; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11023 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11023
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionubiquitin-conjugating enzyme E2 E2-like
Genome locationCarg_Chr08:6039912..6041292
RNA-Seq ExpressionCarg11023
SyntenyCarg11023
Gene Ontology termsGO:0000209 - protein polyubiquitination (biological process)
GO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0061631 - ubiquitin conjugating enzyme activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593782.1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.9e-10567.75Show/hide
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        MVLSRLCCCFSTKFSSSTVYTRFHTPPPPP                                                                      
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        MGNPPPP
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KAG7026112.1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.1e-118100Show/hide
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        YAMGNPPPP
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XP_022964261.1 ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2-like [Cucurbita moschata]4.0e-10266.23Show/hide
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        MVLSRLCCCFSTK SSSTVYTRFHTPPPPP                                                                      
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        AMGNPPPP
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XP_023000037.1 ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3-like [Cucurbita maxima]5.4e-9964.5Show/hide
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        MVL RLCCCFSTK SSSTVYTR HTPPPPP                                                                      
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                                    PEASPPRAG NS+GDGGDGSGNEEKTS+MYRIENELRAMNE AATHCSFGPVGADI RWEG+VIGPAFSCYD
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        GGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDIL DNWSPALTIETLMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYA
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Query:  MGNPPPP
        MGNP PP
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XP_023513655.1 ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-9762.99Show/hide
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        MVLS LCCCFSTK SSSTVY R HTPPPPP                                                                      
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                                     PEASPPR G NSDGDGGDGSGNEEKTSAMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEG+VIGPAFSCY
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        DGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPN++EDGTILIDIL+DNWSPALTIETLMLSICSILSNPEPDE SINEASRM+L++WLNYTKIAREWTK+Y
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        AMGNPPPP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI75 UBC core domain-containing protein2.0e-5961.24Show/hide
Query:  MVLSRLCCCFSTKFSSSTVYTRFHTPPPPP----PEASPPRAGGNSDGDGGDGSGNEEKTSAMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGP
        M  SRL  CFS K S        +TP  PP     + S  R   +   D   G+  E+ + AMYRIENEL++MNE  ATHCSFGPVG DI RWEG+VIGP
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Query:  AFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIETLMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIARE
        A SCY+GGIFH+SIQFPS+YP +PP I FLTKIFHPNVE DG+I +DIL++NWS ALTIE L+LSICSILSNP P  GS NEAS MFLNNWL++   A++
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Query:  WTKKYAMGN
        WTK YAM N
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A0A1S3C6C4 ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1-like1.5e-6265.53Show/hide
Query:  MVLSRLCCCFSTKFSSSTVYTRFHTPPPPPPEASPPRAGGNSDGDGGD--GSGNEEKTS-AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPA
        M+ SRL  CF+ K SS   Y+    PPP P         GN D    D     NEEK+S AMYRIENEL+AMN+  ATHCSFGPVG DI RWEGIVIGPA
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Query:  FSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIETLMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREW
         SCY+GGIFH+SIQFPS+YP +PP I FLTKIFHPNVE DG+I IDIL +NWS ALTIE L+LSICS+LSNP P +GS NEAS MFLN+WLN+  IAR+W
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Query:  TKKYAM
        TK YAM
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A0A6J1CDR5 ubiquitin-conjugating enzyme E2 5A-like5.9e-6760.67Show/hide
Query:  MVLSRLCCCFSTKFSSSTVYTRFHTPPPP-----------PPEASPPR-----AGG-----NSDGDG---------------GDGSGNEEKTSAMYRIEN
        MVLSRL  CFS+K SSS+ Y+R  +PPPP           PP   PPR     AG       + GDG               G GSG+EEKTSAMYRIEN
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Query:  ELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIETLMLSICS
        EL+AMNE +ATHCSFGPVG DI RWEG+VIGPA SCY+ GIF LSI  PS+YP +PP IKF TKIFHPN+EEDGTI IDIL +NWSPALTIE L+LSICS
Subjt:  ELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIETLMLSICS

Query:  ILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAM
        ILSNPE  + SINEAS M+ N +  + ++AREWTK YAM
Subjt:  ILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAM

A0A6J1HIF1 ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2-like1.9e-10266.23Show/hide
Query:  MVLSRLCCCFSTKFSSSTVYTRFHTPPPPP----------------------------------------------------------------------
        MVLSRLCCCFSTK SSSTVYTRFHTPPPPP                                                                      
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Query:  -----------------------------PEASPPRAGGNSDGDGGDGSGNEEKTSAMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCY
                                     PEASPPRAGGNSDGDGGDGSGNEEKTSAMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILR EGIVIGPAFSCY
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Query:  DGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIETLMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKY
        DGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPN+EEDGTILIDIL+DNWSPALTIETLMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTK+Y
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Query:  AMGNPPPP
        AMGNPPPP
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A0A6J1KCF2 ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3-like2.6e-9964.5Show/hide
Query:  MVLSRLCCCFSTKFSSSTVYTRFHTPPPPP----------------------------------------------------------------------
        MVL RLCCCFSTK SSSTVYTR HTPPPPP                                                                      
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Query:  ----------------------------PEASPPRAGGNSDGDGGDGSGNEEKTSAMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYD
                                    PEASPPRAG NS+GDGGDGSGNEEKTS+MYRIENELRAMNE AATHCSFGPVGADI RWEG+VIGPAFSCYD
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        GGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDIL DNWSPALTIETLMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYA
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Query:  MGNPPPP
        MGNP PP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D3ZDK2 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D12.5e-3845.21Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A+ RI+ EL  +      HCS GPVG D+  W+  ++GP  S Y GG+F L++ FP++YP  PP I F TKI+HPN+  +G+I +DIL   WSPALT+  
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Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAM
        ++LSICS+L +P PD+  + + ++++ ++   Y + AREWT+KYAM
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P35129 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 23.2e-3845.89Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A+ RI+ EL+ +       CS GPVG D+  W+  ++GP  S Y GG+F L+I FP++YP  PP + F T+I+HPN+  +G+I +DIL   WSPALTI  
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Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAM
        ++LSICS+L +P PD+  + E +R++  +   Y ++AREWT+KYAM
Subjt:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAM

P51668 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D12.5e-3845.21Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A+ RI+ EL  +      HCS GPVG D+  W+  ++GP  S Y GG+F L++ FP++YP  PP I F TKI+HPN+  +G+I +DIL   WSPALT+  
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Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAM
        ++LSICS+L +P PD+  + + ++++ ++   Y + AREWT+KYAM
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P61080 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D12.5e-3845.21Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A+ RI+ EL  +      HCS GPVG D+  W+  ++GP  S Y GG+F L++ FP++YP  PP I F TKI+HPN+  +G+I +DIL   WSPALT+  
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Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAM
        ++LSICS+L +P PD+  + + ++++ ++   Y + AREWT+KYAM
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Q2TA10 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D12.5e-3845.21Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A+ RI+ EL  +      HCS GPVG D+  W+  ++GP  S Y GG+F L++ FP++YP  PP I F TKI+HPN+  +G+I +DIL   WSPALT+  
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Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAM
        ++LSICS+L +P PD+  + + ++++ ++   Y + AREWT+KYAM
Subjt:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G64230.1 ubiquitin-conjugating enzyme 281.1e-3846.26Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A  RI  EL+ + +   T CS GPV  D+  W+  ++GP+ S Y GG+F ++I FP +YP  PP + F TK+FHPNV  +G+I +DIL + WSPALTI  
Subjt:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET

Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAMG
        ++LSICS+L++P PD+  + E + M+  +   Y   AR WT+KYAMG
Subjt:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAMG

AT1G64230.2 ubiquitin-conjugating enzyme 281.1e-3846.26Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A  RI  EL+ + +   T CS GPV  D+  W+  ++GP+ S Y GG+F ++I FP +YP  PP + F TK+FHPNV  +G+I +DIL + WSPALTI  
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Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAMG
        ++LSICS+L++P PD+  + E + M+  +   Y   AR WT+KYAMG
Subjt:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAMG

AT5G41700.1 ubiquitin conjugating enzyme 88.8e-3946.26Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A  RI  EL+ + +   T CS GPV  D+  W+  ++GPA S Y GG+F ++I FP +YP  PP + F TK+FHPN+  +G+I +DIL + WSPALTI  
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Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAMG
        ++LSICS+L++P PD+  + E + M+  +   Y   AR WT+KYAMG
Subjt:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAMG

AT5G41700.2 ubiquitin conjugating enzyme 88.8e-3946.26Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A  RI  EL+ + +   T CS GPV  D+  W+  ++GPA S Y GG+F ++I FP +YP  PP + F TK+FHPN+  +G+I +DIL + WSPALTI  
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Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAMG
        ++LSICS+L++P PD+  + E + M+  +   Y   AR WT+KYAMG
Subjt:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAMG

AT5G41700.5 ubiquitin conjugating enzyme 88.8e-3946.26Show/hide
Query:  AMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRWEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPPLIKFLTKIFHPNVEEDGTILIDILSDNWSPALTIET
        A  RI  EL+ + +   T CS GPV  D+  W+  ++GPA S Y GG+F ++I FP +YP  PP + F TK+FHPN+  +G+I +DIL + WSPALTI  
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Query:  LMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKKYAMG
        ++LSICS+L++P PD+  + E + M+  +   Y   AR WT+KYAMG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAATTGGTCTCCAGCATTGACCATTGAAACACTAATGCTTTCCATATGCTCAATTCTATCAAACCCAGAGCCTGATGAAGGCTCCATTAATGAAGCTTCAAGAATGTTCC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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