; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg10891 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg10891
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionzinc finger CCCH domain-containing protein 39-like
Genome locationCarg_Chr05:11496747..11498004
RNA-Seq ExpressionCarg10891
SyntenyCarg10891
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000571 - Zinc finger, CCCH-type
IPR036855 - Zinc finger, CCCH-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599412.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-205100Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
        PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
Subjt:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP

Query:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
        SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
Subjt:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

KAG7030401.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.2e-205100Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
        PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
Subjt:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP

Query:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
        SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
Subjt:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

XP_022946029.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucurbita moschata]1.0e-20399.42Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
        PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQL IGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
Subjt:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP

Query:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
        SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSP+STSQLEG
Subjt:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

XP_022999273.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucurbita maxima]1.3e-19897.39Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFE QQPPFKRAR FEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
        PL+NGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQL IGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPS    SVP
Subjt:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP

Query:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
        SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSP+STSQLEG
Subjt:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

XP_023546561.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.6e-20298.55Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRAR FEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVED+RQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
        PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQL IGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLA SVP
Subjt:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP

Query:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
        SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSP+STSQLEG
Subjt:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKX6 Uncharacterized protein1.5e-17987.9Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMR SVIPPPLHSYG+NGDASGCWSQ+PRND FDPQSQFEVQQPP+KRARN EEN SSP+ Y NP  NSR QPPNAP+NKGI+NIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI+EDDQSV+NWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSD-SSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATS-
        PL+NG+D SSY EP +  S SV DALRANGN RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFG+KCHFAHGQSELQL+IGREGEVS  ALNVKPL+VAMEA SSL T+ 
Subjt:  PLINGSD-SSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATS-

Query:  VPSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
        VPSSALPEGQ K SLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSP+STS++EG
Subjt:  VPSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

A0A1S3C7N3 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like2.0e-18189.05Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMRGSVIPPPLHSYG+NGDASGCWSQ+PRND FDPQSQFEVQQPP+KRARN EEN SSP+ Y NP  NSR  PPNAP+NKGI+NIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI+EDDQSV+NWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSD-SSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSV
        PL+NGSD SSY EP +A S SV DALRANGN RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFG+KCHFAHGQSELQL+IGREGEVS  ALNVKPL+VAMEA SSL TSV
Subjt:  PLINGSD-SSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSV

Query:  -PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
         PSSALPEGQAK SLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSP+STS++EG
Subjt:  -PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

A0A5A7V7E5 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like2.0e-18189.05Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMRGSVIPPPLHSYG+NGDASGCWSQ+PRND FDPQSQFEVQQPP+KRARN EEN SSP+ Y NP  NSR  PPNAP+NKGI+NIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI+EDDQSV+NWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSD-SSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSV
        PL+NGSD SSY EP +A S SV DALRANGN RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFG+KCHFAHGQSELQL+IGREGEVS  ALNVKPL+VAMEA SSL TSV
Subjt:  PLINGSD-SSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSV

Query:  -PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
         PSSALPEGQAK SLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSP+STS++EG
Subjt:  -PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

A0A6J1G2M8 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like5.0e-20499.42Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
        PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQL IGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
Subjt:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP

Query:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
        SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSP+STSQLEG
Subjt:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

A0A6J1KJ53 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like6.3e-19997.39Show/hide
Query:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
        MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFE QQPPFKRAR FEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK
Subjt:  MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFK

Query:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
        LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT
Subjt:  LGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGT

Query:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP
        PL+NGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQL IGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPS    SVP
Subjt:  PLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVP

Query:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG
        SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSP+STSQLEG
Subjt:  SSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLEG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5PP65 Zinc finger CCCH domain-containing protein 286.2e-2632.2Show/hide
Query:  INNIFFKTRMCAKFKLGLC-RNGASCNFAHGVEDMR---QPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFR
        I   FFKT++C KF+ G C  + +SC+FAH  E++R    PPPNWQE V                                                   
Subjt:  INNIFFKTRMCAKFKLGLC-RNGASCNFAHGVEDMR---QPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFR

Query:  DDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGR--EGEV---S
         ++ R RES A+S+G  G                    +V   L++        WKT++C KW+ TG+CPFG  CHFAHG SEL  F G   EGE    +
Subjt:  DDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGR--EGEV---S

Query:  NTALNVK-----PLVVAMEAP--SSLATSVPSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
        +  L+ K       V ++ +P  SS  TS   +  P G   Q   KWKGP KI+R+Y DW+DD+
Subjt:  NTALNVK-----PLVVAMEAP--SSLATSVPSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDL

Q7XPK1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 311.1e-1132.35Show/hide
Query:  KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRP-SFWKTKLCTKWEITGH
        K+K C KF++   CP+G+ C+F H  P  ++            ++  T    +N  + + P P +A     P    A GNS P S  KT++CTK+     
Subjt:  KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRP-SFWKTKLCTKWEITGH

Query:  CPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPL
        C FG+KCHFAHG+ EL    G+   +S+ +    P+
Subjt:  CPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPL

Q84UQ3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 563.7e-4735.08Show/hide
Query:  NAPMNKGINNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKI--------------------------IQKM
        N   ++ I  +FFKT++C KF+ G C    +CNFAHG+E++R+PPPNWQEIV   E+    +   ++ +I                            K 
Subjt:  NAPMNKGINNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKI--------------------------IQKM

Query:  KLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANG-NSRPSFWKTKLCTKWEITGHCP
        + C+KFY  E CPYGD C FLH       D+  + RES AIS+    +P + G          AA+++   A   NG   +PS WKT++C KWE+TG+CP
Subjt:  KLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANG-NSRPSFWKTKLCTKWEITGHCP

Query:  FGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSN----TALNVKPLVVAMEAPSSLATSVPSSALP--------------------EGQAKQSLLKWKGPKKINRIYA
        FG KCHFAHG +EL  + G   ++ +       + K  VV+ +AP+  A +  ++ LP                     GQ ++ + KWKGP KI+RIY 
Subjt:  FGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSN----TALNVKPLVVAMEAPSSLATSVPSSALP--------------------EGQAKQSLLKWKGPKKINRIYA

Query:  DWLDD
        DW+D+
Subjt:  DWLDD

Q9LQM3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 124.8e-4735.16Show/hide
Query:  PPPLHSYGANGDASGCWS---QYPRNDLFDP-QSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMN--KGINNIFFKTRMCAKFKLGLCR
        PPP + +   GD S  W+    Y R    +P  +  +   PP K+ R               PS+S     +A  N  K I  +FFKT++C KF+ G C 
Subjt:  PPPLHSYGANGDASGCWS---QYPRNDLFDP-QSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMN--KGINNIFFKTRMCAKFKLGLCR

Query:  NGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDD
           +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH       D+
Subjt:  NGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDD

Query:  SGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNS---------RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLF------
        + R RES AIS+G  G     G  S         SSS    L   G S         +PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  F      
Subjt:  SGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNS---------RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLF------

Query:  -IGREG-----EVSNTALNVKPLV---------VAMEAPSSLATSV----PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
          G++G     +   T  N K L          V   A +S  T V     SSA+ +    ++  KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  -IGREG-----EVSNTALNVKPLV---------VAMEAPSSLATSV----PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDL

Q9LT81 Zinc finger CCCH domain-containing protein 394.3e-8048.12Show/hide
Query:  NDLFDPQSQFEVQ---QPPFKRARNFEENQSSP-MPYPNPPSNSRVQPPN---APMNKGINNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNW
        + L + QSQ +     QP  KR R  ++N  +P   +P P S++    P+    P+NKG  NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NW
Subjt:  NDLFDPQSQFEVQ---QPPFKRARNFEENQSSP-MPYPNPPSNSRVQPPN---APMNKGINNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNW

Query:  QEIVG------------IREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGS
        QEIVG             RE ++          +NW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T     + +
Subjt:  QEIVG------------IREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGS

Query:  DSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGR-EGEVSN--TALNVKPLVVAMEA----PSSLATSV
         S+  E  +  S  VP  +   G  +  +WKT+LC K++ITG CPFG+KCHFAHGQ+EL   +GR EGE  N   ++N + +V A EA    P +  T+ 
Subjt:  DSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGR-EGEVSN--TALNVKPLVVAMEA----PSSLATSV

Query:  PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLE
         S    EG+ K+ LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein3.4e-4835.16Show/hide
Query:  PPPLHSYGANGDASGCWS---QYPRNDLFDP-QSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMN--KGINNIFFKTRMCAKFKLGLCR
        PPP + +   GD S  W+    Y R    +P  +  +   PP K+ R               PS+S     +A  N  K I  +FFKT++C KF+ G C 
Subjt:  PPPLHSYGANGDASGCWS---QYPRNDLFDP-QSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMN--KGINNIFFKTRMCAKFKLGLCR

Query:  NGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDD
           +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH       D+
Subjt:  NGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDD

Query:  SGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNS---------RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLF------
        + R RES AIS+G  G     G  S         SSS    L   G S         +PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  F      
Subjt:  SGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNS---------RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLF------

Query:  -IGREG-----EVSNTALNVKPLV---------VAMEAPSSLATSV----PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
          G++G     +   T  N K L          V   A +S  T V     SSA+ +    ++  KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  -IGREG-----EVSNTALNVKPLV---------VAMEAPSSLATSV----PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDL

AT1G68200.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein1.2e-0528.04Show/hide
Query:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
        KT +C K+ + G C  G  C FAHG++++R           IR                 K ++CR    G+ CPYG RC+F H    + +  +  F+  
Subjt:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES

Query:  SAISIGT
        S++ + T
Subjt:  SAISIGT

AT1G68200.2 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein1.2e-0528.04Show/hide
Query:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
        KT +C K+ + G C  G  C FAHG++++R           IR                 K ++CR    G+ CPYG RC+F H    + +  +  F+  
Subjt:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES

Query:  SAISIGT
        S++ + T
Subjt:  SAISIGT

AT2G35430.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein4.4e-2732.2Show/hide
Query:  INNIFFKTRMCAKFKLGLC-RNGASCNFAHGVEDMR---QPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFR
        I   FFKT++C KF+ G C  + +SC+FAH  E++R    PPPNWQE V                                                   
Subjt:  INNIFFKTRMCAKFKLGLC-RNGASCNFAHGVEDMR---QPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFR

Query:  DDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGR--EGEV---S
         ++ R RES A+S+G  G                    +V   L++        WKT++C KW+ TG+CPFG  CHFAHG SEL  F G   EGE    +
Subjt:  DDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGR--EGEV---S

Query:  NTALNVK-----PLVVAMEAP--SSLATSVPSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
        +  L+ K       V ++ +P  SS  TS   +  P G   Q   KWKGP KI+R+Y DW+DD+
Subjt:  NTALNVK-----PLVVAMEAP--SSLATSVPSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDL

AT3G19360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein3.1e-8148.12Show/hide
Query:  NDLFDPQSQFEVQ---QPPFKRARNFEENQSSP-MPYPNPPSNSRVQPPN---APMNKGINNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNW
        + L + QSQ +     QP  KR R  ++N  +P   +P P S++    P+    P+NKG  NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NW
Subjt:  NDLFDPQSQFEVQ---QPPFKRARNFEENQSSP-MPYPNPPSNSRVQPPN---APMNKGINNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNW

Query:  QEIVG------------IREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGS
        QEIVG             RE ++          +NW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T     + +
Subjt:  QEIVG------------IREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGS

Query:  DSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGR-EGEVSN--TALNVKPLVVAMEA----PSSLATSV
         S+  E  +  S  VP  +   G  +  +WKT+LC K++ITG CPFG+KCHFAHGQ+EL   +GR EGE  N   ++N + +V A EA    P +  T+ 
Subjt:  DSSYPEPIKAASSSVPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGR-EGEVSN--TALNVKPLVVAMEA----PSSLATSV

