; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09233 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09233
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationCarg_Chr05:2438981..2441684
RNA-Seq ExpressionCarg09233
SyntenyCarg09233
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR031851 - Protein of unknown function DUF4750


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1HD13 uncharacterized protein LOC111462391 isoform X24.2e-4198.91Show/hide
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A0A6J1HES4 uncharacterized protein LOC111462391 isoform X14.2e-4198.91Show/hide
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A0A6J1KDG2 uncharacterized protein LOC111492244 isoform X14.6e-4097.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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        F++RP+LA+ F    I+L WFLAWKLVL HVPLVQEIFGLRKK+  PKP +R R++KFY ++ SQ
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTCGTCGTCTTCCTCGTTTTCATCTTTCGAGAATTCTTTTTCTCAATGGGATTATCTCAATCTATTCATACTACGCCCGATCCTTGCCGTCGTGTTCACGTTCTC
CTTGATTTCTCTTGGTTGGTTTTTGGCGTGGAAGCTCGTTCTTGTTCACGTCCCTCTGGTGCAAGAAATTTTTGGTTTGCGTAAGAAATCCGTCAAACCGAAGCCTCCAA
CCCGCCGACTATCGAAATTTTATAATAATTTGGATTCCCAAACTTCAGCTTCTGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATTGCGTGACTCACTCCTCGTGCAATTGAGCTCTTCTAATGGAGTCGTCGTCTTCCTCGTTTTCATCTTTCGAGAATTCTTTTTCTCAATGGGATTATCTCAATCTATT
CATACTACGCCCGATCCTTGCCGTCGTGTTCACGTTCTCCTTGATTTCTCTTGGTTGGTTTTTGGCGTGGAAGCTCGTTCTTGTTCACGTCCCTCTGGTGCAAGAAATTT
TTGGTTTGCGTAAGAAATCCGTCAAACCGAAGCCTCCAACCCGCCGACTATCGAAATTTTATAATAATTTGGATTCCCAAACTTCAGCTTCTGGCTGATGACTGTGATGG
TGATTGCCTCATCGAGTTCTGACATGAGCAATGGCTTATGCTTTGTTTTATTGTGACTGTAAATTCGGGTTACTCGAGTTCTTCAAGTTGTATATATTCACCTCTCTTCT
CAATTTCAAAGTCTTTACTCCTGTAAATTTGGGTTACTTGTATTTGTTGGACTAGTTATGGCTATTTTATCTTCATAAAGTTCTTTTTTTTTTCATTATTAATTGAGTTT
ATTCTTAAAGAAACTATGAATAGCATTTATTCGAAAAGGCGGGCTGTTACGGTACGAGTGTGATTGTGGGGTTTTGTCGTCATTTGGATTGGGGTGGAGTGCTCTGGTTT
GTGAGTTTCCCAGGTTGGTTTAGTAATTAGGGGTCGTCTTGAGATTGATTGAAAAGGCAGCCCAGCTGCCCCTCTCCTTAGTCGCCTACCTACTCGTGCTCGTAACTCGA
TCAGAGGTCAACAAGT
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