; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11389 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11389
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationCarg_Chr16:2638051..2639421
RNA-Seq ExpressionCarg11389
SyntenyCarg11389
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577068.1 hypothetical protein SDJN03_24642, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.9e-24799.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BT64 uncharacterized serine-rich protein C215.132.3e-20485.56Show/hide
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A0A5A7V5R8 Putative serine-rich protein1.1e-20385.2Show/hide
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A0A5D3CZJ6 Putative serine-rich protein2.3e-20485.56Show/hide
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A0A6J1ETX7 homeobox protein prospero-like5.7e-248100Show/hide
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A0A6J1JAD5 uncharacterized serine-rich protein C215.135.5e-24398.03Show/hide
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        FSEANSKALKYFLHRNSKSSL SSFDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCEN PNKNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPRP
Subjt:  FSEANSKALKYFLHRNSKSSLASSFDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNKNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPRP

Query:  KSETNPRSTSTVDHHPTATRVGRSPMRRTPGDSSSSRLGGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNVP
        KSETNPRSTSTVDHHPTA RVGRSPMRRTPG+SSSSRLGGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNVP
Subjt:  KSETNPRSTSTVDHHPTATRVGRSPMRRTPGDSSSSRLGGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNVP

Query:  VCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSSSSSSTNRTTTRRINETDGGGKLH
        VCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSSSSSSTNRTTTRRINETDGGGK+H
Subjt:  VCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSSSSSSTNRTTTRRINETDGGGKLH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein1.6e-6946.14Show/hide
Query:  MASACVNSVGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRVSFSRDFSDDSSPSSNLARPISKPKPGADPARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVALMLPADELF
        MASACV S G+SPE F         SYGW SPR+S +R   DD+  SS++ +  S P P        EI+D      PV +FEFCL+DPV  ML ADELF
Subjt:  MASACVNSVGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRVSFSRDFSDDSSPSSNLARPISKPKPGADPARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVALMLPADELF

Query:  LDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPE-----TVVQARRRVEDECNTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTT
         DGKLVPL+ S  K +     +T   ++ E      V+++ RR+E E +    LFSPKAPRC++RWRELLGLK+L  +              E  ++   
Subjt:  LDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPE-----TVVQARRRVEDECNTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTT

Query:  SSSSYFSEANSKALKYFLHRNSKSSLASSFDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNKNPISLHRNPNHN-NPPR
        SSSS  +   + + K FLHR SKSS A+      S PL K+SD SES+S++SSR+SL SSSSS HE +DL RLSLD + KP+ NP +  R  + N N PR
Subjt:  SSSSYFSEANSKALKYFLHRNSKSSLASSFDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNKNPISLHRNPNHN-NPPR

Query:  MRLVKPRPKSETNPRSTSTVDHHPTATRVGRSPMRRTPGDSSSSRLGGIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPKFK-NRGMERSYSA
        +RL KPR     +P ST +VD                 G SSSS     RG++V  DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP +F GGP+ K + GM RSYSA
Subjt:  MRLVKPRPKSETNPRSTSTVDHHPTATRVGRSPMRRTPGDSSSSRLGGIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPKFK-NRGMERSYSA

Query:  NVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSSSSSSTNRT------TTRRINET
        NVR+TPVLNVPVCS   G         FG LF+ +   S  SSSS S  N++      +  RIN T
Subjt:  NVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSSSSSSTNRT------TTRRINET

AT1G79060.1 unknown protein2.9e-7148.68Show/hide
Query:  MASACVNSVGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRVSFSRDFSDDSSPSSNLARPISKPKPGADPARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVALMLPADELF
        MAS CVN+V +S +           +YG  +PR SFSRD  D    S ++A  I K                +   V   +FEF L++    MLPADELF
Subjt:  MASACVNSVGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRVSFSRDFSDDSSPSSNLARPISKPKPGADPARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVALMLPADELF

Query:  LDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPETVVQARRRVEDECNTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTTSSSSY
         DGKLV  Q       + G    +C    E V      +E     D   FSPKAPRCSSRWR+LLGLK+  Q+SS   S +          TTTT+  S 
Subjt:  LDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPETVVQARRRVEDECNTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTTSSSSY

Query:  FSEANSKALKYFLHRNSKSSLASSFDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNKNPISLHRNPNHN---NPPRMRL
            ++ +LK FLHR+S+SS +SS D+SL  SLPLLKDSDSESVS+SSSR+SLSSSSSGH+HEDL RLSLD E +PN+N I    N NHN   NP     
Subjt:  FSEANSKALKYFLHRNSKSSLASSFDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNKNPISLHRNPNHN---NPPRMRL

Query:  VKPRPKSETNPRSTSTVDHHPTAT---RVGRSPMRRTPGDSSSSRLGGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPK-FKNRGMERSYSANV
          P      NP     V+H  + T   RVGRSPMRR+ G++S+      RGVSVDSPR+NSSGKIVF NLERSSSSPS+FNGG   +++RGMERSYS+NV
Subjt:  VKPRPKSETNPRSTSTVDHHPTAT---RVGRSPMRRTPGDSSSSRLGGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPK-FKNRGMERSYSANV

Query:  RVTPVLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSSSSSSTNRTTTRRIN
        RVTPVLNVPVC S+RG S       FG  F      S  SSSSSS  NRT     N
Subjt:  RVTPVLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSSSSSSTNRTTTRRIN

AT3G05980.1 unknown protein9.0e-0429.36Show/hide
Query:  LSPRVSFSRDFSDDSSPSSNLARPISKPKPGAD-----PARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVA--LMLPADELFLDGKLVPL-QVSSVKPSVN-GL
        L PR+SFS D SD                 G D     P    E  D     V VS+FEF   + V+   ML ADELF +GKL+P  QV   +   N  L
Subjt:  LSPRVSFSRDFSDDSSPSSNLARPISKPKPGAD-----PARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVA--LMLPADELFLDGKLVPL-QVSSVKPSVN-GL

Query:  KSTRCVSSPETVVQARRRVEDECNTDPYLF-------SPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTTSSSSYFSEANSKALKYFL
        K+     + +  V+ +++ ++  N D  +        SP+ P+C+  W+ELL LKK    SS+  +    S+ +    +++TSSSS   +A  +  K   
Subjt:  KSTRCVSSPETVVQARRRVEDECNTDPYLF-------SPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTTSSSSYFSEANSKALKYFL

Query:  HRNSKSSLASSFDSSLSL
         +  K  L  +  +S+ +
Subjt:  HRNSKSSLASSFDSSLSL

AT3G12970.1 unknown protein1.1e-5441.24Show/hide
Query:  MASACVNSVGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRVSFSRDFSDDSSPSSNLARPISKPKPGADPARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVALMLPADELF
        MAS CV +VG SP            S+ W S ++S +R+           ++P++       PA ++E         PV +FEF L+DPV  ML ADELF
Subjt:  MASACVNSVGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRVSFSRDFSDDSSPSSNLARPISKPKPGADPARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVALMLPADELF

Query:  LDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPETVVQARRRVEDECN--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKL--YQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTTS
         DGKLVPL+ S V       +     S   T V+  RR+E E +   DPYLFSP+APRC+ RWRELLGLK+L   Q  ++ +S+S  S+ + N KT    
Subjt:  LDGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRCVSSPETVVQARRRVEDECN--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKL--YQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTTS

Query:  SSSYFSEANSKALKYFLHRNSKSSLASSFDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKP-NKNPISLHRNPNHNNPP
                   + ++FL+R+SKS+           P  KDSD   S S S+SSSR+SL SSSSSGHE +DL RLSLD +NKP   NP +  R  +H    
Subjt:  SSSYFSEANSKALKYFLHRNSKSSLASSFDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKP-NKNPISLHRNPNHNNPP

Query:  RMRLVKPRPKSETNPRSTSTVDHHPTATRVGRSPMRRTPGDSS--SSRLGGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPKFK-NRGMERSYS
                              HH       R P R T  D S  SS    +  V+ DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP  F GGP+ K + GM RS+S
Subjt:  RMRLVKPRPKSETNPRSTSTVDHHPTATRVGRSPMRRTPGDSS--SSRLGGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPKFK-NRGMERSYS

Query:  ANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSS-------SSSSTNRTTTRRINET
        ANVR+TPVLNVPV SSLR   KS     FG LF  +   S  SSS       S++  NRT   R+  T
Subjt:  ANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSS-------SSSSTNRTTTRRINET

AT5G19340.1 unknown protein1.4e-0428.36Show/hide
Query:  PRVSFSRDFSDDSSPSSNLA-RPISKPKPGADPARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVALMLPADELFLDGKLVP---------LQVSSVKP--SVNG
        PR+SFS D S   S    +   P+     G +   KS ++          +FEF  ++  A ML ADELF +GKL+P         L+  ++KP   V  
Subjt:  PRVSFSRDFSDDSSPSSNLA-RPISKPKPGADPARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVALMLPADELFLDGKLVP---------LQVSSVKP--SVNG

Query:  LKSTRCVSSPETVVQARRRVEDECNT-------------DPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTTSSSSYFSEANS
         +    V + E  V  + +  +  N              DP   SP+ P+C+  W+ELL LKK   +++   S    S    +  ++T+SSSS   +A  
Subjt:  LKSTRCVSSPETVVQARRRVEDECNT-------------DPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTTSSSSYFSEANS

Query:  K
        K
Subjt:  K


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCATGCGTTAACAGCGTCGGAATGTCGCCGGAGAATTTCCTTGACTGTTCTTCTGCTCCTTGCCATTCCTATGGCTGGCTCAGCCCTCGCGTTTCCTTTAG
TCGCGACTTCTCCGACGATTCCTCGCCTTCTTCCAACCTCGCCAGACCTATATCTAAGCCGAAGCCTGGCGCTGACCCGGCCAGGAAGTCCGAGATTCGAGATCCGGATC
CTGAACTGGTGCCGGTAAGCGAGTTCGAGTTCTGTCTTCAAGATCCTGTTGCCTTGATGCTTCCTGCGGATGAGCTGTTTTTGGATGGGAAACTCGTGCCGCTTCAGGTC
TCGTCTGTTAAACCCTCAGTCAATGGTTTGAAGTCGACGAGGTGCGTTTCGTCGCCGGAGACTGTGGTTCAAGCCCGCCGGAGAGTTGAGGACGAATGCAATACGGATCC
GTATCTGTTTTCTCCCAAGGCGCCGAGGTGTTCCAGTCGATGGAGAGAGCTTTTAGGGCTCAAGAAGCTGTACCAGAGCAGCAGCAATGGTAATAGCAATAGCAATGGCA
GCGCCAAAAACGAAAACCACAAAACAACGACGACGTCATCGTCGTCTTACTTCTCGGAAGCGAATTCGAAGGCGCTGAAGTATTTTCTCCACCGGAATTCGAAATCGTCG
TTAGCCTCTTCGTTCGATTCGTCGCTTAGCCTTCCATTGCTGAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCGCTATCTTCTTCCCGTGTGTCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGG
TCACGAACACGAAGATCTTCACAGACTCTCGCTCGATTGCGAAAATAAGCCAAACAAGAATCCGATCTCCCTCCATCGGAACCCTAACCACAACAATCCACCGCGGATGA
GACTGGTGAAACCGAGGCCTAAATCAGAGACCAATCCGAGATCAACTTCAACAGTGGATCATCATCCAACAGCGACGAGAGTAGGGAGAAGCCCGATGCGGCGCACACCT
GGAGATTCATCATCCAGTCGATTAGGAGGAATCCGAGGAGTATCCGTAGATAGTCCACGAATGAACTCGTCAGGAAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCAAG
CAGTCCGAGCACTTTCAATGGCGGACCAAAATTCAAAAACAGAGGAATGGAACGTTCATACTCGGCGAACGTGAGAGTAACTCCAGTCCTAAACGTTCCAGTTTGTTCTT
CCCTGAGAGGATCCTCAAAATCCGCATCTGTCTTCGGATTCGGACCATTATTCACCGGCACCGGCGGTAGAAGTCACCAGAGTAGTAGCAGCAGTAGTAGTACTAACCGG
ACGACAACAAGGCGTATCAACGAAACCGACGGCGGAGGGAAACTCCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCGCATGCGTTAACAGCGTCGGAATGTCGCCGGAGAATTTCCTTGACTGTTCTTCTGCTCCTTGCCATTCCTATGGCTGGCTCAGCCCTCGCGTTTCCTTTAG
TCGCGACTTCTCCGACGATTCCTCGCCTTCTTCCAACCTCGCCAGACCTATATCTAAGCCGAAGCCTGGCGCTGACCCGGCCAGGAAGTCCGAGATTCGAGATCCGGATC
CTGAACTGGTGCCGGTAAGCGAGTTCGAGTTCTGTCTTCAAGATCCTGTTGCCTTGATGCTTCCTGCGGATGAGCTGTTTTTGGATGGGAAACTCGTGCCGCTTCAGGTC
TCGTCTGTTAAACCCTCAGTCAATGGTTTGAAGTCGACGAGGTGCGTTTCGTCGCCGGAGACTGTGGTTCAAGCCCGCCGGAGAGTTGAGGACGAATGCAATACGGATCC
GTATCTGTTTTCTCCCAAGGCGCCGAGGTGTTCCAGTCGATGGAGAGAGCTTTTAGGGCTCAAGAAGCTGTACCAGAGCAGCAGCAATGGTAATAGCAATAGCAATGGCA
GCGCCAAAAACGAAAACCACAAAACAACGACGACGTCATCGTCGTCTTACTTCTCGGAAGCGAATTCGAAGGCGCTGAAGTATTTTCTCCACCGGAATTCGAAATCGTCG
TTAGCCTCTTCGTTCGATTCGTCGCTTAGCCTTCCATTGCTGAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCGCTATCTTCTTCCCGTGTGTCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGG
TCACGAACACGAAGATCTTCACAGACTCTCGCTCGATTGCGAAAATAAGCCAAACAAGAATCCGATCTCCCTCCATCGGAACCCTAACCACAACAATCCACCGCGGATGA
GACTGGTGAAACCGAGGCCTAAATCAGAGACCAATCCGAGATCAACTTCAACAGTGGATCATCATCCAACAGCGACGAGAGTAGGGAGAAGCCCGATGCGGCGCACACCT
GGAGATTCATCATCCAGTCGATTAGGAGGAATCCGAGGAGTATCCGTAGATAGTCCACGAATGAACTCGTCAGGAAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCAAG
CAGTCCGAGCACTTTCAATGGCGGACCAAAATTCAAAAACAGAGGAATGGAACGTTCATACTCGGCGAACGTGAGAGTAACTCCAGTCCTAAACGTTCCAGTTTGTTCTT
CCCTGAGAGGATCCTCAAAATCCGCATCTGTCTTCGGATTCGGACCATTATTCACCGGCACCGGCGGTAGAAGTCACCAGAGTAGTAGCAGCAGTAGTAGTACTAACCGG
ACGACAACAAGGCGTATCAACGAAACCGACGGCGGAGGGAAACTCCATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASACVNSVGMSPENFLDCSSAPCHSYGWLSPRVSFSRDFSDDSSPSSNLARPISKPKPGADPARKSEIRDPDPELVPVSEFEFCLQDPVALMLPADELFLDGKLVPLQV
SSVKPSVNGLKSTRCVSSPETVVQARRRVEDECNTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNSNSNGSAKNENHKTTTTSSSSYFSEANSKALKYFLHRNSKSS
LASSFDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNKNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKPRPKSETNPRSTSTVDHHPTATRVGRSPMRRTP
GDSSSSRLGGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSTFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGPLFTGTGGRSHQSSSSSSSTNR
TTTRRINETDGGGKLH