; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg08975 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg08975
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr02:9749101..9749709
RNA-Seq ExpressionCarg08975
SyntenyCarg08975
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606387.1 Transcriptional regulator TAC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-10597.03Show/hide
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KAG7036326.1 Transcriptional regulator TAC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.6e-110100Show/hide
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XP_022931183.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita moschata]7.1e-10494.2Show/hide
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XP_022995697.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita maxima]9.9e-9892.08Show/hide
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XP_023532933.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.9e-10293.72Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E031 transcriptional regulator SUPERMAN-like1.0e-5262.39Show/hide
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A0A5A7VDP2 Transcriptional regulator SUPERMAN-like1.0e-5262.39Show/hide
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A0A6J1EXQ3 transcriptional regulator SUPERMAN-like3.4e-10494.2Show/hide
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A0A6J1HUE7 transcriptional regulator TAC1-like1.5e-3852.07Show/hide
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        M+PN IP                ++DP+SKTTTEE +Q +N+MGSGRSYECVFCKRGFTTAQALGGHMNIHRKDRVK K      +PSKPE F +H +  
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                  H  FQTYFP SS+W LGS    +TTP  DHQ           +NN+++PQ LNAF     N+SL S+ +PA +  + R+KRS  N  ++D
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        D+N DELDLELRLGHDR
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A0A6J1JZP2 transcriptional regulator SUPERMAN-like4.8e-9892.08Show/hide
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        QTYFPTSSTWCLGS    TTTPS DHQLAYLHNNLNINNNN++SPQ LNAFKENWTNISLPSR+P PTLIN ++KRSDGNV DDDDNNDDELDLELRLGH
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        DR
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN3.1e-0946.05Show/hide
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        RSY C FCKR F +AQALGGHMN+HR+DR + +   + ++ S P P   +     +T   S   HHS  T FPT S
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Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS1.4e-0655.32Show/hide
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        A E G G       RSY C FC R F +AQALGGHMN+HR+DR + K
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Q9SLB8 Zinc finger protein 116.0e-0537.89Show/hide
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        ++Y C FC+R F +AQALGGHMN+HR+DR K +          ++ P + P P F+  S+   TT  +  S ++  S  T FP++    L STT+
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC13.7e-0748.48Show/hide
Query:  NHDD-QDPNSKTTTEEVEQANEMGSGRSYECVFCKRGFTTAQALGGHMNIHRKDRVKTKPNTTNNN
        N DD  D  SK + + V+  + +   RSY C FC RGF+ AQALGGHMNIHR+DR K +     +N
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42410.1 zinc finger protein 114.2e-0637.89Show/hide
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AT3G09290.1 telomerase activator12.7e-0848.48Show/hide
Query:  NHDD-QDPNSKTTTEEVEQANEMGSGRSYECVFCKRGFTTAQALGGHMNIHRKDRVKTKPNTTNNN
        N DD  D  SK + + V+  + +   RSY C FC RGF+ AQALGGHMNIHR+DR K +     +N
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AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein2.2e-1046.05Show/hide
Query:  RSYECVFCKRGFTTAQALGGHMNIHRKDRVKTKPNTTNNNPSKPEPFAHHSTLRPTTPLISTSHHHSFQTYFPTSS
        RSY C FCKR F +AQALGGHMN+HR+DR + +   + ++ S P P   +     +T   S   HHS  T FPT S
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AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein8.0e-0528.77Show/hide
Query:  DPNHIPNHDDQDPNSKTTT-EEVEQANEMGS---GRSYECVFCKRGFTTAQALGGHMNIHRKDRVKTKPNTTNNNPSKPEPFAHHSTLRPTTPLISTSHH
        +PN I   +D D + +    E+  + N  G+    RSY C FC+R F +AQALGGHMN+HR+DR  ++ +  +   +          L    P + T   
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Query:  HSFQTYFPTSSTWCLGSTTTTTTTPSQDHQL---AYLHNN----LNINNNNSSSPQALNAFKENWTNISLPSRTPAPTLINHR--NKRSDGNVEDDDDNN
                  +T  + ST +     S  +QL   + +  N    +N+    S  P  L      ++ ++ P   P P LI +   +  S G++++    +
Subjt:  HSFQTYFPTSSTWCLGSTTTTTTTPSQDHQL---AYLHNN----LNINNNNSSSPQALNAFKENWTNISLPSRTPAPTLINHR--NKRSDGNVEDDDDNN

Query:  DDELDLELRLGH
         DELDLELRLGH
Subjt:  DDELDLELRLGH

AT5G43540.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.1e-0983.33Show/hide
Query:  RSYECVFCKRGFTTAQALGGHMNIHRKDRV
        R YEC FCKRGFT AQALGGHMNIHR+DR+
Subjt:  RSYECVFCKRGFTTAQALGGHMNIHRKDRV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCCTAACCATATCCCCAACCACGACGACCAAGATCCGAACTCGAAAACAACCACCGAGGAGGTCGAACAAGCCAACGAAATGGGCAGTGGCCGCTCCTACGAGTG
CGTATTTTGCAAACGAGGGTTCACAACCGCTCAAGCCCTAGGCGGTCACATGAACATCCACCGCAAAGACCGTGTGAAAACCAAGCCTAATACTACCAATAATAATCCCT
CCAAGCCCGAACCCTTCGCCCACCATTCAACTCTCCGCCCAACCACGCCACTAATCTCAACATCCCATCACCACTCTTTTCAAACCTATTTCCCCACTTCTTCCACTTGG
TGTTTGGGTTCCACTACCACTACTACTACTACTCCCTCCCAGGATCATCAATTGGCGTATCTTCACAACAACCTCAACATCAACAACAACAACAGCAGCAGTCCTCAAGC
TTTGAACGCGTTCAAGGAGAATTGGACGAATATCAGCCTCCCCTCACGCACGCCTGCCCCTACTTTGATCAATCATCGAAACAAGAGATCAGATGGTAACGTTGAAGACG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATCCTAACCATATCCCCAACCACGACGACCAAGATCCGAACTCGAAAACAACCACCGAGGAGGTCGAACAAGCCAACGAAATGGGCAGTGGCCGCTCCTACGAGTG
CGTATTTTGCAAACGAGGGTTCACAACCGCTCAAGCCCTAGGCGGTCACATGAACATCCACCGCAAAGACCGTGTGAAAACCAAGCCTAATACTACCAATAATAATCCCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDPNHIPNHDDQDPNSKTTTEEVEQANEMGSGRSYECVFCKRGFTTAQALGGHMNIHRKDRVKTKPNTTNNNPSKPEPFAHHSTLRPTTPLISTSHHHSFQTYFPTSSTW
CLGSTTTTTTTPSQDHQLAYLHNNLNINNNNSSSPQALNAFKENWTNISLPSRTPAPTLINHRNKRSDGNVEDDDDNNDDELDLELRLGHDR