; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09777 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09777
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionCysteine dioxygenase
Genome locationCarg_Chr14:2980367..2982602
RNA-Seq ExpressionCarg09777
SyntenyCarg09777
Gene Ontology termsGO:0018171 - peptidyl-cysteine oxidation (biological process)
GO:0070483 - detection of hypoxia (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0005506 - iron ion binding (molecular function)
GO:0017172 - cysteine dioxygenase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011051 - RmlC-like cupin domain superfamily
IPR012864 - Cysteine oxygenase/2-aminoethanethiol dioxygenase
IPR014710 - RmlC-like jelly roll fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580975.1 Plant cysteine oxidase 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-15097.74Show/hide
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KAG7017714.1 Plant cysteine oxidase 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.4e-168100Show/hide
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XP_023526199.1 plant cysteine oxidase 2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.7e-16598.96Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LC53 Cysteine dioxygenase6.1e-13984.08Show/hide
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A0A1S3B7Z3 Cysteine dioxygenase8.8e-13884.08Show/hide
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A0A5D3DPQ3 Cysteine dioxygenase8.8e-13884.08Show/hide
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A0A6J1F4M7 Cysteine dioxygenase1.2e-16699.31Show/hide
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A0A6J1J8W0 Cysteine dioxygenase4.6e-16397.22Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1G3U6 Plant cysteine oxidase 32.4e-5242.97Show/hide
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        R ++ SP  VQ+LY+ C E F   G    P    I+++  VLD + P DVGL       +  Y  +        GR   PIT+L ++E + F+M IFC P
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         S VIPLH+HP M VFSK+L+G++H+KAYDWV+   +    T+D    G  P+   RLAK+  D   T   +   LYP  GGN+HCFTA+T CAVLD+L 
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        PPY +  GR CSYY+D+PF+ F++E G+  V E   + YAWL + + P DL      Y GP I
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Q8LGJ5 Plant cysteine oxidase 25.6e-8960.46Show/hide
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        +N  +K +RR++K+   PVQKL++TC +VFA G  G VP  E+IE +R VLD+++P DVG++P+M YFR+T   R+P +TYLH+Y  ++FS+ IFCLPPS
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        GVIPLHNHP MTVFSKLLFGTMHIK+YDWV                   PS   RLAKVKVD+DFTAPCD+SILYPADGGNMHCFTA TACAVLDV+GPP
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        YSD  GRHC+YY D+PF+ FSV +GV V E ++E YAWL+ERE+ P+DL     +Y GP I E
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Q9LXG9 Plant cysteine oxidase 11.5e-8154.91Show/hide
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        K    N K     RR +  SP      V++L+ TC EVF++GG G++P  + I+++R++LD M+P DVGL+P MPYFR  +G   R +PPITYLHL++ +
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Query:  KFSMGIFCLPPSGVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAV
        +FS+GIFCLPPSGVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIK+YDWV    +  + T              RLAK+KVD+ FTAPC++SILYP DGGNMH FTA+
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Query:  TACAVLDVLGPPYSDRDGRHCSYYLDHPFTKFSVE-EGVSVPEADRERYAWLEER-EQPKD-LAAVGAVYKGPKI
        TACAVLDVLGPPY + +GRHC+Y+L+ P  K S E + V   E ++E YAWL+ER + P+D    VGA+Y+GPK+
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Q9LXT4 Plant cysteine oxidase 57.4e-4940.39Show/hide
Query:  PLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFED-IERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAG---------RRTPPITYLHLYESNKFSMGIFCLPPSGVIPL
        P  +Q+L+ TC    +  G    P  E+ +++VR+VL+K++P DVGL  E    R   G            P I YL L+E + FS+GIFC+PP  +IPL
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        HNHPGMTV SKL++G+MH+K+YDW    A    S  D+  + R        AK+  D D T+P  ++ LYP  GGN+HCF A+T CA+ D+L PPYS   
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        GRHC+Y+   P      E  V   E       WLEE + P +       Y+GP I
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Q9SJI9 Plant cysteine oxidase 47.9e-5142.25Show/hide
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        P   Q+LY TC   F+S G    P  ED +E+VR+VL+K++P DVG+  +    R+ +G         +  P I YLHL+E + FS+GIFC+PPS +IPL
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        HNHPGMTV SKL++G+MH+K+YDW++            ++    PS++ R AK+  D + TA    + LYP  GGN+HCF A+T CA+LD+L PPYS   
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Query:  GRHCSYYLDHPFTKFSVEEGVSVPEADRE---RYAWLEEREQPKDLAAVGAVYKGPKI
         RHC+Y     F K   E+     E D E      WLEE + P D       Y+GP I
Subjt:  GRHCSYYLDHPFTKFSVEEGVSVPEADRE---RYAWLEEREQPKDLAAVGAVYKGPKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18490.1 Protein of unknown function (DUF1637)1.7e-5342.97Show/hide
Query:  RTRKSSPLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFEDIERVRDVLDKMEPVDVGL-----SPEMPYFRT------TAGRRTPPITYLHLYESNKFSMGIFCLP
        R ++ SP  VQ+LY+ C E F   G    P    I+++  VLD + P DVGL       +  Y  +        GR   PIT+L ++E + F+M IFC P
Subjt:  RTRKSSPLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFEDIERVRDVLDKMEPVDVGL-----SPEMPYFRT------TAGRRTPPITYLHLYESNKFSMGIFCLP

