; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg11405 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11405
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTify domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr16:2730325..2731113
RNA-Seq ExpressionCarg11405
SyntenyCarg11405
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
GO:0031347 - regulation of defense response (biological process)
GO:2000022 - regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR010399 - Tify domain
IPR018467 - CO/COL/TOC1, conserved site
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577084.1 Protein TIFY 5A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-66100Show/hide
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XP_022984285.1 uncharacterized protein LOC111482635 [Cucurbita maxima]8.9e-6091.85Show/hide
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XP_023553224.1 protein TIFY 9-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.6e-6397.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXG2 Tify domain-containing protein3.9e-4577.27Show/hide
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A0A1S3BSH9 uncharacterized protein LOC1034930101.8e-4579.55Show/hide
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A0A5D3CWX6 Protein TIFY 5A-like1.8e-4579.55Show/hide
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A0A6J1ET94 uncharacterized protein LOC1114375142.6e-6598.45Show/hide
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A0A6J1J887 uncharacterized protein LOC1114826354.3e-6091.85Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30135.1 jasmonate-zim-domain protein 82.4e-1039.06Show/hide
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AT5G13220.1 jasmonate-zim-domain protein 109.6e-0431.03Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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