; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11237 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11237
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description60S ribosomal protein L6
Genome locationCarg_Chr14:5579356..5581027
RNA-Seq ExpressionCarg11237
SyntenyCarg11237
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0002181 - cytoplasmic translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000915 - 60S ribosomal protein L6E
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR014722 - Ribosomal protein L2, domain 2
IPR041997 - Ribosomal Protein L6, KOW domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7018096.1 60S ribosomal protein L6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-95100Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATST
        MAPKTARVSRNPDLIRGPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATST
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATST

Query:  KVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        KVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
Subjt:  KVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

XP_004149609.1 60S ribosomal protein L6-2 [Cucumis sativus]1.1e-8779.65Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRG                                          PKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

XP_022935449.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita moschata]1.6e-8981.82Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRG                                          PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

XP_022983464.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita maxima]1.7e-8881.39Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRG                                          PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        LKSIEAVS LKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

XP_023528566.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-8880.95Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPK AR SRNPDLIRG                                          PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9J7 60S ribosomal protein L65.5e-8879.65Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRG                                          PKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

A0A1S3CFY6 60S ribosomal protein L65.5e-8879.65Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRG                                          PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

A0A5D3CKB9 60S ribosomal protein L65.5e-8879.65Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRG                                          PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

A0A6J1F5G0 60S ribosomal protein L67.6e-9081.82Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRG                                          PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

A0A6J1J7G9 60S ribosomal protein L68.5e-8981.39Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRG                                          PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        LKSIEAVS LKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05739 60S ribosomal protein L6-B6.1e-4455.75Show/hide
Query:  RGPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDK
        + PK+YP++DV  P   ++  +P KLR+S+ PGTVLI+L GRF+GKRVV+LK L    LLVTGPFKVNGVPLRRVN  YVIATSTKV + GVNVEKF+ +
Subjt:  RGPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDK

Query:  YFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        YF+KE   KK+K E   F   +++   +  ++ +DQK VD ALL  I+    LK YL+A FSLK+G KPH L F
Subjt:  YFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

P34091 60S ribosomal protein L62.1e-7679.79Show/hide
Query:  PKTARVSRNPDLI-RGPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTK
        PK A  S +   + + PKFYPADDVKKPL+NKRK KPTKLR+SITPGTVLIIL GRFKGKRVVFLKQL SGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQ+YVIATSTK
Subjt:  PKTARVSRNPDLI-RGPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTK

Query:  VDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        VD++GVNVEKFDDKYF K+ +KK KKGEGEFFEAEK+E + LPQ+KKDDQKAVD ALLK+IE V +LK YL ARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  VDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

Q9C9C5 60S ribosomal protein L6-39.7e-7466.23Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +T +V+RNPDLIRG                                          PKFYPA+DVKKPL N+R AKPTKLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVD++GV ++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQKAVD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

Q9C9C6 60S ribosomal protein L6-25.7e-7466.23Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +TA+V+RNPDLIRG                                          PKFYPA+DVKKPL N+R AKP KLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVD++GV ++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQKAVD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

Q9FZ76 60S ribosomal protein L6-13.7e-7364.78Show/hide
Query:  APKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK
        A +T +V+RNPDLIRG                                           KFYPA+DVKKPLVN+RK KPTKL++SITPGTVLIIL GRFK
Subjt:  APKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALL
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTK+D++GVN EKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ+KK+DQK VD+AL+
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALL

Query:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        KSIEAV +LK YL ARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18540.1 Ribosomal protein L6 family protein2.6e-7464.78Show/hide
Query:  APKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK
        A +T +V+RNPDLIRG                                           KFYPA+DVKKPLVN+RK KPTKL++SITPGTVLIIL GRFK
Subjt:  APKTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALL
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTK+D++GVN EKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ+KK+DQK VD+AL+
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALL

Query:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        KSIEAV +LK YL ARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

AT1G74050.1 Ribosomal protein L6 family protein6.9e-7566.23Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +T +V+RNPDLIRG                                          PKFYPA+DVKKPL N+R AKPTKLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVD++GV ++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQKAVD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF

AT1G74060.1 Ribosomal protein L6 family protein4.0e-7566.23Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +TA+V+RNPDLIRG                                          PKFYPA+DVKKPL N+R AKP KLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRG------------------------------------------PKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVD++GV ++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQKAVD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCGAAGACAGCACGAGTTAGCAGAAACCCCGATCTCATTCGAGGGCCGAAATTTTACCCTGCTGACGATGTCAAGAAACCACTTGTCAACAAGCGCAAGGCTAA
GCCCACCAAACTTAGGTCTAGCATTACACCTGGAACCGTGCTTATCATTCTTACTGGAAGGTTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTCTTGAAGCAACTTCCATCTGGGTTGC
TCTTAGTCACTGGACCATTCAAGGTCAATGGTGTTCCATTGAGGCGTGTGAATCAGTCATACGTGATCGCGACCTCCACCAAGGTGGACCTTGCAGGAGTCAATGTGGAG
AAGTTTGATGACAAATATTTCTCCAAGGAAGTTCAGAAGAAGAAAAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTTTTCGAGGCAGAGAAGGAGGAAAAAAGCGCACTCCCACAGGACAA
AAAGGATGATCAGAAGGCCGTGGACTCAGCTCTGCTAAAGTCCATTGAGGCAGTTTCAGATTTAAAGACCTACTTAGCTGCAAGGTTTTCTCTAAAGTCTGGCATGAAAC
CGCATGAGCTTGTTTTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTCCGAAGACAGCACGAGTTAGCAGAAACCCCGATCTCATTCGAGGGCCGAAATTTTACCCTGCTGACGATGTCAAGAAACCACTTGTCAACAAGCGCAAGGCTAA
GCCCACCAAACTTAGGTCTAGCATTACACCTGGAACCGTGCTTATCATTCTTACTGGAAGGTTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTCTTGAAGCAACTTCCATCTGGGTTGC
TCTTAGTCACTGGACCATTCAAGGTCAATGGTGTTCCATTGAGGCGTGTGAATCAGTCATACGTGATCGCGACCTCCACCAAGGTGGACCTTGCAGGAGTCAATGTGGAG
AAGTTTGATGACAAATATTTCTCCAAGGAAGTTCAGAAGAAGAAAAAGAAGGGAGAAGGAGAGTTTTTCGAGGCAGAGAAGGAGGAAAAAAGCGCACTCCCACAGGACAA
AAAGGATGATCAGAAGGCCGTGGACTCAGCTCTGCTAAAGTCCATTGAGGCAGTTTCAGATTTAAAGACCTACTTAGCTGCAAGGTTTTCTCTAAAGTCTGGCATGAAAC
CGCATGAGCTTGTTTTCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPKTARVSRNPDLIRGPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDLAGVNVE
KFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKAVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKSGMKPHELVF