; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08911 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08911
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr02:9414747..9416675
RNA-Seq ExpressionCarg08911
SyntenyCarg08911
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606324.1 Ribonuclease P protein subunit p25-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-89100Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
        MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG

Query:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
        RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

KAG7036263.1 hypothetical protein SDJN02_03066 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-89100Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
        MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG

Query:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
        RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

XP_022930956.1 uncharacterized protein LOC111437294 isoform X1 [Cucurbita moschata]5.2e-8798.29Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
        MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG

Query:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
        RDDDQ S DSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHC PRKGSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

XP_022995597.1 uncharacterized protein LOC111491086 isoform X1 [Cucurbita maxima]8.3e-8595.43Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
        MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTT VEQCSKK+VISNGETK KAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRN+EAPG
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG

Query:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
         DDDQ S DSRK+SFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

XP_023534170.1 uncharacterized protein LOC111795811 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-8797.71Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
        MQQYWIQKMINEDIAKGM+EIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETK KAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG

Query:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
        RDDDQ S DSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BYW0 uncharacterized protein LOC1034949082.4e-6175.14Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQC---SKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNRE
        MQQYWIQKM  EDIA+G+ EIGQ AD  SVHAGTKVLPITD TL EQC   S+K+V++NGE KTKAKSRMKELLRWA+AS+S+KGGKFIT KVSR RNR 
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQC---SKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNRE

Query:  A--PGRDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSS-FKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
            G DDD+ S DS K+SFRWEAE  SS+SS YSS+S VS+ FKNCSITLNSTAI EIN CYPR+GSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  A--PGRDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSS-FKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

A0A5A7VF02 Uncharacterized protein2.4e-6175.14Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQC---SKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNRE
        MQQYWIQKM  EDIA+G+ EIGQ AD  SVHAGTKVLPITD TL EQC   S+K+V++NGE KTKAKSRMKELLRWA+AS+S+KGGKFIT KVSR RNR 
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQC---SKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNRE

Query:  A--PGRDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSS-FKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
            G DDD+ S DS K+SFRWEAE  SS+SS YSS+S VS+ FKNCSITLNSTAI EIN CYPR+GSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  A--PGRDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSS-FKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

A0A6J1DRU9 uncharacterized protein LOC1110237254.5e-6071.11Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSK---KEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNRE
        M QYWIQKM  EDI + +REIGQ ADS S HAGT+VLPITD ++VEQCS    K+V+ NGE+K KAKSRMKELLRWA+ASKS+KGG+FIT K SR RNRE
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSK---KEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNRE

Query:  A--PGRDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
            G DDD+ S DS K+SFRWE E  S+VSS YSS+S VSS +NCS+TL STAI+EINH YPRKGSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  A--PGRDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

A0A6J1ESC4 uncharacterized protein LOC111437294 isoform X12.5e-8798.29Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
        MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG

Query:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
        RDDDQ S DSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHC PRKGSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

A0A6J1JZD2 uncharacterized protein LOC111491086 isoform X14.0e-8595.43Show/hide
Query:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG
        MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTT VEQCSKK+VISNGETK KAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRN+EAPG
Subjt:  MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPG

Query:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
         DDDQ S DSRK+SFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
Subjt:  RDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G24750.1 unknown protein6.5e-1137.96Show/hide
Query:  SKKEVISNGETKTKAK-SRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKV-SRTRNREA--------PGRDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSF
        + KE   + ++K KA  SRMKEL++WA A+KS K  KF T K+    +NR                ++S  S  +S RWE+    + +S+   +S VSS 
Subjt:  SKKEVISNGETKTKAK-SRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKV-SRTRNREA--------PGRDDDQVSIDSRKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSF

Query:  KNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL
            ++L+ T    +  C  RK +WITTDSEFVVLEL
Subjt:  KNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAACAATATTGGATCCAAAAGATGATAAACGAAGATATTGCTAAGGGAATGAGAGAGATTGGTCAAATGGCAGATTCTCCTTCTGTTCATGCAGGCACCAAAGTCTT
GCCAATCACTGATACCACTTTAGTAGAGCAATGCAGCAAAAAAGAAGTTATCTCCAATGGGGAGACTAAAACCAAAGCCAAATCAAGAATGAAGGAGCTTTTGAGATGGG
CTGTGGCTTCAAAATCAAAAAAAGGAGGAAAGTTCATCACTGACAAGGTATCACGAACACGAAACCGAGAAGCTCCTGGCCGGGACGATGATCAAGTGAGCATCGACTCC
CGCAAGGTCAGTTTCAGATGGGAAGCTGAAAGACGCTCCTCCGTTTCCTCAACCTACTCATCGGTATCGCGAGTTTCGTCCTTCAAGAACTGTTCCATTACCCTTAATTC
CACTGCCATTGAAGAAATCAATCACTGTTATCCAAGAAAAGGAAGCTGGATCACTACAGATTCTGAATTTGTTGTGCTTGAGCTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAGCAACTTCTTCAATGGGTTTTCAAGGAAACTAACGAAAAAGATGGACATAGGACTTCACATTCCACCAAGAAGGGAGCAAGTTGGGGTAAGAGAAAAACTGCACA
CTACCTGTTTGATAAAATGTCTAACTGATCAAAGGAGATAGTGGTGTCTAGTCCAAGAACTGAGGACTTTGATAACATGCAACAATATTGGATCCAAAAGATGATAAACG
AAGATATTGCTAAGGGAATGAGAGAGATTGGTCAAATGGCAGATTCTCCTTCTGTTCATGCAGGCACCAAAGTCTTGCCAATCACTGATACCACTTTAGTAGAGCAATGC
AGCAAAAAAGAAGTTATCTCCAATGGGGAGACTAAAACCAAAGCCAAATCAAGAATGAAGGAGCTTTTGAGATGGGCTGTGGCTTCAAAATCAAAAAAAGGAGGAAAGTT
CATCACTGACAAGGTATCACGAACACGAAACCGAGAAGCTCCTGGCCGGGACGATGATCAAGTGAGCATCGACTCCCGCAAGGTCAGTTTCAGATGGGAAGCTGAAAGAC
GCTCCTCCGTTTCCTCAACCTACTCATCGGTATCGCGAGTTTCGTCCTTCAAGAACTGTTCCATTACCCTTAATTCCACTGCCATTGAAGAAATCAATCACTGTTATCCA
AGAAAAGGAAGCTGGATCACTACAGATTCTGAATTTGTTGTGCTTGAGCTGTGAAGGAAGAGGAAGACAGATTATCACCTGTTTGATCTACTTGCAATCTGTGAATTGTC
AGAGGATTTTTATGTAAATTTTTTTGAAGTATCTGTGAAGAACATGCATCTGAAGTAACATTTTGAATGTAATTCAAACCATCATCTAACAAGTTTTTAGTGTAAGAGGG
TAACTGAGCTTCACA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQQYWIQKMINEDIAKGMREIGQMADSPSVHAGTKVLPITDTTLVEQCSKKEVISNGETKTKAKSRMKELLRWAVASKSKKGGKFITDKVSRTRNREAPGRDDDQVSIDS
RKVSFRWEAERRSSVSSTYSSVSRVSSFKNCSITLNSTAIEEINHCYPRKGSWITTDSEFVVLEL