; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08912 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08912
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionProtein FAM98A-like isoform X1
Genome locationCarg_Chr02:9418041..9420100
RNA-Seq ExpressionCarg08912
SyntenyCarg08912
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002775 - DNA/RNA-binding protein Alba-like
IPR036882 - Alba-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606324.1 Ribonuclease P protein subunit p25-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.4e-14298.6Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPP---QQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGG
        MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPP   QQQQPPRQHRIYHNAVNED YGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGG
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPP---QQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGG

Query:  YGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQ
        YGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQ
Subjt:  YGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQ

KAG7036264.1 Ribonuclease P protein subunit p25-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-145100Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQ
        MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQ
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQ

Query:  YQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
        YQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
Subjt:  YQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV

XP_022930954.1 RNA-binding protein FUS-like [Cucurbita moschata]8.3e-14398.26Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQ----PPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQG
        MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQ    PPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQG
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQ----PPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQG

Query:  GYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
        GYG YQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
Subjt:  GYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV

XP_022995595.1 keratin, type I cytoskeletal 9-like [Cucurbita maxima]4.3e-13994.58Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPP-----QQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGG-------YGNYQ
        MTRHVSMISITLSNRELNK+SPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPP     QQQQPPRQH IYHNA NEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGG       YGNYQ
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPP-----QQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGG-------YGNYQ

Query:  GGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
        GGYG YQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
Subjt:  GGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV

XP_023533717.1 uncharacterized protein LOC111795492 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.4e-14297.23Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQ------PPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNY
        MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQ      PPRQHRIY+NAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNY
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQ------PPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNY

Query:  QGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
        QGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGR+RGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
Subjt:  QGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BYB0 protein FAM98A-like isoform X26.0e-12390.78Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPE PINENEIRIT+QGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAI+EI+KKRI RLHQ  AISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQ
        MTRHVSMISITLSNRELNK+SPGYQAP+FVEQPKQQYNN QQP  Q  PPRQ R+YHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYG 
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQ

Query:  YQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQ
        YQGGYG YQGGSDNY GG GYYQDN    GGYSNWGRGGGRSR GWAYRGAGYERGRG GGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQ
Subjt:  YQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQ

A0A5A7VGR8 Protein FAM98A-like isoform X16.0e-12390.78Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPE PINENEIRIT+QGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAI+EI+KKRI RLHQ  AISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQ
        MTRHVSMISITLSNRELNK+SPGYQAP+FVEQPKQQYNN QQP  Q  PPRQ R+YHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYG 
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQ

Query:  YQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQ
        YQGGYG YQGGSDNY GG GYYQDN    GGYSNWGRGGGRSR GWAYRGAGYERGRG GGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQ
Subjt:  YQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQ

A0A6J1ESY4 RNA-binding protein FUS-like4.0e-14398.26Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQ----PPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQG
        MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQ    PPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQG
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQ----PPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQG

Query:  GYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
        GYG YQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
Subjt:  GYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV

A0A6J1HIE0 protein FAM98A isoform X41.9e-12189.4Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPELPI+ENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVR+IVLKAMGQAISKAVAI+EI+KKRI RLHQ  AISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNN---QQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGG
        MTRHVSMISITLSNRELNK+SPGYQAP+FVEQPKQQYNN   QQQ P QQ PPRQ R+YHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGG
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNN---QQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGG

Query:  YGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGG
        YG YQGGYG YQGGSDNY GG GYYQDN    GGYSNWGRGGGRSR GWAYRGAGYERGRG GGRGY RGRGRMGGR RG GG
Subjt:  YGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGG

A0A6J1K4E2 keratin, type I cytoskeletal 9-like2.1e-13994.58Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPP-----QQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGG-------YGNYQ
        MTRHVSMISITLSNRELNK+SPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPP     QQQQPPRQH IYHNA NEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGG       YGNYQ
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPP-----QQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGG-------YGNYQ

Query:  GGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
        GGYG YQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
Subjt:  GGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8N5L8 Ribonuclease P protein subunit p25-like protein8.4e-1333.82Show/hide
Query:  MDRYQK-------VEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPI-
        M+ Y+K          P P+LP +  E+R+     IRN +  A   L+    R +V    G+A  KAV+ +EI+K+R+P LHQL  +  +   D W P  
Subjt:  MDRYQK-------VEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPI-

Query:  -EEGLVPVEMTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAP
         + GL P+ + RHV  + + LS   L+ +  GYQ P
Subjt:  -EEGLVPVEMTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAP

Q99JH1 Ribonuclease P protein subunit p25-like protein3.8e-1336.67Show/hide
Query:  PKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPI--EEGLVPVEMTRHVSM
        P P+LP +  E+R+     IRN +  A   L+    R +V    G+A  KAV+ +EI+K+R+P LHQL  +  +   D W P   + GL P+ + RHV  
Subjt:  PKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPI--EEGLVPVEMTRHVSM

