP +PYS +K+  +D    +C+IC
Subjt:  PSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSF--IHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAIC

Query:  LLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTS------HRESI-EDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSC
        L EF D+  +RL++ C H FH  CIDLW E HKTCPVCRR LD +  R S +K  + P         H E +  D ++I + E+  +      +  +   
Subjt:  LLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTS------HRESI-EDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSC

Query:  SNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKI
               IE+ E   + S  +F RSHSTG SIV      +   +    + +KI+I
Subjt:  SNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32361.1 RING/U-box superfamily protein5.3e-2936.08Show/hide
Query:  PSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSF--IHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAIC
        P     S P+TIVLT  L+  +F GFFS + C C+      I + +  R+   NL+ PSN  P    GLD  +I SFP +PYS +K+  +D    +C+IC
Subjt:  PSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSF--IHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAIC

Query:  LLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTS------HRESI-EDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSC
        L EF D+  +RL++ C H FH  CIDLW E HKTCPVCRR LD +  R S +K  + P         H E +  D ++I + E+  +      +  +   
Subjt:  LLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTS------HRESI-EDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSC

Query:  SNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKI
               IE+ E   + S  +F RSHSTG SIV      +   +    + +KI+I
Subjt:  SNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKI

AT2G35420.1 RING/U-box superfamily protein5.9e-3636.45Show/hide
Query:  STDLTRIP----FPSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFIHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFR
        +T +  IP    FPS    S P+T+VLT +L+  +F GFFS++  + +++    + N++R+  G+L+H +  +P   TGLDP +I SFP F YS   +  
Subjt:  STDLTRIP----FPSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFIHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFR

Query:  SDNVGLECAICLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDN
          N G ECAICL EF+DE  +RL+TVC H FH  CIDLW E HKTCPVCR  LD  +             +   ES  + ++I I        D + D+ 
Subjt:  SDNVGLECAICLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDN

Query:  EGSCSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSELCERGDRNNLQK
            +   K+ IE        S  +FSRSHSTG  +VK                  +K  R H  TGSCV+F+EL R    G G+  L   GD +++ +
Subjt:  EGSCSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSELCERGDRNNLQK

AT3G05200.1 RING/U-box superfamily protein3.6e-2534.92Show/hide
Query:  SPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRC--VVDSFIHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAICLLEFND
        SP + +++ +++ A  F+GFFSIY   C  V D+ +      RS +           AA  GLD  ++ +FPTF YS +K  +     LECAICL EF D
Subjt:  SPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRC--VVDSFIHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAICLLEFND

Query:  ESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQRIETEEV
        +  LRLL  C HVFH  CID WLE+H TCPVCR NL                + +  ES+E         + D +      + E   +    +++ T EV
Subjt:  ESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQRIETEEV

Query:  EKEE--------SRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILR
        +            R KFSRSH+TG S+V+   E   R  L LPE V+ +I++
Subjt:  EKEE--------SRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILR

AT4G17920.1 RING/U-box superfamily protein2.0e-6046.84Show/hide
Query:  PSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFIHSRNVRR---STSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAI
        P Q + +PPLT++LT+IL+ F F+GFF++Y C+C +D+ + +  +     + S N L      P  P GL+  +INSFPTFPYS +K+ R +  GLECAI
Subjt:  PSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFIHSRNVRR---STSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAI

Query:  CLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQ
        CLLEF+ +  LRLLT CYHVFHQECIDLW ESH+TCPVCRR+LD             PP  + + ++++ I   I E +D + D        +  +    
Subjt:  CLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQ

Query:  RIETEEVEKEES-RKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARN
          +T  ++KE++  +KFSRSHSTG SIV+ K E E ++ L LPEHVKIK+ RGH+ T SCVTF EL RN
Subjt:  RIETEEVEKEES-RKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARN

AT5G46650.1 RING/U-box superfamily protein4.5e-5243.21Show/hide
Query:  TRIPFPSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFIHSRN--VRRSTSGNLLHPSND--SPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNV
        T +P+P Q ++ PPL I+LT+IL+   F+GFF+IY C+C   +   + N         N +    +   P    GL+P +I S+P FP+S +K+ R D  
Subjt:  TRIPFPSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFIHSRN--VRRSTSGNLLHPSND--SPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNV

Query:  GLECAICLLEFNDES-FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGS
        GLECAICLLEF +E   LRLLT CYHVFHQECID WLES+KTCPVCRRNLD +   N             +E I + I  +  E+ D +  S +++   S
Subjt:  GLECAICLLEFNDES-FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGS

Query:  CSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGH--NWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSEL
          + G    + E +       KFSRS +TG SIV+ K E E R+ L LP+HVKIK+ R H  N T SC++F EL RN    G F E+
Subjt:  CSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGH--NWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSEL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCACCGATTTGACTCGCATTCCTTTCCCCTCACAAGATCACGCCAGTCCTCCTCTCACCATTGTCCTCACACTCATCCTCGTTGCCTTCCTCTTCGTCGGTTTCTT
CTCCATCTACTGCTGCCGCTGCGTTGTGGACTCCTTCATCCATTCCCGCAACGTCCGCCGCTCTACCTCCGGCAACCTTCTCCACCCTTCCAACGATTCCCCTGCCGCCC
CTACTGGCCTCGACCCACTTCTCATCAACTCCTTTCCCACTTTCCCATATTCCAAAATCAAGGAATTTCGCAGTGACAATGTGGGATTAGAATGCGCCATTTGCCTTCTC
GAATTCAACGACGAGAGCTTCCTTCGCCTTCTCACTGTTTGCTACCATGTTTTCCATCAGGAGTGCATTGATCTCTGGCTCGAATCCCACAAGACCTGCCCTGTTTGCAG
GAGAAATCTCGACTCCGATTTGCGGAGGAATTCTGCTGATAAGACCTCTGATCCACCACGAACTTCCCACCGTGAGTCAATTGAAGATGCTATTAGTATTGATATTGATG
AGGACGCCGACGCCGATGCCGATTCCGATGCCGATGACAATGAGGGCTCTTGTTCGAACAAGGGAAAACAGAGGATTGAAACAGAGGAGGTGGAGAAGGAAGAGAGTAGG
AAGAAATTCTCGAGATCGCATTCGACAGGGCGTTCGATTGTGAAGGCGAAAAGAGAAGGAGAAAGTCGGCATAAGTTGATATTACCGGAGCACGTGAAGATTAAGATCCT
AAGAGGACATAATTGGACGGGGAGTTGCGTGACATTTGAGGAGTTGGCGAGGAACCCTAGCAATGGCGGTGGGTTTTCAGAGCTCTGTGAAAGGGGTGATCGGAATAACT
TGCAGAAGCCGGCATGTTCAGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCACCGATTTGACTCGCATTCCTTTCCCCTCACAAGATCACGCCAGTCCTCCTCTCACCATTGTCCTCACACTCATCCTCGTTGCCTTCCTCTTCGTCGGTTTCTT
CTCCATCTACTGCTGCCGCTGCGTTGTGGACTCCTTCATCCATTCCCGCAACGTCCGCCGCTCTACCTCCGGCAACCTTCTCCACCCTTCCAACGATTCCCCTGCCGCCC
CTACTGGCCTCGACCCACTTCTCATCAACTCCTTTCCCACTTTCCCATATTCCAAAATCAAGGAATTTCGCAGTGACAATGTGGGATTAGAATGCGCCATTTGCCTTCTC
GAATTCAACGACGAGAGCTTCCTTCGCCTTCTCACTGTTTGCTACCATGTTTTCCATCAGGAGTGCATTGATCTCTGGCTCGAATCCCACAAGACCTGCCCTGTTTGCAG
GAGAAATCTCGACTCCGATTTGCGGAGGAATTCTGCTGATAAGACCTCTGATCCACCACGAACTTCCCACCGTGAGTCAATTGAAGATGCTATTAGTATTGATATTGATG
AGGACGCCGACGCCGATGCCGATTCCGATGCCGATGACAATGAGGGCTCTTGTTCGAACAAGGGAAAACAGAGGATTGAAACAGAGGAGGTGGAGAAGGAAGAGAGTAGG
AAGAAATTCTCGAGATCGCATTCGACAGGGCGTTCGATTGTGAAGGCGAAAAGAGAAGGAGAAAGTCGGCATAAGTTGATATTACCGGAGCACGTGAAGATTAAGATCCT
AAGAGGACATAATTGGACGGGGAGTTGCGTGACATTTGAGGAGTTGGCGAGGAACCCTAGCAATGGCGGTGGGTTTTCAGAGCTCTGTGAAAGGGGTGATCGGAATAACT
TGCAGAAGCCGGCATGTTCAGTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSTDLTRIPFPSQDHASPPLTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFIHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAICLL
EFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQRIETEEVEKEESR
KKFSRSHSTGRSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSELCERGDRNNLQKPACSV