; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09835 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09835
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein SPEAR1-like
Genome locationCarg_Chr10:2974383..2975350
RNA-Seq ExpressionCarg09835
SyntenyCarg09835
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR040356 - SPEAR family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589932.1 Protein SPEAR1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-7995.18Show/hide
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KAG7023601.1 Protein SPEAR1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.8e-99100Show/hide
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XP_022961334.1 protein SPEAR3-like [Cucurbita moschata]2.1e-8691.53Show/hide
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XP_022987884.1 protein SPEAR1-like [Cucurbita maxima]3.3e-8791.58Show/hide
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XP_023516352.1 protein SPEAR3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.8e-9294.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7VAB9 Protein SPEAR1-like9.4e-6472.77Show/hide
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        II
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A0A6J1EZZ7 protein SPEAR1-like5.7e-6976.88Show/hide
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A0A6J1HDR1 protein SPEAR3-like1.0e-8691.53Show/hide
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A0A6J1JK32 protein SPEAR1-like1.6e-8791.58Show/hide
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A0A6J1L4V3 protein SPEAR1-like5.3e-6775.25Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6IDB0 Protein SPEAR33.5e-2345.32Show/hide
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                    YGF  N+MM     + E   +R GDSQ      W+PS  G+LE+QHF  PN T H L + Q   +  S  Q    N E  E  ELDLE
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Q84X40 Protein SPEAR15.9e-2341.45Show/hide
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        MGS ++G P++        SS +SSSSS ++RRGKK GS+K P+QPQRGLGVAQLEKIRLHGE++  +F+  + +   + ++     YS + + SS  YG
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        F  N+MMG            D     T  W+PS  G+LE+QH   PN+T H   +DP    +   R + +G   +   + E QE+DLELRLS+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20080.1 unknown protein4.2e-2441.45Show/hide
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        MGS ++G P++        SS +SSSSS ++RRGKK GS+K P+QPQRGLGVAQLEKIRLHGE++  +F+  + +   + ++     YS + + SS  YG
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        F  N+MMG            D     T  W+PS  G+LE+QH   PN+T H   +DP    +   R + +G   +   + E QE+DLELRLS+
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AT2G20080.2 unknown protein3.2e-1638.34Show/hide
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        MGS ++G P++        SS +SSSSS ++RRGKK GS+K P+QPQRGLGVAQLEKIRLHGE++  +F                + Y+P   S  P  G
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                            D     T  W+PS  G+LE+QH   PN+T H   +DP    +   R + +G   +   + E QE+DLELRLS+
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AT4G28840.1 unknown protein2.5e-2445.32Show/hide
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        MGS ++G P +G       SSS +SSSSS ++RGK K GSDK P+QPQRGLGVAQLEKIRLHGE    +F+   SY  +   E   +    P   SSSPS
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Query:  LRL
        LRL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAGTGGTTATTATGGGGAGCCGAGTTTGGGGAACGAACGAGGGACTGGATTGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCGTCGAGACGAGGGAAGAAGGG
TGGCTCTGATAAGCAGCCAAGGCAGCCCCAGAGAGGACTTGGAGTTGCTCAGCTTGAGAAGATCAGATTGCATGGCGAAATTGCTTCCGCTGCTTTTCATCCCACTTCTT
ACACTTTCAATAACGAACACGAGCTAACGAACGTCCATAGATATTCACCGGTGTCTACTTCTTCCTCGCCGTCTTATGGCTTCCCCTCGAATGTTATGATGGGGTTTGGA
GAATGTGAAGGAAGGAGGGTGAGAGATGGTGATTCTCAGCATAGCACAACAGCAAGATGGGATCCAAGTAATGGTGGCGTCTTAGAAGCCCAACATTTTGCACACCCAAA
CATGACATCTCATCTTCAAGACCCACAAGCAGAGTGGGCAGCACAGAGCAGAAGGCAAGAAATGGGTGAAAATTGTGAAGCATGTGAGACCCAAGAACTGGACTTGGAAC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSGYYGEPSLGNERGTGLSSSSSSSSSSSSRRGKKGGSDKQPRQPQRGLGVAQLEKIRLHGEIASAAFHPTSYTFNNEHELTNVHRYSPVSTSSSPSYGFPSNVMMGFG
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