Query:  ISITLSNRELNKSSPGYQAP
        + + LS   L+ S  GYQ P
Subjt:  ISITLSNRELNKSSPGYQAP

Q9SL15 Glycine-rich protein 34.9e-0552.75Show/hide
Query:  VNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRG
        V  D  G G   G     G  +GG GNYQGG GNYQGG G YQGG G+YQGG   Y GG G YQ  G  QGG    G GG   R G  YRG
Subjt:  VNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G20220.1 Alba DNA/RNA-binding protein5.9e-3845.74Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MD+YQ+VEKPK + PI ENEIRIT+ G  RNYITYA  LLQE +  E++ KAMG+AI+K+V I E+IK+RIP LHQ+ +I S  ITD WEP EEGL  +E
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGR-GRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYG
         TRHVSMI+ITLS  +LN SS GYQ P  +E  K                    I +   +  P G+G  RGR GRGRG GRGG GN         GG G
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGR-GRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYG

Query:  QYQGGYG----QYQGGSDNYHG-GSGY----YQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGW-AYRGAG---------YERGRGVGGRGY----------------
        +   G G    +Y  G     G GSGY    Y D G  Q    ++GRG GR RGG    RG G         YE  +  G  GY                
Subjt:  QYQGGYG----QYQGGSDNYHG-GSGY----YQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGW-AYRGAG---------YERGRGVGGRGY----------------

Query:  -GRGRGR-MGGRARGSG
         GRGRGR  GGR RG G
Subjt:  -GRGRGR-MGGRARGSG

AT1G76010.1 Alba DNA/RNA-binding protein1.3e-4047.75Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MD+YQ+V KPK + PI+ NEIRIT+QG  RNYITYA TLLQ+K   E+V KAMG+AI+K V I E+IK+RIP LHQ  +I S  ITD WEP EEGL+P+E
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQ----QYNNQQQPPQQQQPPR------------QHRIYHNAVNED-------PYGQGRGRGRGR-G
         TRHVSMI+ITLS  ELN SS GYQ P  +E  K      Y  ++  P  +   R            +   Y N  +ED        YG+GRGRGRGR  
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQ----QYNNQQQPPQQQQPPR------------QHRIYHNAVNED-------PYGQGRGRGRGR-G

Query:  RGWGRGGYGN--------YQGGYG----------NYQGGYG---QYQGGYG--QYQGGSDNYHGGSGY---YQDNGNYQGGYSNWGRGG--GRSRGGWAY
        RG GRGGY            GGYG          + +GGY    Q +GGY   Q +GG D   G  GY    Q  G Y G   + GRGG  G S+G   Y
Subjt:  RGWGRGGYGN--------YQGGYG----------NYQGGYG---QYQGGYG--QYQGGSDNYHGGSGY---YQDNGNYQGGYSNWGRGG--GRSRGGWAY

Query:  RGAGYERG--RGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSG
         G    RG   G  GRG GRGRGR GGR RG G
Subjt:  RGAGYERG--RGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSG

AT2G05520.1 glycine-rich protein 33.5e-0652.75Show/hide
Query:  VNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRG
        V  D  G G   G     G  +GG GNYQGG GNYQGG G YQGG G+YQGG   Y GG G YQ  G  QGG    G GG   R G  YRG
Subjt:  VNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRG

AT2G05520.2 glycine-rich protein 38.6e-0555.7Show/hide
Query:  RGRGWGRGGY---GNYQGGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRG
        RG G   G Y   G YQGG GNYQGG G YQGG G+YQGG   Y GG G YQ  G  QGG    G GG   R G  YRG
Subjt:  RGRGWGRGGY---GNYQGGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRG

AT3G07030.1 Alba DNA/RNA-binding protein2.4e-4748.72Show/hide
Query:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE
        MDRYQ+V KPKPE PINENEIRIT++G IRNYI+YA++LLQEK V++IVLKAMGQAISK VAISEI+K +IP LHQ IAISS+SITDVWEP EEGL PVE
Subjt:  MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVE

Query:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRG-------------RGRGRG---------
        +TRHVSMISITLS  ELNK SPGYQAP   +Q K QY        Q Q  RQ R+ +NA  E+      G               + + +G         
Subjt:  MTRHVSMISITLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRG-------------RGRGRG---------

Query:  ---------------------WGRGGY-GNYQGGY-GNYQGGYGQYQG-GYGQ-----YQGGSDNYHG-------GSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGR-
                              GRGGY G   GGY G    GYG+ +  GYG+     Y GG D+ +G       G G     G  +GG+   GRGGGR 
Subjt:  ---------------------WGRGGY-GNYQGGY-GNYQGGYGQYQG-GYGQ-----YQGGSDNYHG-------GSGYYQDNGNYQGGYSNWGRGGGR-

Query:  -----SRGGWAYR----GAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV
              RGG+  R    G GY  GRG  G G GRG G  GGR  G GG +V
Subjt:  -----SRGGWAYR----GAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATAGGTATCAGAAGGTCGAGAAGCCCAAACCTGAATTACCTATTAACGAAAATGAGATCCGAATCACTACTCAAGGCGCCATTCGAAACTACATCACATATGCCTC
TACACTGCTCCAGGAAAAACGTGTCAGAGAGATCGTCTTAAAAGCAATGGGACAGGCAATCAGTAAAGCAGTGGCTATTTCAGAAATTATAAAGAAGAGAATACCGCGGT
TGCATCAACTAATAGCCATCAGTTCAGTTAGCATAACTGATGTATGGGAACCAATTGAAGAGGGTCTTGTACCGGTGGAGATGACTCGTCATGTCTCGATGATTTCAATT
ACATTGTCCAATCGAGAGCTAAATAAAAGTTCTCCAGGGTATCAAGCTCCATACTTTGTGGAACAGCCAAAGCAACAATATAACAATCAACAGCAGCCTCCTCAACAACA
ACAACCACCCAGACAACATCGCATTTATCACAATGCTGTTAATGAAGATCCATATGGCCAAGGGAGAGGACGTGGTAGAGGGAGAGGGCGCGGTTGGGGAAGAGGTGGAT
ATGGGAACTACCAAGGTGGATACGGCAACTACCAAGGTGGATACGGCCAGTACCAAGGTGGTTACGGCCAGTACCAAGGTGGATCTGACAACTACCATGGTGGATCTGGA
TATTATCAAGATAATGGGAACTATCAAGGTGGATATTCAAATTGGGGAAGAGGAGGTGGGCGGAGTAGAGGCGGCTGGGCTTATCGCGGAGCTGGATACGAAAGAGGCAG
AGGAGTAGGGGGTAGAGGTTATGGCCGTGGACGGGGGCGAATGGGCGGTCGGGCAAGGGGCAGTGGTGGAAACCAGGTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATAGGTATCAGAAGGTCGAGAAGCCCAAACCTGAATTACCTATTAACGAAAATGAGATCCGAATCACTACTCAAGGCGCCATTCGAAACTACATCACATATGCCTC
TACACTGCTCCAGGAAAAACGTGTCAGAGAGATCGTCTTAAAAGCAATGGGACAGGCAATCAGTAAAGCAGTGGCTATTTCAGAAATTATAAAGAAGAGAATACCGCGGT
TGCATCAACTAATAGCCATCAGTTCAGTTAGCATAACTGATGTATGGGAACCAATTGAAGAGGGTCTTGTACCGGTGGAGATGACTCGTCATGTCTCGATGATTTCAATT
ACATTGTCCAATCGAGAGCTAAATAAAAGTTCTCCAGGGTATCAAGCTCCATACTTTGTGGAACAGCCAAAGCAACAATATAACAATCAACAGCAGCCTCCTCAACAACA
ACAACCACCCAGACAACATCGCATTTATCACAATGCTGTTAATGAAGATCCATATGGCCAAGGGAGAGGACGTGGTAGAGGGAGAGGGCGCGGTTGGGGAAGAGGTGGAT
ATGGGAACTACCAAGGTGGATACGGCAACTACCAAGGTGGATACGGCCAGTACCAAGGTGGTTACGGCCAGTACCAAGGTGGATCTGACAACTACCATGGTGGATCTGGA
TATTATCAAGATAATGGGAACTATCAAGGTGGATATTCAAATTGGGGAAGAGGAGGTGGGCGGAGTAGAGGCGGCTGGGCTTATCGCGGAGCTGGATACGAAAGAGGCAG
AGGAGTAGGGGGTAGAGGTTATGGCCGTGGACGGGGGCGAATGGGCGGTCGGGCAAGGGGCAGTGGTGGAAACCAGGTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDRYQKVEKPKPELPINENEIRITTQGAIRNYITYASTLLQEKRVREIVLKAMGQAISKAVAISEIIKKRIPRLHQLIAISSVSITDVWEPIEEGLVPVEMTRHVSMISI
TLSNRELNKSSPGYQAPYFVEQPKQQYNNQQQPPQQQQPPRQHRIYHNAVNEDPYGQGRGRGRGRGRGWGRGGYGNYQGGYGNYQGGYGQYQGGYGQYQGGSDNYHGGSG
YYQDNGNYQGGYSNWGRGGGRSRGGWAYRGAGYERGRGVGGRGYGRGRGRMGGRARGSGGNQV