; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11382 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11382
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionVQ motif-containing protein 1-like
Genome locationCarg_Chr16:2573134..2573349
RNA-Seq ExpressionCarg11382
SyntenyCarg11382
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039608 - VQ motif-containing protein 1/10


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063001.1 VQ motif-containing protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa]8.5e-2081.08Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA----EENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        A +STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD V     E  R    ARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA----EENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID

KAG6577059.1 VQ motif-containing protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-29100Show/hide
Query:  MAAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        MAAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
Subjt:  MAAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID

KAG6600481.1 VQ motif-containing protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-1675.36Show/hide
Query:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSL-LRDSSFKEFQRVLREMPRI
        A+STRVVIIDTKYV TDAKSFKTVVQKLTGKDP AEENR   G  +S L + DSSFK+FQ  LREMP I
Subjt:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSL-LRDSSFKEFQRVLREMPRI

KGN53544.1 hypothetical protein Csa_014778 [Cucumis sativus]1.7e-2085.14Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD---PVAEENRHGDG-ARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        A +STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD    VAEE R   G ARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD---PVAEENRHGDG-ARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID

XP_038889427.1 VQ motif-containing protein 1-like [Benincasa hispida]2.2e-2390.14Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-EENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        AA+STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD VA EENRH  G RNS LLRDSSFKEFQRVLREMPRID
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-EENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXJ0 VQ domain-containing protein8.2e-2185.14Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD---PVAEENRHGDG-ARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        A +STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD    VAEE R   G ARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD---PVAEENRHGDG-ARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID

A0A0L9UJH2 VQ domain-containing protein1.6e-1161.97Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----PVAEENRHG-DGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        +VVII+T+YV+TDA SFK+VVQKLTGKD     P A+ NRH   G   S L+RD SFKEF R+LREMP I+
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----PVAEENRHG-DGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID

A0A5A7VBD1 VQ motif-containing protein 1-like4.1e-2081.08Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA----EENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        A +STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD V     E  R    ARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA----EENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID

A0A6J1CNV7 VQ motif-containing protein 10-like2.1e-1677.46Show/hide
Query:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDP--VAEENRH--GDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPR
        A STRVVIIDTKYV TDAKSFKTVVQKLTGKDP   AEE+R   G G+ +SSL RDSSFKEFQRVLREM +
Subjt:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDP--VAEENRH--GDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPR

A0A6J1FVF7 VQ motif-containing protein 13.6e-1673.91Show/hide
Query:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSL-LRDSSFKEFQRVLREMPRI
        A+STRVVIIDTKYV TDAKSFKTVVQKLTGKDP  EENR   G  +S L + DSSFK+FQ  LREMP I
Subjt:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSL-LRDSSFKEFQRVLREMPRI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1G3U8 VQ motif-containing protein 11.6e-0542.31Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-----EENRHGDGARNSS---------LLRDSSFKEFQRVLREMPRI
        +VV I+T+YVQTDA+SFKT+VQ+LTGK+ V      E +  G G ++SS           R     EF    REMP +
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-----EENRHGDGARNSS---------LLRDSSFKEFQRVLREMPRI

Q8VYI5 VQ motif-containing protein 101.8e-0435.56Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----------------------PVAEENR--HGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        +VV I+T+YV+TDA+SFKTVVQ+LTGK+                        + E+ R  HG G       R  +  EF R+ +EMP ++
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----------------------PVAEENR--HGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17147.1 VQ motif-containing protein1.1e-0642.31Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-----EENRHGDGARNSS---------LLRDSSFKEFQRVLREMPRI
        +VV I+T+YVQTDA+SFKT+VQ+LTGK+ V      E +  G G ++SS           R     EF    REMP +
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-----EENRHGDGARNSS---------LLRDSSFKEFQRVLREMPRI

AT1G78410.1 VQ motif-containing protein1.3e-0535.56Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----------------------PVAEENR--HGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        +VV I+T+YV+TDA+SFKTVVQ+LTGK+                        + E+ R  HG G       R  +  EF R+ +EMP ++
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----------------------PVAEENR--HGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCTTATTCGACTCGGGTTGTGATCATCGACACCAAGTATGTGCAAACGGATGCCAAGAGCTTCAAGACGGTGGTGCAGAAGCTGACGGGGAAGGACCCGGTGGC
GGAGGAGAATCGACATGGTGACGGTGCCCGGAACTCGAGTCTTTTGAGAGATTCGTCGTTCAAGGAGTTCCAAAGAGTGCTGCGAGAGATGCCAAGAATTGATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGCTTATTCGACTCGGGTTGTGATCATCGACACCAAGTATGTGCAAACGGATGCCAAGAGCTTCAAGACGGTGGTGCAGAAGCTGACGGGGAAGGACCCGGTGGC
GGAGGAGAATCGACATGGTGACGGTGCCCGGAACTCGAGTCTTTTGAGAGATTCGTCGTTCAAGGAGTTCCAAAGAGTGCTGCGAGAGATGCCAAGAATTGATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSLLRDSSFKEFQRVLREMPRID