; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg10721 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg10721
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionHybrid signal transduction histidine kinase M-like protein
Genome locationCarg_Chr01:11778996..11780736
RNA-Seq ExpressionCarg10721
SyntenyCarg10721
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAG7037686.1 hypothetical protein SDJN02_01316, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.5e-147100Show/hide
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XP_022982399.1 uncharacterized protein LOC111481236 [Cucurbita maxima]4.0e-13298.1Show/hide
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XP_023524341.1 uncharacterized protein LOC111788264 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-13298.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7VFR8 Vitellogenin-24.3e-10885.02Show/hide
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A0A6J1FCW4 uncharacterized protein LOC1114429641.3e-11589.43Show/hide
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A0A6J1FT55 uncharacterized protein LOC1114466291.2e-13499.62Show/hide
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A0A6J1IQH5 uncharacterized protein LOC1114772635.9e-11388.3Show/hide
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A0A6J1J4F7 uncharacterized protein LOC1114812361.9e-13298.1Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G24550.1 unknown protein5.1e-0836.8Show/hide
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        ++K+RR ++A N +  + RS    N
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AT3G43850.1 unknown protein1.8e-2141.29Show/hide
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        ++   C S+S+SS SIG NSD        ++ G  +E++SS+ GPLDMM+SLEE LP+++ ISKFY GKSKS+ SL++ S   +K++ KPEN YS++RRN
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        L+++ +            + GGISK+P  S        +AMS  E + S   + S
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AT5G21940.1 unknown protein7.5e-3647.88Show/hide
Query:  FEKEAEESNTCSSASSS-SSSIGRNSDQSARSSD--GEESGESDEVQSSFKGPLDMMDSLEEVLPVRKGISKFYNGKSKSYTSL------ADASVSSMKE
        F      S++ SS SSS SSSIGRNSD   +SS+  G+++GE +EV+S +KGPL+MM+SLE+VLPVRKGISK+Y+GKSKS+T+L      A  S SSMK+
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Query:  IAKPENAYSKKRRNLMAYNLVWEKNRSFPLKNNGGGISKRPI-SSSRSSLALAVAMS--------SSESNCSEDSNSSSYSGSPP-----------PLPP
        +AKPEN YS++RRNL+ +  +WE N++ P     GGISK+ + SSSRS+L LA+A++        SS    S   +S + SGSPP            LPP
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Query:  LHPQSRASNCNLASMVPPQRNFSTWRSYSLADLQEC
        L+P+S+ S  NL S       F  WRS+S+AD   C
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AT5G24890.1 unknown protein1.5e-0736.3Show/hide
Query:  DHGVEGFEKEAEESNTCSSASSSSSSIGRNSDQSARSSDGEESGESDEVQSSFKG--PLDMMDSLEEVLPVRKGISKFYNGKSKSYTSLADASVSSMKEI
        + GVE        S   +  SS SSSIG   D  +   + E   E+D+V S   G   L  M SLE+ LP ++G+S  Y GKSKS+ +L +  + S+KE+
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Query:  AKPENAYSKKRRNLMAYNLV------WEKNRSFPL
        AK EN  +K+RR  +   L       W+  +S PL
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AT5G56550.1 oxidative stress 35.8e-0434.51Show/hide
Query:  EESNTCSSASSSSSSIGRNSDQSARSSDGEESGESDEV-QSSFKGPLDMMDSLEEVLPVRKGISKFYNGKSKSYTSLADASVSSMKEIAK---PENAYSK
        E S T S    +SSS    S  S+  SD  E  + D+V  SS  GPL+ +  L   LP+++G+SKFY GKS+S+TSL   +V S++++ K       Y  
Subjt:  EESNTCSSASSSSSSIGRNSDQSARSSDGEESGESDEV-QSSFKGPLDMMDSLEEVLPVRKGISKFYNGKSKSYTSLADASVSSMKEIAK---PENAYSK

Query:  KRRNLMAYNLVWEKN--RSFPLKNNGGGISKRPISSSRSSLA
        KR++  +   + +++  R F  K     ISK+P  +  S L+
Subjt:  KRRNLMAYNLVWEKN--RSFPLKNNGGGISKRPISSSRSSLA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAGGGTTCAGCGGGTTGAGGATAAAGGCTCTGGATTCTCGCCGGAGGATTTGGGTTATGGATCGGTGTTTGAGAGGTTGGATACTGGGGATGTGGATCACGGTGTTGAAG
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ATCTTGTGTGGGAGAAGAACCGGAGTTTCCCCCTCAAGAATAACGGTGGTGGGATATCAAAAAGACCCATCAGCTCAAGCAGAAGCTCCCTGGCTTTGGCTGTTGCTATG
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ACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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