; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09070 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09070
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionHomeobox-leucine zipper protein family
Genome locationCarg_Chr11:1739736..1740531
RNA-Seq ExpressionCarg09070
SyntenyCarg09070
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587716.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.7e-71100Show/hide
Query:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
        TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
Subjt:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL

Query:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL
        RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL
Subjt:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL

KAG7021681.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.7e-71100Show/hide
Query:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
        TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
Subjt:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL

Query:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL
        RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL
Subjt:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL

XP_022931479.1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like [Cucurbita moschata]1.7e-7099.32Show/hide
Query:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
        TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
Subjt:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL

Query:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL
        RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA+PNSPPL
Subjt:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL

XP_023531587.1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-7099.32Show/hide
Query:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
        TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
Subjt:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL

Query:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL
        RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA+PNSPPL
Subjt:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL

XP_038879995.1 homeobox-leucine zipper protein HOX17-like [Benincasa hispida]2.9e-5990.21Show/hide
Query:  NSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSI
        +S G+   RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKL+TTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL+S+
Subjt:  NSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSI

Query:  KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA-DPNSPP
        KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT AANAAA D NSPP
Subjt:  KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA-DPNSPP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M012 Homeobox domain-containing protein7.8e-5890.14Show/hide
Query:  NSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSI
        +S GSE  RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRS+
Subjt:  NSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSI

Query:  KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPP
        KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTP    A D NSPP
Subjt:  KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPP

A0A1S3BWH2 homeobox-leucine zipper protein HOX18-like1.6e-5890.28Show/hide
Query:  NSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSI
        +S GSE  RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRS+
Subjt:  NSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSI

Query:  KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAA--NAAADPNSPP
        KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRTPAA   AA D NSPP
Subjt:  KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAA--NAAADPNSPP

A0A5A7USQ4 Homeobox-leucine zipper protein HOX18-like1.6e-5890.28Show/hide
Query:  NSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSI
        +S GSE  RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRS+
Subjt:  NSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSI

Query:  KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAA--NAAADPNSPP
        KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITRTPAA   AA D NSPP
Subjt:  KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAA--NAAADPNSPP

A0A6J1BYS3 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like4.0e-5490.55Show/hide
Query:  ERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYI
        ERKKLRLSKEQ+ LLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKE+ ELRS+K+GASQLYI
Subjt:  ERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYI

Query:  QLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA
        QLPKAATLTICPSC+K+TR  AA AAA
Subjt:  QLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA

A0A6J1EUD1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like8.0e-7199.32Show/hide
Query:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
        TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
Subjt:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL

Query:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL
        RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA+PNSPPL
Subjt:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YW03 Homeobox-leucine zipper protein HOX271.7e-3867.97Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ
        RKKLRLSKEQ+  LEESFK H+TLNP QK ALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL KEL ELR++K  A   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADP
        LP A TL++CPSC+++   PA  + + P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADP

P46602 Homeobox-leucine zipper protein HAT35.4e-4063.7Show/hide
Query:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG
        G+  +  RKKLRLSKEQA +LEE+FK H+TLNP QK ALA QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRRL+KE+ ELR++KL 
Subjt:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG

Query:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADP
        +  LY+ +    TLT+CPSC+++  T ++++ A P
Subjt:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADP

P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT223.5e-3971.55Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+Q+ LLE++FKLH+TLNP QKQALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L+++KL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

Q01I23 Homeobox-leucine zipper protein HOX171.3e-3864.62Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LE+SF+ H TLNP QK  LA QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+CCE L EENRRL+KE+ ELR++KL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRT---PAANAAAD
        +    TLT+CPSC++++ T    +A AAAD
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRT---PAANAAAD

Q0JB92 Homeobox-leucine zipper protein HOX171.3e-3864.62Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LE+SF+ H TLNP QK  LA QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+CCE L EENRRL+KE+ ELR++KL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRT---PAANAAAD
        +    TLT+CPSC++++ T    +A AAAD
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRT---PAANAAAD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 42.1e-3963.16Show/hide
Query:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG
        G   +  RKKLRLSK+QA +LEE+FK H+TLNP QK ALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRRL+KE+ ELR++KL 
Subjt:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG

Query:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA
        +  LY+ +    TLT+CPSC++++ + A   AA
Subjt:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 33.8e-4163.7Show/hide
Query:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG
        G+  +  RKKLRLSKEQA +LEE+FK H+TLNP QK ALA QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRRL+KE+ ELR++KL 
Subjt:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG

Query:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADP
        +  LY+ +    TLT+CPSC+++  T ++++ A P
Subjt:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADP

AT4G16780.1 homeobox protein 24.7e-3964.34Show/hide
Query:  ERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQL
        +  RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK H+TLNP QKQALA QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL++CCE L EENRRL+KE+ ELR++KL + Q 
Subjt:  ERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQL

Query:  YIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA
        Y+ +    TLT+CPSC+ ++  P    AA
Subjt:  YIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family2.5e-4071.55Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+Q+ LLE++FKLH+TLNP QKQALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L+++KL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana1.4e-3864.44Show/hide
Query:  ERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGAS
        E    RKKLRLSK+Q+  LE+SFK H+TLNP QK ALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL+KE+ ELR++K  ++
Subjt:  ERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGAS

Query:  QLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNS
          Y+QLP A TLT+CPSC+++     A +AA P++
Subjt:  QLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ACCACAACCAACAGCCTCGGCTCCGAACGTGAAAGAGAGAGAAAAAAGCTTCGGCTTTCTAAAGAACAAGCCACTTTGCTCGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACTTT
GAATCCTGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCACCAATTAAACCTCAAAACACGACAAGTGGAAGTCTGGTTCCAAAACAGACGTGCAAGGACGAAATTGAAGCAAACGGAAG
TGGACTGCGAGTTCTTGAAGAAATGCTGCGAGAGGCTGAACGAAGAGAATCGGAGGTTGAAGAAAGAGTTGCATGAATTAAGATCCATCAAACTCGGAGCTTCCCAGTTG
TATATTCAGCTCCCCAAGGCGGCGACGCTCACAATTTGCCCCTCATGCGACAAGATCACCAGGACACCCGCCGCCAACGCCGCCGCCGACCCCAACTCTCCGCCACTATA
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACCACAACCAACAGCCTCGGCTCCGAACGTGAAAGAGAGAGAAAAAAGCTTCGGCTTTCTAAAGAACAAGCCACTTTGCTCGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACTTT
GAATCCTGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCACCAATTAAACCTCAAAACACGACAAGTGGAAGTCTGGTTCCAAAACAGACGTGCAAGGACGAAATTGAAGCAAACGGAAG
TGGACTGCGAGTTCTTGAAGAAATGCTGCGAGAGGCTGAACGAAGAGAATCGGAGGTTGAAGAAAGAGTTGCATGAATTAAGATCCATCAAACTCGGAGCTTCCCAGTTG
TATATTCAGCTCCCCAAGGCGGCGACGCTCACAATTTGCCCCTCATGCGACAAGATCACCAGGACACCCGCCGCCAACGCCGCCGCCGACCCCAACTCTCCGCCACTATA
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQL
YIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAADPNSPPL