; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09712 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09712
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr14:3379792..3380325
RNA-Seq ExpressionCarg09712
SyntenyCarg09712
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581048.1 LOB domain-containing protein 25, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.0e-95100Show/hide
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]8.1e-8893.22Show/hide
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XP_022935530.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita moschata]3.4e-9499.44Show/hide
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XP_022983524.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita maxima]2.9e-9398.87Show/hide
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A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein3.9e-8893.22Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like8.8e-8892.66Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like8.8e-8892.66Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like1.6e-9499.44Show/hide
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A0A6J1J7N2 LOB domain-containing protein 25-like1.4e-9398.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 62.5e-3962.81Show/hide
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 22.9e-4055.84Show/hide
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        L    + L +Y    I A +  S        ++   DG ++T+   HY+ + +F
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.1e-5082.88Show/hide
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 62.5e-3962.81Show/hide
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           L +Y      A + S+S+
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES9.4e-4758.47Show/hide
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        ELDA NA+L  Y  +   A            P P  S Q    +      G+S   +    G   S   F PW+N H+   G+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 257.7e-5282.88Show/hide
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Query:  DATNANLIRYA
        + TNA+L+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein6.7e-4858.47Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQR+DAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NA+L  Y  +   A            P P  S Q    +      G+S   +    G   S   F PW+N H+   G+
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein6.7e-4858.47Show/hide
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        ELDA NA+L  Y  +   A            P P  S Q    +      G+S   +    G   S   F PW+N H+   G+
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein6.7e-4858.47Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQR+DAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NA+L  Y  +   A            P P  S Q    +      G+S   +    G   S   F PW+N H+   G+
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein6.7e-4858.47Show/hide
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        ELDA NA+L  Y  +   A            P P  S Q    +      G+S   +    G   S   F PW+N H+   G+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTTCCACCTATTCCAACTCCCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTCCGCCGAAAATGCCTACCCGATTGCGTTTTCGCGCCCTATTTCCCACCGGAGGAGCCCCA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCGAGGCGAGGATGAAAGACCCCGTCTACGGCTGCGTTGGCGCCATCTCTATACTCCAAAGGCAAGTCATCAAGCTCCAAAAAGAGCTCGACGCTACCAACGCCAATCTC
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CGGCCACTACTATTCCAATCCCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAGCCATAATGGCTCTTGTGGAGATGGCCATGACAAACCAGAGTTCAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IRYACTEIPAPSPSSSSQYARRSSSTSHDGSSSTSSYGHYYSNPYFSPWSNSHNGSCGDGHDKPEFK