; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg09958 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg09958
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationCarg_Chr10:2335665..2336294
RNA-Seq ExpressionCarg09958
SyntenyCarg09958
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7023479.1 hypothetical protein SDJN02_14504, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-100100Show/hide
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XP_022960906.1 uncharacterized protein LOC111461568 [Cucurbita moschata]3.0e-9798.09Show/hide
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XP_022987874.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Cucurbita maxima]3.1e-9497.13Show/hide
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XP_023516526.1 putative protein TPRXL [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-9697.61Show/hide
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XP_038879100.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]1.2e-8288.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C124 uncharacterized protein DDB_G0271670-like1.9e-8187.08Show/hide
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A0A6J1F5M8 uncharacterized protein LOC1114410575.5e-8186.6Show/hide
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A0A6J1H8W9 uncharacterized protein LOC1114615681.4e-9798.09Show/hide
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A0A6J1HNK6 uncharacterized protein LOC1114659176.1e-8086.12Show/hide
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A0A6J1JI11 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like1.5e-9497.13Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein5.7e-0643.75Show/hide
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        H +     G   + ++ S  K  CLCSPTTHPGSFRC +H+ +  Q T
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related3.8e-4255.76Show/hide
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         + PRPSRLSIM+KAD+
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related2.7e-1136.57Show/hide
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        A+  SS S   P S  +R  +    H +  S S    ++   L +  SP      SV+T    +Q        KR CLCSPTTHPGSFRCS H+ +  + 
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related7.9e-4053.92Show/hide
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        I+V +    N    +  + +R C+CSPTTHPGSFRCSLHK V +   Q T  Y++N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ VRRAL +LIRPSSH  +RR+ 
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        + PR SRL+ MSKA+DL
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related7.9e-4053.92Show/hide
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        I+V +    N    +  + +R C+CSPTTHPGSFRCSLHK V +   Q T  Y++N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ VRRAL +LIRPSSH  +RR+ 
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        + PR SRL+ MSKA+DL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGTTTCTTCTAGAAAATCGAGCGGGCCTGTTATGAGGTCTCTCTCACCTTCTGGGAGATTCTGTCGCTCCTATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCTTCCTCATCGGCGTTTGCGTCCTCCACATCAAGCTTTTCCACTGAAAACCCTACTTCGTTTTTCCGTAGATCTCTGTCTCCGTCTCGTGTTCATCTACAAGGTTCTT
CTTCTTCTACGTCGGCGTCGTCCGTTAGATTTGCACTGGACCGGTCTATTTCTCCGAATCGGCATATCTCTGTTTTGACTCGTGGCGGTGGAAATCAAGTAGTGAAGAGG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QSNQKRTCLCSPTTHPGSFRCSLHKGVPSQPTTPYSSNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVRRALASLIRPSSHSQRRRADFCPRPSRLSIMSKADDL