Query:  PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLE
         S    EG+ K+ LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  PSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPNSTSQLE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTTCAATGATATGCGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCATTGCATTCTTATGGTGCTAATGGCGATGCGTCTGGTTGCTGGTCTCAGTATCCTAGGAACGATCTATT
TGATCCACAATCACAATTTGAGGTACAGCAGCCTCCATTCAAAAGAGCTAGAAATTTCGAAGAAAATCAATCTAGTCCTATGCCTTATCCAAATCCACCATCGAATTCCA
GAGTTCAGCCTCCAAATGCTCCGATGAATAAAGGAATAAACAACATCTTCTTTAAGACAAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGGAATGGTGCTAGTTGC
AACTTTGCGCATGGTGTTGAAGACATGCGGCAACCCCCTCCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATACGGGAGGATGATCAATCTGTAAGCAACTGGAATGACGATCAGAA
AATTATCCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTCTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCTAAGTTTAGAGATGATT
CAGGGAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGCATTGGAACCACAGGAACTCCATTGATCAATGGAAGTGATTCTAGCTACCCTGAACCTATCAAGGCAGCTTCTAGCTCT
GTTCCTGATGCTCTTCGTGCTAATGGAAATTCTAGGCCTTCATTCTGGAAGACGAAGCTATGCACCAAATGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTCGGTGAAAAGTGCCA
TTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATTCATTGGACGTGAAGGGGAGGTATCTAATACTGCCCTCAATGTAAAGCCTCTCGTTGTGGCCATGGAAGCACCTTCAA
GTTTGGCGACGAGTGTTCCGTCCTCCGCCCTGCCGGAGGGCCAAGCGAAGCAGTCCTTGCTGAAATGGAAGGGACCCAAGAAGATAAATCGGATCTATGCGGATTGGCTC
GATGATTTGCCTCTGTCCCCAAACTCAACGAGCCAATTGGAGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTTTCAATGATATGCGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCATTGCATTCTTATGGTGCTAATGGCGATGCGTCTGGTTGCTGGTCTCAGTATCCTAGGAACGATCTATT
TGATCCACAATCACAATTTGAGGTACAGCAGCCTCCATTCAAAAGAGCTAGAAATTTCGAAGAAAATCAATCTAGTCCTATGCCTTATCCAAATCCACCATCGAATTCCA
GAGTTCAGCCTCCAAATGCTCCGATGAATAAAGGAATAAACAACATCTTCTTTAAGACAAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGGAATGGTGCTAGTTGC
AACTTTGCGCATGGTGTTGAAGACATGCGGCAACCCCCTCCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATACGGGAGGATGATCAATCTGTAAGCAACTGGAATGACGATCAGAA
AATTATCCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTCTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCTAAGTTTAGAGATGATT
CAGGGAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGCATTGGAACCACAGGAACTCCATTGATCAATGGAAGTGATTCTAGCTACCCTGAACCTATCAAGGCAGCTTCTAGCTCT
GTTCCTGATGCTCTTCGTGCTAATGGAAATTCTAGGCCTTCATTCTGGAAGACGAAGCTATGCACCAAATGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTCGGTGAAAAGTGCCA
TTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATTCATTGGACGTGAAGGGGAGGTATCTAATACTGCCCTCAATGTAAAGCCTCTCGTTGTGGCCATGGAAGCACCTTCAA
GTTTGGCGACGAGTGTTCCGTCCTCCGCCCTGCCGGAGGGCCAAGCGAAGCAGTCCTTGCTGAAATGGAAGGGACCCAAGAAGATAAATCGGATCTATGCGGATTGGCTC
GATGATTTGCCTCTGTCCCCAAACTCAACGAGCCAATTGGAGGGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFNDMRGSVIPPPLHSYGANGDASGCWSQYPRNDLFDPQSQFEVQQPPFKRARNFEENQSSPMPYPNPPSNSRVQPPNAPMNKGINNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASC
NFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLINGSDSSYPEPIKAASSS
VPDALRANGNSRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLFIGREGEVSNTALNVKPLVVAMEAPSSLATSVPSSALPEGQAKQSLLKWKGPKKINRIYADWL
DDLPLSPNSTSQLEG