Query:  PSGVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAVTACAVLDVLG
         S VIPLH+HP M VFSK+L+G++H+KAYDWV+   +    T+D    G  P+   RLAK+  D   T   +   LYP  GGN+HCFTA+T CAVLD+L 
Subjt:  PSGVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAVTACAVLDVLG

Query:  PPYSDRDGRHCSYYLDHPFTKFSVEEGV-SVPEADRERYAWLEEREQPKDLAAVGAVYKGPKI
        PPY +  GR CSYY+D+PF+ F++E G+  V E   + YAWL + + P DL      Y GP I
Subjt:  PPYSDRDGRHCSYYLDHPFTKFSVEEGV-SVPEADRERYAWLEEREQPKDLAAVGAVYKGPKI

AT2G42670.1 Protein of unknown function (DUF1637)5.6e-5242.25Show/hide
Query:  PLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFED-IERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAG---------RRTPPITYLHLYESNKFSMGIFCLPPSGVIPL
        P   Q+LY TC   F+S G    P  ED +E+VR+VL+K++P DVG+  +    R+ +G         +  P I YLHL+E + FS+GIFC+PPS +IPL
Subjt:  PLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFED-IERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAG---------RRTPPITYLHLYESNKFSMGIFCLPPSGVIPL

Query:  HNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAVTACAVLDVLGPPYSDRD
        HNHPGMTV SKL++G+MH+K+YDW++            ++    PS++ R AK+  D + TA    + LYP  GGN+HCF A+T CA+LD+L PPYS   
Subjt:  HNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAVTACAVLDVLGPPYSDRD

Query:  GRHCSYYLDHPFTKFSVEEGVSVPEADRE---RYAWLEEREQPKDLAAVGAVYKGPKI
         RHC+Y     F K   E+     E D E      WLEE + P D       Y+GP I
Subjt:  GRHCSYYLDHPFTKFSVEEGVSVPEADRE---RYAWLEEREQPKDLAAVGAVYKGPKI

AT2G42670.2 Protein of unknown function (DUF1637)3.9e-5342.25Show/hide
Query:  PLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFED-IERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAG---------RRTPPITYLHLYESNKFSMGIFCLPPSGVIPL
        P   Q+LY TC   F+S G    P  ED +E+VR+VL+K++P DVG+  +    R+ +G         +  P I YLHL+E + FS+GIFC+PPS +IPL
Subjt:  PLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFED-IERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAG---------RRTPPITYLHLYESNKFSMGIFCLPPSGVIPL

Query:  HNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAVTACAVLDVLGPPYSDRD
        HNHPGMTV SKL++G+MH+K+YDW++            ++    PS+  R AK+  D + TA    + LYP  GGN+HCF A+T CA+LD+L PPYS   
Subjt:  HNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAVTACAVLDVLGPPYSDRD

Query:  GRHCSYYLDHPFTKFSVEEGVSVPEADRE---RYAWLEEREQPKDLAAVGAVYKGPKI
         RHC+Y     F K   E+     E D E      WLEE + P D       Y+GP I
Subjt:  GRHCSYYLDHPFTKFSVEEGVSVPEADRE---RYAWLEEREQPKDLAAVGAVYKGPKI

AT5G15120.1 Protein of unknown function (DUF1637)1.0e-8254.91Show/hide
Query:  KETTTNNKSRKNRRRTRKSSP----LPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFEDIERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAG---RRTPPITYLHLYESN
        K    N K     RR +  SP      V++L+ TC EVF++GG G++P  + I+++R++LD M+P DVGL+P MPYFR  +G   R +PPITYLHL++ +
Subjt:  KETTTNNKSRKNRRRTRKSSP----LPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFEDIERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAG---RRTPPITYLHLYESN

Query:  KFSMGIFCLPPSGVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAV
        +FS+GIFCLPPSGVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIK+YDWV    +  + T              RLAK+KVD+ FTAPC++SILYP DGGNMH FTA+
Subjt:  KFSMGIFCLPPSGVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAV

Query:  TACAVLDVLGPPYSDRDGRHCSYYLDHPFTKFSVE-EGVSVPEADRERYAWLEER-EQPKD-LAAVGAVYKGPKI
        TACAVLDVLGPPY + +GRHC+Y+L+ P  K S E + V   E ++E YAWL+ER + P+D    VGA+Y+GPK+
Subjt:  TACAVLDVLGPPYSDRDGRHCSYYLDHPFTKFSVE-EGVSVPEADRERYAWLEER-EQPKD-LAAVGAVYKGPKI

AT5G39890.1 Protein of unknown function (DUF1637)4.0e-9060.46Show/hide
Query:  NNKSRKNRRRTRKSSPLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFEDIERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAGRRTPPITYLHLYESNKFSMGIFCLPPS
        +N  +K +RR++K+   PVQKL++TC +VFA G  G VP  E+IE +R VLD+++P DVG++P+M YFR+T   R+P +TYLH+Y  ++FS+ IFCLPPS
Subjt:  NNKSRKNRRRTRKSSPLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFEDIERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAGRRTPPITYLHLYESNKFSMGIFCLPPS

Query:  GVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAVTACAVLDVLGPP
        GVIPLHNHP MTVFSKLLFGTMHIK+YDWV                   PS   RLAKVKVD+DFTAPCD+SILYPADGGNMHCFTA TACAVLDV+GPP
Subjt:  GVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAVTACAVLDVLGPP

Query:  YSDRDGRHCSYYLDHPFTKFSVEEGVSVPEADRERYAWLEEREQ-PKDLAAVGAVYKGPKIVE
        YSD  GRHC+YY D+PF+ FSV +GV V E ++E YAWL+ERE+ P+DL     +Y GP I E
Subjt:  YSDRDGRHCSYYLDHPFTKFSVEEGVSVPEADRERYAWLEEREQ-PKDLAAVGAVYKGPKIVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGATTGAGCGATATCTGGCTGATCGGAAGGGGAAACAGTTTTGTGAATTACCTAAAGAAACAACTACGAATAACAAGTCGAGAAAGAACCGGCGGCGGACTAGGAA
GTCCTCGCCGTTGCCGGTTCAGAAACTCTATGAAACTTGTAATGAAGTTTTTGCTTCTGGTGGGATTGGAATCGTTCCCCCTTTTGAGGATATTGAACGGGTACGAGATG
TTCTGGATAAAATGGAGCCAGTAGATGTTGGGTTGTCGCCGGAGATGCCGTATTTTCGGACGACAGCCGGTCGACGAACTCCTCCTATAACATATTTGCACCTCTATGAG
AGCAACAAATTCTCTATGGGAATATTTTGCTTGCCTCCTTCAGGTGTCATTCCACTTCACAACCATCCTGGAATGACAGTCTTTAGCAAGCTTCTCTTTGGCACTATGCA
CATTAAGGCATACGACTGGGTAGATGGCGGCGCTGTCAATGGCACGTCTACACGTGACAACGTCTCGCGGGGCAGAGCTCCTTCAAGAAGTATTCGGTTAGCGAAAGTCA
AGGTAGACGCAGACTTCACGGCCCCATGCGACTCGTCGATTCTTTACCCTGCAGATGGAGGAAACATGCATTGCTTCACAGCTGTGACAGCGTGTGCAGTGTTAGATGTG
CTCGGCCCACCGTACTCCGATCGAGACGGTCGACATTGCTCATACTACCTTGACCATCCCTTCACAAAATTTTCAGTGGAGGAGGGGGTTTCGGTCCCAGAAGCAGATAG
GGAAAGGTACGCATGGCTTGAAGAAAGAGAGCAACCTAAAGACTTGGCTGCCGTTGGTGCAGTGTACAAAGGGCCAAAGATAGTAGAGATTCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTTCTCCATACGGAGATGACCATTTTTACACCTTCTCTCAATCGCTACTAATCTGTACCCTCTTCCCCTGTTTCTTGGCCTTTTCGCTTTTCGATTCTATCCAGATC
CCCGTTTTTCCCTATCCTTTTCGCTTATTTTCGGGCACCCTTTTCCCTAATTTCACTAATTTTTCACTTCCCCCCTCCAATTTCAACCAATTTTTGGTGGGTTAATGGGG
ATTGAGCGATATCTGGCTGATCGGAAGGGGAAACAGTTTTGTGAATTACCTAAAGAAACAACTACGAATAACAAGTCGAGAAAGAACCGGCGGCGGACTAGGAAGTCCTC
GCCGTTGCCGGTTCAGAAACTCTATGAAACTTGTAATGAAGTTTTTGCTTCTGGTGGGATTGGAATCGTTCCCCCTTTTGAGGATATTGAACGGGTACGAGATGTTCTGG
ATAAAATGGAGCCAGTAGATGTTGGGTTGTCGCCGGAGATGCCGTATTTTCGGACGACAGCCGGTCGACGAACTCCTCCTATAACATATTTGCACCTCTATGAGAGCAAC
AAATTCTCTATGGGAATATTTTGCTTGCCTCCTTCAGGTGTCATTCCACTTCACAACCATCCTGGAATGACAGTCTTTAGCAAGCTTCTCTTTGGCACTATGCACATTAA
GGCATACGACTGGGTAGATGGCGGCGCTGTCAATGGCACGTCTACACGTGACAACGTCTCGCGGGGCAGAGCTCCTTCAAGAAGTATTCGGTTAGCGAAAGTCAAGGTAG
ACGCAGACTTCACGGCCCCATGCGACTCGTCGATTCTTTACCCTGCAGATGGAGGAAACATGCATTGCTTCACAGCTGTGACAGCGTGTGCAGTGTTAGATGTGCTCGGC
CCACCGTACTCCGATCGAGACGGTCGACATTGCTCATACTACCTTGACCATCCCTTCACAAAATTTTCAGTGGAGGAGGGGGTTTCGGTCCCAGAAGCAGATAGGGAAAG
GTACGCATGGCTTGAAGAAAGAGAGCAACCTAAAGACTTGGCTGCCGTTGGTGCAGTGTACAAAGGGCCAAAGATAGTAGAGATTCGATGAACTCTCTGCAAATGAGATC
TTGTTCATTCCATACAGTGCTGTCATGGACTGCTACCATTTGTGTGCAGCCAGCAGTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGIERYLADRKGKQFCELPKETTTNNKSRKNRRRTRKSSPLPVQKLYETCNEVFASGGIGIVPPFEDIERVRDVLDKMEPVDVGLSPEMPYFRTTAGRRTPPITYLHLYE
SNKFSMGIFCLPPSGVIPLHNHPGMTVFSKLLFGTMHIKAYDWVDGGAVNGTSTRDNVSRGRAPSRSIRLAKVKVDADFTAPCDSSILYPADGGNMHCFTAVTACAVLDV
LGPPYSDRDGRHCSYYLDHPFTKFSVEEGVSVPEADRERYAWLEEREQPKDLAAVGAVYKGPKIVEIR