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Carg11568 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg11568
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTify domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr17:9780096..9780521
RNA-Seq ExpressionCarg11568
SyntenyCarg11568
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014624.1 Protein TIFY 9 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-36100Show/hide
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XP_022953183.1 protein TIFY 9-like isoform X2 [Cucurbita moschata]1.1e-36100Show/hide
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XP_022991838.1 protein TIFY 9-like isoform X1 [Cucurbita maxima]1.1e-36100Show/hide
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XP_023547597.1 protein TIFY 9-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-36100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K9H7 Tify domain-containing protein8.6e-3084.34Show/hide
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A0A6J1GMJ3 protein TIFY 9-like isoform X15.6e-37100Show/hide
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A0A6J1GMQ1 protein TIFY 9-like isoform X25.6e-37100Show/hide
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A0A6J1JVY1 protein TIFY 9-like isoform X25.6e-37100Show/hide
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A0A6J1JXF0 protein TIFY 9-like isoform X15.6e-37100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q93ZM9 Protein TIFY 93.6e-0944.16Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G13220.1 jasmonate-zim-domain protein 102.6e-1044.16Show/hide
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AT5G13220.2 jasmonate-zim-domain protein 102.6e-1044.16Show/hide
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AT5G13220.3 jasmonate-zim-domain protein 102.6e-1044.16Show/hide
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AT5G13220.4 jasmonate-zim-domain protein 102.6e-1044.16Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTAGGGCTACTGTCGAGCTTGATTTCTTCGGCCTCGAGAAGAAGGCCTCCTCCAGGTCTCAGTTCCACAACCTTCTTCACCGCAAGAGAAGCTTTCGAGGCATTCA
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TGCCTCTCTATAACCCTCTCTTCAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GTAA
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