; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09525 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09525
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRibosomal protein L37
Genome locationCarg_Chr17:6647512..6649665
RNA-Seq ExpressionCarg09525
SyntenyCarg09525
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001569 - Ribosomal protein L37e
IPR011331 - Ribosomal protein L37ae/L37e
IPR011332 - Zinc-binding ribosomal protein
IPR018267 - Ribosomal protein L37e, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022150495.1 60S ribosomal protein L37-3 [Momordica charantia]1.7e-4497.89Show/hide
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XP_022953178.1 60S ribosomal protein L37-3-like [Cucurbita moschata]2.0e-45100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GMN9 Ribosomal protein L379.9e-46100Show/hide
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A0A6J1HHN6 Ribosomal protein L372.2e-4598.95Show/hide
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A0A6J1JVQ3 Ribosomal protein L379.9e-46100Show/hide
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A0A6J1KAY5 Ribosomal protein L378.4e-4597.89Show/hide
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A0A6J1KMJ9 Ribosomal protein L376.4e-4597.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q43292 60S ribosomal protein L37-21.7e-4288.42Show/hide
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Q8LEM8 60S ribosomal protein L37-37.6e-4388.42Show/hide
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Q8LFH7 60S ribosomal protein L37-11.9e-4185.26Show/hide
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Q90YT1 60S ribosomal protein L377.3e-3068.42Show/hide
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Q9VXX8 Probable 60S ribosomal protein L37-A3.6e-2968.97Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15250.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein1.3e-4285.26Show/hide
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AT1G52300.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein1.2e-4388.42Show/hide
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AT3G16080.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein5.4e-4488.42Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCAAGAGCGGCTTCAGAGAGGGTACTGAAGCTGCACCCAGAAATAAAGGATCTGCAGCATCAGCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TGCTTTTCCTGCTGCTCGCAAGCGCAAGTATAACTGGAGTGTGAAGGCTATTAGGAGAAAGACTACTGGAACTGGAAGGATGAGGTACATGCGCCATGTTCCGCGTAGAT
TCAAGAGCGGCTTCAGAGAGGGTACTGAAGCTGCACCCAGAAATAAAGGATCTGCAGCATCAGCGTAAGGTATTGGAAGAAGTTCGACTTAATTTCAGCACCCAATTATA
GTTTTCAGTAGGGTTTTTCCGCATCTGAGGATTATTTCACATAATTTTGTTACCTAGTTTTGCTTTTTTTCATGATTTAGTTGAACGCAGTTTCTTTGAAATGTATTGTT
TTGAATTATGGACAAATGACGAATCAAATTGTTCGTACTCTGCTACGTGTTTATGCTTTTTCCAGCTGTTCATATTTCCCCCTTCCTTCCAAGGGTGCATGTCTAGGAAG
AAGCCATGTCAAAACACTAGATTCAACTTGTTAATTTGGAAGTTGGTTTTTATCTCACCCAAGAGTGATTTGTCTCGATTTCGGGCACCCCATCTAATCAAACATATGGT
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GACAGTTTTCCAATCGAACTTTCTTTTGATGTATTGAGGATTCATAGAGTATCTAGACTCCCTTAGGCTTGTTTTAAGGTAGTTTTAAACATAAGAACATTGGGTTTGAA
GTTATGTTAATGCAACTATAAGCATTAAGGTACTTTTGGAATTGCCAATTTTAGATATTTCGAGGTCAAACCTTGTATCCCGTACTTAATTTTACCAGTTTATGAAGCTT
GAAATTGTTTTCAAGATTACTGTATCACTGAAGAAGACATTTCAAGTGAAGGATTGCCTGTAGTCGTGGAGAAATGCTACAATTTTCCGAAAAGGGGGCAGCAGGCTCTG
AACTGCATAAACAAGAATGTAGTAAAGCAAAATCGAGATCGAGATGGTGCTGTTGCAGAGAGTAATACTTGTCGAAACTAGCATGACAAAACAATCTAAGTCATGTATGT
CGAGTTATAGCTGGCCAAACTTCTTTTTTTCATTCAGCTGTTTGATGATAGAATCAAGCTCTGGAAACAAGCTCCGTAAATATCGATGTTCGGCTTTCTCTTGCTGCAGT
TCAAGGGATCGTGTGGCAATTGTCCGAAGTCGAACCATTCTCTCAATGTTTTTCTTTTTCGGACATCTAAACTAAATCTCTATCTTCTAAATGTGTTTCTCTAAATGATA
TTTGAATGTGATTAAAACCCATCAAAGTTTTAGAGTTTACCACGACTAACATTATCATTTTCCGGTTGATTAAAATATTATATTTTATCTCCATTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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