; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg10624 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg10624
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionSASA domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr01:12249780..12251007
RNA-Seq ExpressionCarg10624
SyntenyCarg10624
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608446.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.7e-16598.65Show/hide
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KAG7037782.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-167100Show/hide
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XP_022941448.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]6.4e-16296.96Show/hide
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XP_022982273.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]1.5e-15894.59Show/hide
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XP_023525343.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-15995.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4Z7 SASA domain-containing protein1.8e-12579.86Show/hide
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        +P TSQQP PPT IFLLAGQSNMAGRGGVTNSTLTH PTWD VVPPQCSP P ILRLA+DLTWVEAREPLHADIDFLKTNGIGPGMPFANTILMDKP GR
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        TVIGLVPCAMGGTSI++WQKGS+LY HLL+RA+AS+LSGG IKALLWYQGESDT NAEDSELYGGRLKKFFT IRSDL IP LPIIQVGIASGEG YKEG
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        VRRGQ GI+++NVM VD  ALGL  EPDGLHL T SQV+LGG+LADAYRRFP HPL A+PL +AA  + + + F      + F
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A0A1S3BVE3 probable carbohydrate esterase At4g342158.8e-12578.47Show/hide
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         GRTVIGLVPCA+GGTSI++WQKGS+LY HLL+RAEASIL GG IKALLWYQGESDT NAEDSELYGGRLKKF TDIRSDL IP LPIIQVGIASGEG Y
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        KEGVRRGQ GI+++NVM VD  ALGL  EPDGLHL TPSQV+LGG+LA AYRRFP HPL A+PL +AA  +++ S F +S++   TF+
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A0A5A7VA07 Putative carbohydrate esterase8.8e-12578.47Show/hide
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A0A6J1FS50 probable carbohydrate esterase At4g342153.1e-16296.96Show/hide
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A0A6J1J4F1 probable carbohydrate esterase At4g342157.1e-15994.59Show/hide
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        YKEGVRRGQ GIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGG+LADAYRRFPPHPLAASPL +AASTASV+SF ISMFRTMTFV LHQILLS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342155.4e-7153.66Show/hide
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        P  Q P PP  IF+L+GQSNMAGRGGV      +R  WD+++PP+C+PN SILRL++DL W EA EPLH DID  K  G+GPGM FAN +         V
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        IGLVPCA GGT+I++W++GS LY  ++ R E S   GG IKA+LWYQGESD ++  D+E YG  + +   ++R DLN+P LPIIQV IASG G Y + VR
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Query:  RGQLGIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGILADAY
          QLG+++ NV+ VD  A GL  + D LHL T +QV+LG  LA AY
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)9.7e-7656.61Show/hide
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        +IF+LAGQSNMAGRGGV N T T+   WD V+PP+C  NPSILRL S L W EA+EPLH DID  KTNG+GPGMPFAN ++     G+  +GLVPC++GG
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Query:  TSIQQWQKGSDLYTHLLTRAEASILS--GGTIKALLWYQGESDTVNAEDSELYGGRLKKFFTDIRSDLNIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVRRGQLGIEV
        T + QWQKG  LY   + RA+A++ S  GG+ +A+LWYQGESDTV+  D+ +Y  RL KFF+D+R+DL  P LPIIQV +A+G GPY + VR+ QL  ++
Subjt:  TSIQQWQKGSDLYTHLLTRAEASILS--GGTIKALLWYQGESDTVNAEDSELYGGRLKKFFTDIRSDLNIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVRRGQLGIEV

Query:  MNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGILADAYRRFP
         NV  VD  A GL  EPDGLHL T SQV+LG ++A+++   P
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)3.8e-7253.66Show/hide
Query:  PTSQQPPPPTAIFLLAGQSNMAGRGGVTNSTLTHRPTWDRVVPPQCSPNPSILRLASDLTWVEAREPLHADIDFLKTNGIGPGMPFANTILMDKPAGRTV
        P  Q P PP  IF+L+GQSNMAGRGGV      +R  WD+++PP+C+PN SILRL++DL W EA EPLH DID  K  G+GPGM FAN +         V
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Query:  IGLVPCAMGGTSIQQWQKGSDLYTHLLTRAEASILSGGTIKALLWYQGESDTVNAEDSELYGGRLKKFFTDIRSDLNIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVR
        IGLVPCA GGT+I++W++GS LY  ++ R E S   GG IKA+LWYQGESD ++  D+E YG  + +   ++R DLN+P LPIIQV IASG G Y + VR
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Query:  RGQLGIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGILADAY
          QLG+++ NV+ VD  A GL  + D LHL T +QV+LG  LA AY
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)3.8e-7253.66Show/hide
Query:  PTSQQPPPPTAIFLLAGQSNMAGRGGVTNSTLTHRPTWDRVVPPQCSPNPSILRLASDLTWVEAREPLHADIDFLKTNGIGPGMPFANTILMDKPAGRTV
        P  Q P PP  IF+L+GQSNMAGRGGV      +R  WD+++PP+C+PN SILRL++DL W EA EPLH DID  K  G+GPGM FAN +         V
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Query:  IGLVPCAMGGTSIQQWQKGSDLYTHLLTRAEASILSGGTIKALLWYQGESDTVNAEDSELYGGRLKKFFTDIRSDLNIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVR
        IGLVPCA GGT+I++W++GS LY  ++ R E S   GG IKA+LWYQGESD ++  D+E YG  + +   ++R DLN+P LPIIQV IASG G Y + VR
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Query:  RGQLGIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGILADAY
          QLG+++ NV+ VD  A GL  + D LHL T +QV+LG  LA AY
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGTTCACCTTCCCCCCACTTCTCAACAACCACCTCCACCGACAGCCATTTTCCTCCTCGCCGGACAAAGCAACATGGCGGGGCGCGGCGGCGTCACCAACAGCAC
CCTAACGCACCGTCCCACGTGGGACCGCGTTGTTCCTCCCCAGTGCTCCCCCAATCCTTCTATCCTCCGCCTCGCCTCCGATCTCACCTGGGTTGAAGCTCGCGAGCCAC
TCCACGCCGACATTGATTTCCTCAAGACCAACGGGATTGGGCCTGGAATGCCATTCGCCAACACCATTCTCATGGATAAACCCGCCGGTCGGACGGTGATCGGTCTTGTC
CCGTGCGCGATGGGCGGGACTTCGATTCAACAGTGGCAAAAGGGGTCCGATCTGTACACCCATTTATTGACCCGAGCCGAAGCGTCGATACTCAGCGGAGGCACGATTAA
AGCGCTTCTGTGGTATCAGGGTGAAAGTGATACAGTGAATGCAGAAGATTCCGAGTTGTATGGTGGGAGATTGAAGAAGTTCTTCACTGACATTCGCTCCGATCTAAACA
TCCCATTCCTCCCAATTATTCAGGTGGGGATTGCATCAGGAGAGGGGCCGTATAAGGAAGGAGTGAGAAGAGGGCAATTAGGAATTGAGGTAATGAACGTGATGACTGTG
GACGCATACGCATTGGGCTTGTCGTTTGAACCAGATGGGCTTCACTTAAATACCCCTTCTCAAGTTAAACTGGGTGGAATCTTGGCTGATGCATACCGCCGGTTTCCACC
GCACCCACTGGCTGCTAGCCCATTAATAAGCGCTGCTTCCACGGCATCAGTTTTCAGTTTCTTTATTTCCATGTTTAGGACTATGACCTTCGTGTTGCTTCACCAAATTC
TTTTGTCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGTTCACCTTCCCCCCACTTCTCAACAACCACCTCCACCGACAGCCATTTTCCTCCTCGCCGGACAAAGCAACATGGCGGGGCGCGGCGGCGTCACCAACAGCAC
CCTAACGCACCGTCCCACGTGGGACCGCGTTGTTCCTCCCCAGTGCTCCCCCAATCCTTCTATCCTCCGCCTCGCCTCCGATCTCACCTGGGTTGAAGCTCGCGAGCCAC
TCCACGCCGACATTGATTTCCTCAAGACCAACGGGATTGGGCCTGGAATGCCATTCGCCAACACCATTCTCATGGATAAACCCGCCGGTCGGACGGTGATCGGTCTTGTC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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