; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11125 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11125
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein RALF-like 1
Genome locationCarg_Chr14:4780611..4780976
RNA-Seq ExpressionCarg11125
SyntenyCarg11125
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-5086.78Show/hide
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KAG6581259.1 Protein RALF-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.9e-60100Show/hide
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XP_022934551.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita moschata]7.8e-5896.69Show/hide
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XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]2.3e-5795.87Show/hide
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XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.6e-5795.04Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein2.5e-4984.55Show/hide
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A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 337.6e-5186.78Show/hide
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A0A5B6YRY9 Putative Ralf-like 331.4e-2864.55Show/hide
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A0A6J1F244 protein RALF-like 13.8e-5896.69Show/hide
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A0A6J1J798 protein RALF-like 11.1e-5795.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 335.0e-2347.15Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor9.4e-2249.58Show/hide
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        P+   + +   AFF+S      +A +GD  +  W+    +   C G S+ EC+    E E+DSE NRRILAT  YISY +L+ N++PCSRRG+SYYNC+P
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.8e-2044.53Show/hide
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        +  +S   A F++L   L   V + S+ V + S + +  +   E  C G +++EC                  M  E EMDSEINRRILAT  YISY +L
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        + N IPCSRRG+SYYNC+ GA+ANPY RGC+ ITRCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 223.9e-2061.33Show/hide
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        C G S++EC+    E+E DS+I+RRILA   YISY +++ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 15.3e-2553.51Show/hide
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        F  L   + F +SS  +     +    ++W +T      CHG S++EC+   E EMDSEINRRILAT+ YISY+SLK N++PCSRRG+SYYNCQ GA+AN
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 13.8e-2653.51Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 196.0e-1648.42Show/hide
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        +L VVA S   + +W  T+   +G+        ++  MDSE NRR LA   SYISY +L+ NN+PCSRRG SYY+C+    ANPY+RGC+VIT C
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AT3G05490.1 ralf-like 222.8e-2161.33Show/hide
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.3e-2144.53Show/hide
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AT4G15800.1 ralf-like 333.5e-2447.15Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCAACTCTTCTTCTCCACCTGCCTTCTTCTCTATGCTCATTTTCACCTTAGCCTTCTTTGTCTCTTCGTCCTCTTTAATGGTCGTGGCCATGAGTGGTGACCGTAG
TCTTAGCTGGCTCTCGACTGAACCTCGATGCCATGGACGTTCGTTAAGTGAATGCATGATGAATGTTGAGCTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGTATCTTAGCCA
CTTCAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAAGGCGAACAACATTCCATGCTCTCGACGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAGCCCGGGGCTGAAGCTAACCCCTATCAG
CGGGGTTGTACTGTCATTACTCGTTGCAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGCAACTCTTCTTCTCCACCTGCCTTCTTCTCTATGCTCATTTTCACCTTAGCCTTCTTTGTCTCTTCGTCCTCTTTAATGGTCGTGGCCATGAGTGGTGACCGTAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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