; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09328 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09328
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor HY5-like
Genome locationCarg_Chr05:1798746..1799664
RNA-Seq ExpressionCarg09328
SyntenyCarg09328
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain
IPR044280 - Transcriptional activator Hac1/HY5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598576.1 Transcription factor HY5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-61100Show/hide
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KAG7029514.1 Transcription factor HY5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.8e-61100Show/hide
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XP_022962152.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita moschata]9.1e-6199.31Show/hide
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XP_022996780.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita maxima]9.1e-6198.62Show/hide
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XP_023545723.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-6098.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPK1 BZIP domain-containing protein8.3e-6096.55Show/hide
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A0A5A7VGC0 Transcription factor HY58.3e-6096.55Show/hide
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A0A6J1HBY4 transcription factor HY5-like4.4e-6199.31Show/hide
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A0A6J1K7Q9 transcription factor HY5-like4.4e-6198.62Show/hide
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F1DQG1 BZIP28.3e-6096.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O24646 Transcription factor HY57.5e-5082.76Show/hide
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Q54WN7 Probable basic-leucine zipper transcription factor F9.6e-0544.26Show/hide
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Q8TFU8 Transcriptional activator hacA7.3e-0543.48Show/hide
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        RKR +T  +KE +R++R+LRNR +AQ +RERK+  +  LE    D+E++N  L +RL+ ++ EN  L Q
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Q8W191 Transcription factor HY5-like1.4e-1647.06Show/hide
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         Y++DLE R  +L+  N +LEE++STL NEN MLR+
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Q9SM50 Transcription factor HY58.5e-4680.69Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G17609.1 HY5-homolog1.9e-1664.79Show/hide
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AT3G17609.2 HY5-homolog1.0e-1747.06Show/hide
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AT3G17609.3 HY5-homolog1.9e-1664.79Show/hide
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AT3G17609.4 HY5-homolog1.9e-1664.79Show/hide
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AT5G11260.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein5.3e-5182.76Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGGAGCAAGCGACGAGTTCCGCCGCCGCTAGCTCTTTACCTTCGAGCAGTGAAAGATCGTCCAGCTCTGCTCTTCACCTCGAAGTGAAAGAAGGAATAGAGAGTGA
TGAAGAGATCCGGAGAGTGCCGGAGATAGGCGGCGAATCCGCCGGAACATCGGCGTCCGGCAGGGAGACCGGTTCGTTGGCCGGTCCGGACCGGGTTCAGGTTTCTCGGG
AGAGTCAAAGGAAGAGAGGGAGAACTCCGGCTGACAAAGAAAGCAAGAGATTGAAGAGATTGCTGAGAAATAGAGTATCAGCACAGCAAGCGAGGGAGAGGAAAAAGGCG
TATTTGAATGACTTAGAGATAAGGGTGAAGGATTTGGAGAAGAAGAACTCTGAACTTGAAGAAAGGCTTTCCACTTTACAGAATGAGAATCAGATGCTTAGACAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAGGAGCAAGCGACGAGTTCCGCCGCCGCTAGCTCTTTACCTTCGAGCAGTGAAAGATCGTCCAGCTCTGCTCTTCACCTCGAAGTGAAAGAAGGAATAGAGAGTGA
TGAAGAGATCCGGAGAGTGCCGGAGATAGGCGGCGAATCCGCCGGAACATCGGCGTCCGGCAGGGAGACCGGTTCGTTGGCCGGTCCGGACCGGGTTCAGGTTTCTCGGG
AGAGTCAAAGGAAGAGAGGGAGAACTCCGGCTGACAAAGAAAGCAAGAGATTGAAGAGATTGCTGAGAAATAGAGTATCAGCACAGCAAGCGAGGGAGAGGAAAAAGGCG
TATTTGAATGACTTAGAGATAAGGGTGAAGGATTTGGAGAAGAAGAACTCTGAACTTGAAGAAAGGCTTTCCACTTTACAGAATGAGAATCAGATGCTTAGACAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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