; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09747 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09747
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionZinc finger AN1 domain stress-associated protein
Genome locationCarg_Chr14:3108693..3109877
RNA-Seq ExpressionCarg09747
SyntenyCarg09747
Gene Ontology termsGO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000058 - Zinc finger, AN1-type
IPR035896 - AN1-like Zinc finger


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581002.1 Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-10598.36Show/hide
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KAG7017744.1 Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.6e-108100Show/hide
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XP_022983864.1 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X1 [Cucurbita maxima]1.1e-10397.27Show/hide
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XP_023526966.1 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-10598.36Show/hide
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XP_023526967.1 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.6e-10597.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3D0N1 Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 121.1e-9083.59Show/hide
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A0A6J1F5P4 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X21.2e-10397.81Show/hide
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A0A6J1FAS4 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X11.2e-10397.81Show/hide
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A0A6J1J3K1 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X25.3e-10497.27Show/hide
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A0A6J1J8Q5 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X15.3e-10497.27Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0D5B9 Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 164.0e-3244.6Show/hide
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          C    CRE LTFSNT  CK C  + CLKHRF  +H C
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Q67YE6 Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 126.3e-6260.22Show/hide
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        TC  +RC+EILTF+N   CK C +K CLKHRFP +H C +      GT  RWNE+FM AL LRN   CG+    + ++ SSPSV++
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Q6H595 Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 179.8e-4750.57Show/hide
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        A  GTEAFPDLG  C   DC+QLDFLPF CDGC K FC EHR ++ H C ++    R VVVCE C  +IE   G  GG ++ +LE H  S  CDP +K+K
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        P C   RC+E LTFSNT  CK C  KVCLKHRFPA+H C   G G  ++   AA   R+ G CG+  +     G
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Q8VZ42 Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 119.5e-3441.57Show/hide
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          C   RC+E LTFSNT  C+ C +  CLKHRF  +H C     G     FM  L         K  RP  A+ S+ S
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Q9SCM4 Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 137.3e-3446.04Show/hide
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        GT  FPDLG+HC    C Q+DFLPFTCD C +V+CL+HR +  HDCPK +R    VV+C +C+  +     +   +  I    H + DCDP    +  KK
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Query:  PTCSARRCREILTFSNTCVCKTCRLKVCLKHRFPAEHNC
          C   RCRE+LTFSNT  C+ C +  CLKHRF  +H+C
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41835.1 zinc finger (C2H2 type, AN1-like) family protein6.7e-3541.57Show/hide
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        GT  FPDLG+HC    C Q+DFLPFTCD C +VFCL+HR +  H CPK DR    VV+C +C+  +     +   +  I    H + DCDP    +  KK
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Query:  PTCSARRCREILTFSNTCVCKTCRLKVCLKHRFPAEHNCGRVGTGRWNEKFMAALELRNGGDCGKRGRPTAANGSSPS
          C   RC+E LTFSNT  C+ C +  CLKHRF  +H C     G     FM  L         K  RP  A+ S+ S
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AT3G28210.1 zinc finger (AN1-like) family protein4.5e-6360.22Show/hide
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        A GGTEAFPDLG HCQ  DC  LDFLPFTCDGC+ VFCLEHR +KSH+CPKSD  SR V +CE CS++IETTG D      +LE+H  SGDCDP KKKKP
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        TC  +RC+EILTF+N   CK C +K CLKHRFP +H C +      GT  RWNE+FM AL LRN   CG+    + ++ SSPSV++
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AT3G57480.1 zinc finger (C2H2 type, AN1-like) family protein5.2e-3546.04Show/hide
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        GT  FPDLG+HC    C Q+DFLPFTCD C +V+CL+HR +  HDCPK +R    VV+C +C+  +     +   +  I    H + DCDP    +  KK
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          C   RCRE+LTFSNT  C+ C +  CLKHRF  +H+C
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AT5G48205.1 zinc ion binding6.8e-1134.55Show/hide
Query:  GTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSMSIETTGKDGGHESRILERHHESGDCDPR------KK
        GT  FPDLG+HC    C Q+DFLPFTCD C +V CL+H  +  +  P  D N                            ++H    DCDP       KK
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Query:  KKPTCSARRC
        KK  C    C
Subjt:  KKPTCSARRC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCCGCTGGAGGAACAGAGGCTTTCCCTGATCTTGGCCGCCACTGCCAGCACTCCGATTGCCACCAACTCGATTTCCTTCCGTTCACCTGCGACGGTTGCCAAAA
GGTGTTCTGTTTGGAGCATCGCGGTTTCAAATCCCACGACTGCCCGAAATCTGATCGGAACAGTAGAAAAGTTGTGGTCTGTGAAATCTGCTCCATGTCGATCGAGACCA
CCGGGAAGGACGGCGGCCACGAGAGCAGGATTTTGGAGAGGCATCACGAATCAGGAGATTGCGATCCAAGGAAGAAGAAAAAGCCCACTTGTTCAGCGAGGCGGTGCCGG
GAAATTCTTACGTTTTCCAATACTTGTGTGTGTAAAACCTGCCGTTTGAAGGTGTGTTTGAAGCACCGGTTTCCGGCGGAGCATAATTGTGGACGGGTGGGTACAGGGCG
GTGGAATGAGAAGTTTATGGCGGCTTTGGAATTGAGGAACGGTGGCGATTGTGGGAAAAGGGGACGTCCGACGGCGGCTAATGGGTCTTCCCCATCTGTTAAAGCTTGTT
GA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTAGCAGCATTGCAAATCTTCTTCTAGGTTGATGAATTGTGAGAATGCAAATTAAATAATATTCATTTTTTTTTTTTTTTGAAAGCCCCTTCACCCAATCGGAGAAAGCT
ACGCGTTTACACCGCGTAGGATTCGGAAGAAGGAATCTCCGCCGCCGTTCATCCAGAGGTTTCTAATTTTCTTCTAAAATAGTTTCCAATTCCTTAACTTTCTTCTCAAG
TCAACTCGAATCCTATAAATAGCCCAAATTTCATCATAATCTTCTCCTCCTCTAACATCTAACAAACCAAATTTGCAACCACAATTTCATCTCTATTTCTAATCCTTTTT
TTCAGTTCCAAATCAGAAGACCTTCCGACGAAGAAACCACCATGGCCGCCGCTGGAGGAACAGAGGCTTTCCCTGATCTTGGCCGCCACTGCCAGCACTCCGATTGCCAC
CAACTCGATTTCCTTCCGTTCACCTGCGACGGTTGCCAAAAGGTGTTCTGTTTGGAGCATCGCGGTTTCAAATCCCACGACTGCCCGAAATCTGATCGGAACAGTAGAAA
AGTTGTGGTCTGTGAAATCTGCTCCATGTCGATCGAGACCACCGGGAAGGACGGCGGCCACGAGAGCAGGATTTTGGAGAGGCATCACGAATCAGGAGATTGCGATCCAA
GGAAGAAGAAAAAGCCCACTTGTTCAGCGAGGCGGTGCCGGGAAATTCTTACGTTTTCCAATACTTGTGTGTGTAAAACCTGCCGTTTGAAGGTGTGTTTGAAGCACCGG
TTTCCGGCGGAGCATAATTGTGGACGGGTGGGTACAGGGCGGTGGAATGAGAAGTTTATGGCGGCTTTGGAATTGAGGAACGGTGGCGATTGTGGGAAAAGGGGACGTCC
GACGGCGGCTAATGGGTCTTCCCCATCTGTTAAAGCTTGTTGATTGCTTTCTAGAGGGAAATTAATTTATGAACCATTAGATTTTGGTCGCTGTTCCTCCATTCTGTTCT
TATAAAGAATGGTCATAAATTTCAACCCCTCTTTCTAAATGTACTTGTCTTAACAAAATAAAATAAAAATAAATAATATTAAAGCTGACCTTACT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAAGGTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSMSIETTGKDGGHESRILERHHESGDCDPRKKKKPTCSARRCR
EILTFSNTCVCKTCRLKVCLKHRFPAEHNCGRVGTGRWNEKFMAALELRNGGDCGKRGRPTAANGSSPSVKAC