; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09136 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09136
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor BEE 1-like
Genome locationCarg_Chr11:1404661..1406019
RNA-Seq ExpressionCarg09136
SyntenyCarg09136
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587654.1 Transcription factor BEE 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.5e-14299.62Show/hide
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KAG7021616.1 Transcription factor BEE 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.6e-143100Show/hide
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XP_023531057.1 transcription factor BEE 1-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.4e-13595.8Show/hide
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XP_023531058.1 transcription factor BEE 1-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-13696.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C0H1 transcription factor BEE 31.0e-9276.32Show/hide
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A0A6J1E0N6 transcription factor BEE 3-like4.6e-7767.04Show/hide
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A0A6J1EI66 transcription factor BEE 1-like1.8e-13496.17Show/hide
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A0A6J1I809 transcription factor BEE 1-like isoform X11.2e-13395.04Show/hide
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A0A6J1IDP3 transcription factor BEE 1-like isoform X24.8e-13595.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4D998 Transcription factor bHLH756.1e-3458.28Show/hide
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        K  SG  +R K  E+E      E +  ++VVHVRA+RGQATDSHSLAERVRR KINERL+CL+D+VPGCYK MGMAVMLD II+YV+SLQNQ+EFLSMKL
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        +AAS+  D NS     + +      H A E+ER++RE  G     F STLP
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Q8GWK7 Transcription factor BEE 32.9e-4453.81Show/hide
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        SL F N  P  F       + H    FP N+ + N     Q D     +  E     +    D + S+S    S  G  + KN S  +GKR K+ E+E+E
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Query:  KSRREVVHVRARRGQATDSHSLAERVRRGKINERLRCLKDIVPGCYKTMGMAVMLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKLAAASSFNDFNSKADALSKLQ-ARA
           REVVHVRARRGQATDSHS+AERVRRGKINERL+CL+DIVPGCYKTMGMA MLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKL AASS+ DFNS+ DA+  +Q A+A
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Query:  HEARELERLMREGYGGVACFHST
         EA E    M +G  G + FHS+
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Q8GZ13 Transcription factor BEE 13.4e-4553.3Show/hide
Query:  DNPSLNFTNLLPFS---NDMFIPHH-----HPP---PEFPQNLGDCNSFQIMQQDPPDPPACAEFHEMKKRRPMDVSESSSEIS--TSETGLFNAKNRS-
        +N +L+F    P S     +F+ HH     H P   P+   N    +SF     +  D        E KKR+ +  + SSSE S  +  T +   +  S 
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Query:  GKGKRLKSIEKEEEKSRREVVHVRARRGQATDSHSLAERVRRGKINERLRCLKDIVPGCYKTMGMAVMLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKLAAASSFNDFN
         +GKRLK  ++EE++  REVVHVRARRGQATDSHSLAERVRRGKINERLRCL+D+VPGCYK MGMA MLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKL AASSF DFN
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Query:  SKADALSKLQ-ARAHEARELERLMREG
        S+ DA+  +Q A+A E  E+ R  R+G
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Q93W88 Transcription factor bHLH1372.0e-2463.21Show/hide
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        K K+ K   KEE  +  + +HVRARRGQATDSHSLAERVRR KI+ER+R L+++VPGC K  G A+MLDEIINYVQ+LQ QVEFLSMKL + S    DF 
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Query:  SKADAL
        S  D L
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Q9SRT2 Transcription factor bHLH621.4e-2543.41Show/hide
Query:  SNDMFIPHHHPPPEFPQNLGDCNSFQIMQQDPPDPPACAEFHEM-KKRRPMDVSESSSEISTSETGLFNAKNRSGKGKRLKSIEKEEEKSR-----REVV
        +N  F  ++ PP    + +   +S  + +      PA     E+ +KR+      S S +S+S+      +      KR K  E+  +K++     ++ +
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Query:  HVRARRGQATDSHSLAERVRRGKINERLRCLKDIVPGCYKTMGMAVMLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKLAAASSFNDFNSKA
        HVRARRGQATDSHSLAERVRR KI+ER++ L+D+VPGC K  G A+MLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKL++ ++  DFN  A
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18400.1 BR enhanced expression 12.4e-4653.3Show/hide
Query:  DNPSLNFTNLLPFS---NDMFIPHH-----HPP---PEFPQNLGDCNSFQIMQQDPPDPPACAEFHEMKKRRPMDVSESSSEIS--TSETGLFNAKNRS-
        +N +L+F    P S     +F+ HH     H P   P+   N    +SF     +  D        E KKR+ +  + SSSE S  +  T +   +  S 
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Query:  GKGKRLKSIEKEEEKSRREVVHVRARRGQATDSHSLAERVRRGKINERLRCLKDIVPGCYKTMGMAVMLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKLAAASSFNDFN
         +GKRLK  ++EE++  REVVHVRARRGQATDSHSLAERVRRGKINERLRCL+D+VPGCYK MGMA MLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKL AASSF DFN
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Query:  SKADALSKLQ-ARAHEARELERLMREG
        S+ DA+  +Q A+A E  E+ R  R+G
Subjt:  SKADALSKLQ-ARAHEARELERLMREG

AT1G25330.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.3e-3558.28Show/hide
Query:  KNRSGKGKRLKSIEKE------EEKSRREVVHVRARRGQATDSHSLAERVRRGKINERLRCLKDIVPGCYKTMGMAVMLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKL
        K  SG  +R K  E+E      E +  ++VVHVRA+RGQATDSHSLAERVRR KINERL+CL+D+VPGCYK MGMAVMLD II+YV+SLQNQ+EFLSMKL
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Query:  AAASSFNDFNSKADALSKL--QARAHEARELERLMREGYG-GVACFHSTLP
        +AAS+  D NS     + +      H A E+ER++RE  G     F STLP
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AT1G73830.1 BR enhanced expression 32.1e-4553.81Show/hide
Query:  SLNFTNLLP--FSNDMFIPHHHPPPEFPQNLGDCNSFQIMQQDPPDPPACAEFHEMKKRRPMDVSESSSEISTSETGLFNAKNRSG-KGKRLKSIEKEEE
        SL F N  P  F       + H    FP N+ + N     Q D     +  E     +    D + S+S    S  G  + KN S  +GKR K+ E+E+E
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           REVVHVRARRGQATDSHS+AERVRRGKINERL+CL+DIVPGCYKTMGMA MLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKL AASS+ DFNS+ DA+  +Q A+A
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         EA E    M +G  G + FHS+
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AT1G73830.2 BR enhanced expression 38.4e-4754.05Show/hide
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        SL F N  P  F       + H    FP N+ + N     Q D     +  E     +    D + S+S    S  G  + KN S  +GKR K+ E+E+E
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           REVVHVRARRGQATDSHS+AERVRRGKINERL+CL+DIVPGCYKTMGMA MLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKL AASS+ DFNS+ DA+  +QA+A 
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        EA E    M +G  G + FHS+
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AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein9.6e-2743.41Show/hide
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        +N  F  ++ PP    + +   +S  + +      PA     E+ +KR+      S S +S+S+      +      KR K  E+  +K++     ++ +
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        HVRARRGQATDSHSLAERVRR KI+ER++ L+D+VPGC K  G A+MLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKL++ ++  DFN  A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCCTGAGTTGCAGTCCTTCAAGCCATCCTTCTCCTTCCCTGACTTCACGGATCCCAATTTTGAGCTAATGGCTCACTATTCCGCTTCCAACCCAGCTGTTTTAGA
CAACCCATCTCTGAATTTCACCAACCTCTTGCCTTTCTCAAACGACATGTTCATCCCTCACCACCATCCCCCACCAGAATTCCCACAGAATTTAGGAGACTGTAACAGCT
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AACTTTGCCTCTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATATTTTTGGTCATCAATTAATGATGGTGTACTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SETGLFNAKNRSGKGKRLKSIEKEEEKSRREVVHVRARRGQATDSHSLAERVRRGKINERLRCLKDIVPGCYKTMGMAVMLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKLAAASSFND
FNSKADALSKLQARAHEARELERLMREGYGGVACFHSTLPL