; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09287 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09287
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionProteasome subunit beta
Genome locationCarg_Chr05:2128088..2131039
RNA-Seq ExpressionCarg09287
SyntenyCarg09287
Gene Ontology termsGO:0010498 - proteasomal protein catabolic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0019774 - proteasome core complex, beta-subunit complex (cellular component)
GO:0004298 - threonine-type endopeptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000243 - Peptidase T1A, proteasome beta-subunit
IPR001353 - Proteasome, subunit alpha/beta
IPR016050 - Proteasome beta-type subunit, conserved site
IPR023333 - Proteasome B-type subunit
IPR029055 - Nucleophile aminohydrolases, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008445492.1 PREDICTED: proteasome subunit beta type-5 [Cucumis melo]8.9e-12499.55Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEM EVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

XP_022961789.1 proteasome subunit beta type-5-like [Cucurbita moschata]3.1e-124100Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

XP_023547083.1 proteasome subunit beta type-5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-124100Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

XP_038883961.1 proteasome subunit beta type-5 isoform X1 [Benincasa hispida]3.1e-124100Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

XP_038883962.1 proteasome subunit beta type-5 isoform X2 [Benincasa hispida]3.1e-124100Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KDM0 Proteasome subunit beta8.1e-12398.66Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCR H+LANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEM EVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

A0A1S3BCV3 Proteasome subunit beta4.3e-12499.55Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEM EVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

A0A5A7VGZ1 Proteasome subunit beta4.3e-12499.55Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEM EVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

A0A6J1HF19 Proteasome subunit beta1.5e-124100Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

A0A6J1KAW4 Proteasome subunit beta1.5e-124100Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23717 Proteasome subunit beta type-5-A1.9e-11388.79Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        M+K AKGTTTLAFIFK GVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLG+KCR HELANKRRISV+GASKLLAN+LYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVD+EGGRLKG RFSVGSGSPYAYGVLD+GY+YD+SVEEA+ELARR+IYHATFRDGASGGVASVY+VGP GW KLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTA
        ELHY+YYPV P T +Q M E TA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTA

O24361 Proteasome subunit beta type-51.6e-11588.84Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFK GVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLG+KCR HELANKRRISV GASKLLANILY+YRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKG RFSVGSGSPYAYGVLDNGY+YD++VEEA+ELARRAIYHAT+RDGASGGV SVY+VGP+GWKK++GDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA
        +LH+ YYPV P TV+QEM EV  A
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTAA

P28074 Proteasome subunit beta type-53.8e-7767.32Show/hide
Query:  GTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGT
        GTTTLAF F+ GV+VAADSRA+ G YI+SQ+VKK+IEINPY+LGTMAGGAADC FW R L  +CR +EL NK RISVA ASKLLAN++Y Y+GMGLS+GT
Subjt:  GTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGT

Query:  MIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVGELHYNY
        MI GWD+ GPGLYYVDSEG R+ G  FSVGSGS YAYGV+D GY YDL VE+A +LARRAIY AT+RD  SGG  ++Y+V  +GW ++S D+V +LH  Y
Subjt:  MIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVGELHYNY

Query:  YPVTP
           TP
Subjt:  YPVTP

Q5R8S2 Proteasome subunit beta type-53.8e-7767.32Show/hide
Query:  GTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGT
        GTTTLAF F+ GV+VAADSRA+ G YI+SQ+VKK+IEINPY+LGTMAGGAADC FW R L  +CR +EL NK RISVA ASKLLAN++Y Y+GMGLS+GT
Subjt:  GTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGT

Query:  MIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVGELHYNY
        MI GWD+ GPGLYYVDSEG R+ G  FSVGSGS YAYGV+D GY YDL VE+A +LARRAIY AT+RD  SGG  ++Y+V  +GW ++S D+V +LH  Y
Subjt:  MIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVGELHYNY

Query:  YPVTP
           TP
Subjt:  YPVTP

Q9LIP2 Proteasome subunit beta type-5-B1.5e-11389.55Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLG+KCR HELANKRRISV+GASKLLAN+LYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVD+EGGRLKG RFSVGSGSPYAYGVLD+GY++D+SVEEA+ELARR+IYHATFRDGASGGVASVY+VGP GW KLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAE
        ELHY+YYPV P T +  M E
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13060.1 20S proteasome beta subunit E11.4e-11488.79Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        M+K AKGTTTLAFIFK GVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLG+KCR HELANKRRISV+GASKLLAN+LYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVD+EGGRLKG RFSVGSGSPYAYGVLD+GY+YD+SVEEA+ELARR+IYHATFRDGASGGVASVY+VGP GW KLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTA
        ELHY+YYPV P T +Q M E TA
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTA

AT1G13060.2 20S proteasome beta subunit E11.6e-11080.16Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYIS------------------------SQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELA
        M+K AKGTTTLAFIFK GVMVAADSRASMGGYIS                        SQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLG+KCR HELA
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYIS------------------------SQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELA

Query:  NKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGA
        NKRRISV+GASKLLAN+LYSYRGMGLSVGTMIAGWDETGPGLYYVD+EGGRLKG RFSVGSGSPYAYGVLD+GY+YD+SVEEA+ELARR+IYHATFRDGA
Subjt:  NKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGA

Query:  SGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVGELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTA
        SGGVASVY+VGP GW KLSGDDVGELHY+YYPV P T +Q M E TA
Subjt:  SGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVGELHYNYYPVTPTTVDQEMAEVTA

AT3G26340.1 N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein1.1e-11489.55Show/hide
Query:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM
        MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLG+KCR HELANKRRISV+GASKLLAN+LYSYRGM
Subjt:  MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGM

Query:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG
        GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVD+EGGRLKG RFSVGSGSPYAYGVLD+GY++D+SVEEA+ELARR+IYHATFRDGASGGVASVY+VGP GW KLSGDDVG
Subjt:  GLSVGTMIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVG

Query:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAE
        ELHY+YYPV P T +  M E
Subjt:  ELHYNYYPVTPTTVDQEMAE

AT4G31300.1 N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein3.4e-2030.81Show/hide
Query:  GTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGT
        GTT +   +  GV++ ADSR S G Y+++++  KI ++   +    +G AAD Q     +     +H + + +  +V  ++ L+  + Y+ + M L  G 
Subjt:  GTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGT

Query:  MIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSV-GSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNG
        ++ GWD+   G  Y    GG +    F++ GSGS Y YG  D  ++ +++ EEA +L  +A+  A  RDGASGGV     +   G
Subjt:  MIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSV-GSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNG

AT4G31300.2 N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein3.4e-2030.27Show/hide
Query:  GTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGT
        GTT +   +  GV++ ADSR S G Y+++++  KI ++   +    +G AAD Q     +     +H + + +  +V  ++ L+  + Y+ +   L  G 
Subjt:  GTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGT

Query:  MIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSV-GSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNG
        ++ GWD+   G  Y    GG +    F++ GSGS Y YG  D  ++ +++ EEA +L  +A+  A  RDGASGGV     +   G
Subjt:  MIAGWDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSV-GSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTAAAGCCAGCAAAAGGAACAACCACACTGGCTTTCATTTTTAAGGAAGGAGTCATGGTTGCTGCTGATTCACGTGCCAGCATGGGAGGCTACATATCATCGCAATC
TGTGAAGAAAATTATTGAAATTAATCCTTACATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGTGCTGCTGATTGTCAGTTTTGGCATAGAAATCTCGGTGTCAAGTGCCGCCGACATG
AACTAGCAAACAAGCGTCGGATTTCAGTTGCCGGAGCATCAAAATTACTGGCCAATATTCTGTACTCCTATCGTGGAATGGGTCTCTCTGTTGGGACTATGATTGCTGGA
TGGGATGAAACAGGTCCTGGTCTATATTACGTAGACAGTGAGGGAGGAAGGCTCAAGGGAACAAGATTTTCTGTTGGATCTGGTTCACCTTATGCCTACGGTGTCTTGGA
TAATGGGTATCGGTACGACTTGTCTGTAGAAGAAGCTGCTGAACTGGCTAGACGAGCGATTTATCATGCAACTTTCCGAGATGGAGCCAGTGGCGGAGTTGCTAGCGTTT
ATTACGTGGGACCAAATGGTTGGAAAAAGCTATCTGGCGATGATGTAGGGGAACTTCATTACAACTACTATCCCGTGACGCCAACTACAGTGGATCAGGAAATGGCTGAA
GTAACCGCCGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAGAAACTGGCCTTCGATTTCCCTGTAAACGTCCTCATTTTTCCCTCCATTCCGATCATTTCCTTCGAGGCAGTGTATCTCCGTTTGGTTGTAGTTCCTGTTTTTTGTT
CTCATATTTCCCTAGATTCTAGCTCAAGAAGTTGAAACATGAAGCTCGATACCAGTGGTCTTCAAACAACAGCTCCGCTGTTTGGGCCAAAAATGGAGTTCATGGAAGGG
TTTGCAGCTGCTCCATCCTTTGAGATCCCTAATTCCAGTGACGTAATTTGTAAATCATTTCTCATACGGCTTTCTGGGCTGCATATTGTTCTGTAGAATTGCTTTTTCTG
ATTTTGATATTCTCCGTGTTTCAGTTTGATGGCTTTCAGAAAGATGCCATTCAAATGGTAAAGCCAGCAAAAGGAACAACCACACTGGCTTTCATTTTTAAGGAAGGAGT
CATGGTTGCTGCTGATTCACGTGCCAGCATGGGAGGCTACATATCATCGCAATCTGTGAAGAAAATTATTGAAATTAATCCTTACATGCTTGGTACAATGGCTGGAGGTG
CTGCTGATTGTCAGTTTTGGCATAGAAATCTCGGTGTCAAGTGCCGCCGACATGAACTAGCAAACAAGCGTCGGATTTCAGTTGCCGGAGCATCAAAATTACTGGCCAAT
ATTCTGTACTCCTATCGTGGAATGGGTCTCTCTGTTGGGACTATGATTGCTGGATGGGATGAAACAGGTCCTGGTCTATATTACGTAGACAGTGAGGGAGGAAGGCTCAA
GGGAACAAGATTTTCTGTTGGATCTGGTTCACCTTATGCCTACGGTGTCTTGGATAATGGGTATCGGTACGACTTGTCTGTAGAAGAAGCTGCTGAACTGGCTAGACGAG
CGATTTATCATGCAACTTTCCGAGATGGAGCCAGTGGCGGAGTTGCTAGCGTTTATTACGTGGGACCAAATGGTTGGAAAAAGCTATCTGGCGATGATGTAGGGGAACTT
CATTACAACTACTATCCCGTGACGCCAACTACAGTGGATCAGGAAATGGCTGAAGTAACCGCCGCTTGACGATCCCATATAGACAGACAGACATGAACAGGTTGAGACAT
TCTCTCTCCCTATTCATTTGTGCTTCTTCTGGGGGGAACTGATTCTAAAGAGATTGCTTTAGATGTGGAGTGTTTTTAAAGTATTATGGGATCCTTAATATGTTTGATTG
GATCATTCTGTCCTGTTAGTCGAGTTATAATAGCTGCATGGAGAAGAACATTGTTTGTGTTTCCTAAATTTTAGATCCCTTGCTTCATTGGACTACCTTGCTTATCATGC
TTGTTCTTTCCAGTTTAGTGAGCCACGTATCTTCTTTTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVKPAKGTTTLAFIFKEGVMVAADSRASMGGYISSQSVKKIIEINPYMLGTMAGGAADCQFWHRNLGVKCRRHELANKRRISVAGASKLLANILYSYRGMGLSVGTMIAG
WDETGPGLYYVDSEGGRLKGTRFSVGSGSPYAYGVLDNGYRYDLSVEEAAELARRAIYHATFRDGASGGVASVYYVGPNGWKKLSGDDVGELHYNYYPVTPTTVDQEMAE
VTAA